[发明专利]SF3B1基因突变在泌乳素型垂体腺瘤辅助诊断中的应用在审
| 申请号: | 202010375205.3 | 申请日: | 2020-05-05 | 
| 公开(公告)号: | CN113604562A | 公开(公告)日: | 2021-11-05 | 
| 发明(设计)人: | 李储忠;谢微嫣;郭靖;王红云;龚磊;李丹;张亚卓 | 申请(专利权)人: | 北京市神经外科研究所 | 
| 主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11;G01N33/574 | 
| 代理公司: | 北京植德律师事务所 11780 | 代理人: | 唐华东 | 
| 地址: | 100070 北*** | 国省代码: | 北京;11 | 
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | sf3b1 基因突变 泌乳素型 垂体 腺瘤 辅助 诊断 中的 应用 | ||
1.检测SF3B1基因c.1874GA突变的产品在制备用于辅助诊断垂体腺瘤、区分SF3B1突变型和野生型垂体腺瘤、或预测垂体腺瘤是否恶性的试剂或试剂盒中的用途。
2.权利要求1所述的用途,其中,所述垂体腺瘤为泌乳素型垂体腺瘤;
优选地,所述泌乳素型垂体腺瘤是耐药型泌乳素型垂体腺瘤;
优选地,所述耐药为溴隐亭和/或卡麦角林的耐药。
3.权利要求1或2所述的用途,其中,所述产品包含通过PCR技术检测所述SF3B1基因c.1874GA突变的试剂;
优选地,所述产品包含PCR扩增反应试剂混合液、针对SF3B1基因c.1874GA突变的引物对以及突变型等位基因探针;优选地,所述PCR扩增反应试剂混合液包含TaqDNA聚合酶、dNTP混合液、MgCl2溶液、荧光定量PCR反应缓冲液和去离子水;
优选地,所述产品还包含野生型等位基因探针;
优选地,所述PCR为数字PCR或荧光定量PCR(qPCR)。
4.权利要求1-3中任一项所述的用途,其中,所述探针是TaqMan MGB探针,更优选地,所述TaqMan MGB探针的5'末端标记了荧光报告基团,3'末端标记了非荧光淬灭基团MGB;优选地,所述荧光报告基团是FAM或HEX荧光报告基团。
5.权利要求1-4中任一项所述的用途,其中,所述SF3B1基因的野生型基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;
优选地,所述引物对中的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,所述引物对中的反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示;
优选地,所述突变型等位基因探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示;优选地,所述野生型等位基因探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示。
6.权利要求1-6中任一项所述的用途,其中,所述突变型等位基因探针的结构如下:
HEX-5'-ATGTCCATAACACAAC-3'-MGB;
优选地,所述野生型等位基因探针的结构如下:
FAM-5'-AGTATGTCCGTAACACA-3'-MGB。
7.检测SF3B1蛋白R625H突变的产品在制备用于辅助诊断垂体腺瘤、区分SF3B1突变型和野生型垂体腺瘤、或预测垂体腺瘤是否恶性的试剂或试剂盒;
优选地,所述垂体腺瘤为泌乳素型垂体腺瘤。
8.权利要求7所述的用途,其中,所述产品包含抗体和/或蛋白质芯片;
优选地,所述SF3B1蛋白的野生型蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。
9.一种检测SF3B1基因c.1874GA突变的引物,其中,其包含正向引物和反向引物;所述正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,所述引物对中的反向引物的核苷酸序列如SEQID NO:4所示。
10.一种辅助诊断垂体腺瘤、区分SF3B1突变型和野生型垂体腺瘤、或预测垂体腺瘤是否恶性的试剂盒,所述试剂盒包含针对SF3B1基因c.1874GA突变的引物对以及突变型等位基因探针;和/或所述试剂盒包含检测SF3B1蛋白R625H突变的抗体和/或蛋白质芯片;
优选地,所述垂体腺瘤为泌乳素型垂体腺瘤;
优选地,所述试剂盒还包含PCR扩增反应试剂混合液;优选地,所述PCR扩增反应试剂混合液包含TaqDNA聚合酶、dNTP混合液、MgCl2溶液、荧光定量PCR反应缓冲液和去离子水;
优选地,所述试剂盒还包含野生型等位基因探针;
优选地,所述探针是TaqMan MGB探针,更优选地,所述TaqMan MGB探针的5'末端标记了荧光报告基团,3'末端标记了非荧光淬灭基团MGB;优选地,所述荧光报告基团是FAM或HEX荧光报告基团;
优选地,所述SF3B1基因的野生型基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;
优选地,所述引物对中的正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,所述引物对中的反向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示;
优选地,所述突变型等位基因探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示;优选地,所述野生型等位基因探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示;
优选地,所述突变型等位基因探针的结构如下:
HEX-5'-ATGTCCATAACACAAC-3'-MGB;
优选地,所述野生型等位基因探针的结构如下:
FAM-5'-AGTATGTCCGTAACACA-3'-MGB;
优选地,所述SF3B1蛋白的野生型蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。
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