[发明专利]一种与鸭喙色性状相关的分子标记及其应用

说明书

本发明属于生物技术领域，涉及一种与鸭喙色性状相关的分子标记及其应用；分子标记位于与鸭喙色性状相关的核苷酸序列SEQ ID NO.1上；分子标记具体为位于SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列的第23‑26位点的长度为4bp的插入/缺失序列，本发明还公开了其应用，包括以下步骤：采集待测鸭个体的生物检材，提取待测鸭个体生物检材的基因组DNA；以所提取基因组DNA为模板，设计特异性扩增引物，再以DNA为模板进行PCR扩增反应，获得PCR产物；将PCR产物电泳检测，然后测定基因序列，通过基因测序峰图判定鸭喙色对应的基因型；本发明的分子标签，可快速对粉色喙个体基因型进行鉴定，区分开粉色喙中纯合和杂合个体，通过选留基因型纯合个体，可保证该群体留种的后代全部为粉色喙个体。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体涉及一种与鸭喙色性状相关的分子标记及其应用。

背景技术

鸭喙色属于质量性状，是肉鸭重要的外观性状。在肉鸭育种中，可将鸭喙色性状作为一种品种外在特征标记，以实现品种间的甄别，以及在配套系中应用喙色性状的遗传规律实现对种源的控制。此外，喙色也是消费者选购肉鸭的考虑因素之一，黄色喙的肉鸭，由于喙色颜色鲜艳，往往受消费者的青睐。因此，研究和开发利用鸭喙色的遗传机制，具有重要的经济价值和生产意义。

鸭粉色喙相对黄喙为显性，如果建立粉色喙纯系群体，根据遗传规律，要实现全部个体在喙色基因位点的基因型为纯合基因型。根据常规表型选种，选择粉色个体留种，会混入部分杂合基因型个体，导致纯繁后代会分离出黄色喙表型个体。如果想选育出粉喙的纯系群体，以往需要通过详细的系谱资料和后裔测定，推测出基因型后，才能通过选留达成目的。

鸭喙色有多种类型，由不同的基因位点所决定。我们前期研究通过全基因组关联分析(GWAS)筛选到与鸭黄色喙和粉色喙相关的分子标记。经过分析，鸭粉色喙相对黄喙为显性，粉色喙个体的基因型为纯合或者杂合，而黄色喙个体的基因型为纯合。通过对鸭喙色分子标记的检测和应用，即可从分子水平快速、准确判断鸭黄色喙、粉色喙的基因型。

因此，从分子水平快速、准确判断鸭黄色喙、粉色喙的基因型的分子标记及其应用有待研究。

发明内容

针对上述问题，本发明旨在提供一种与鸭喙色性状相关的分子标记及其应用，本发明的分子标签，可快速对粉色喙个体基因型进行鉴定，区分开粉色喙中纯合和杂合个体，通过选留基因型纯合个体，可保证该群体留种的后代全部为粉色喙个体。

为了达到上述的目的，本发明所采用的技术方案是：

一种与鸭喙色性状相关的分子标记，所述分子标记位于与鸭喙色性状相关的核苷酸序列SEQ ID NO.1上；所述分子标记具体为位于SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列的第23-26位点的长度为4bp的插入/缺失序列，所述分子标记为插入序列时，该分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.2。

进一步的，SEQ ID NO.1的序列如下：

CCACTGAATTTAAATAAATAAGTAAGAAGTTTTTCTACCCGTAGTACAAAGGCT。

进一步的，SEQ ID NO.2的序列如下：TAAG。

进一步的，所述与鸭喙色性状相关的分子标记的应用，包括以下步骤：

(1)采集待测鸭个体的生物检材，提取待测鸭个体生物检材的基因组DNA；

(2)以所提取基因组DNA为模板，设计特异性扩增引物，再以步骤(1)的DNA为模板进行PCR扩增反应，获得PCR产物；

(3)将步骤(2)得到的PCR产物电泳检测，然后测定基因序列，通过基因测序序列和峰图判定鸭喙色基因型。