[发明专利]SF3B1基因突变在泌乳素型垂体腺瘤辅助诊断中的应用在审

专利信息
申请号: 202010375205.3 申请日: 2020-05-05
公开(公告)号: CN113604562A 公开(公告)日: 2021-11-05
发明(设计)人: 李储忠;谢微嫣;郭靖;王红云;龚磊;李丹;张亚卓 申请(专利权)人: 北京市神经外科研究所
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12N15/11;G01N33/574
代理公司: 北京植德律师事务所 11780 代理人: 唐华东
地址: 100070 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: sf3b1 基因突变 泌乳素型 垂体 腺瘤 辅助 诊断 中的 应用
【权利要求书】:

1.检测SF3B1基因c.1874GA突变的产品在制备用于辅助诊断垂体腺瘤、区分SF3B1突变型和野生型垂体腺瘤、或预测垂体腺瘤是否恶性的试剂或试剂盒中的用途。

2.权利要求1所述的用途,其中,所述垂体腺瘤为泌乳素型垂体腺瘤;

优选地,所述泌乳素型垂体腺瘤是耐药型泌乳素型垂体腺瘤;

优选地,所述耐药为溴隐亭和/或卡麦角林的耐药。

3.权利要求1或2所述的用途,其中,所述产品包含通过PCR技术检测所述SF3B1基因c.1874GA突变的试剂;

优选地,所述产品包含PCR扩增反应试剂混合液、针对SF3B1基因c.1874GA突变的引物对以及突变型等位基因探针;优选地,所述PCR扩增反应试剂混合液包含TaqDNA聚合酶、dNTP混合液、MgCl2溶液、荧光定量PCR反应缓冲液和去离子水;

优选地,所述产品还包含野生型等位基因探针;

优选地,所述PCR为数字PCR或荧光定量PCR(qPCR)。

4.权利要求1-3中任一项所述的用途,其中,所述探针是TaqMan MGB探针,更优选地,所述TaqMan MGB探针的5'末端标记了荧光报告基团,3'末端标记了非荧光淬灭基团MGB;优选地,所述荧光报告基团是FAM或HEX荧光报告基团。

5.权利要求1-4中任一项所述的用途,其中,所述SF3B1基因的野生型基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;

优选地,所述引物对中的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,所述引物对中的反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示;

优选地,所述突变型等位基因探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示;优选地,所述野生型等位基因探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示。

6.权利要求1-6中任一项所述的用途,其中,所述突变型等位基因探针的结构如下:

HEX-5'-ATGTCCATAACACAAC-3'-MGB;

优选地,所述野生型等位基因探针的结构如下:

FAM-5'-AGTATGTCCGTAACACA-3'-MGB。

7.检测SF3B1蛋白R625H突变的产品在制备用于辅助诊断垂体腺瘤、区分SF3B1突变型和野生型垂体腺瘤、或预测垂体腺瘤是否恶性的试剂或试剂盒;

优选地,所述垂体腺瘤为泌乳素型垂体腺瘤。

8.权利要求7所述的用途,其中,所述产品包含抗体和/或蛋白质芯片;

优选地,所述SF3B1蛋白的野生型蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。

9.一种检测SF3B1基因c.1874GA突变的引物,其中,其包含正向引物和反向引物;所述正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,所述引物对中的反向引物的核苷酸序列如SEQID NO:4所示。

10.一种辅助诊断垂体腺瘤、区分SF3B1突变型和野生型垂体腺瘤、或预测垂体腺瘤是否恶性的试剂盒,所述试剂盒包含针对SF3B1基因c.1874GA突变的引物对以及突变型等位基因探针;和/或所述试剂盒包含检测SF3B1蛋白R625H突变的抗体和/或蛋白质芯片;

优选地,所述垂体腺瘤为泌乳素型垂体腺瘤;

优选地,所述试剂盒还包含PCR扩增反应试剂混合液;优选地,所述PCR扩增反应试剂混合液包含TaqDNA聚合酶、dNTP混合液、MgCl2溶液、荧光定量PCR反应缓冲液和去离子水;

优选地,所述试剂盒还包含野生型等位基因探针;

优选地,所述探针是TaqMan MGB探针,更优选地,所述TaqMan MGB探针的5'末端标记了荧光报告基团,3'末端标记了非荧光淬灭基团MGB;优选地,所述荧光报告基团是FAM或HEX荧光报告基团;

优选地,所述SF3B1基因的野生型基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;

优选地,所述引物对中的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,所述引物对中的反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示;

优选地,所述突变型等位基因探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示;优选地,所述野生型等位基因探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示;

优选地,所述突变型等位基因探针的结构如下:

HEX-5'-ATGTCCATAACACAAC-3'-MGB;

优选地,所述野生型等位基因探针的结构如下:

FAM-5'-AGTATGTCCGTAACACA-3'-MGB;

优选地,所述SF3B1蛋白的野生型蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。

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