[发明专利]用于快速检测犬瘟热病毒的引物组、荧光可视化RT-LAMP试剂盒及方法在审
| 申请号: | 202010264904.0 | 申请日: | 2020-04-07 |
| 公开(公告)号: | CN111254226A | 公开(公告)日: | 2020-06-09 |
| 发明(设计)人: | 王林;张启龙;孙丹;吴迪;高晓龙;栗云鹏;程汝佳;韦海涛;宋彦军;周德刚;刘晓冬 | 申请(专利权)人: | 北京市动物疫病预防控制中心 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京智为时代知识产权代理事务所(普通合伙) 11498 | 代理人: | 王加岭;杨静 |
| 地址: | 102629 北京市*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 快速 检测 犬瘟热 病毒 引物 荧光 可视化 rt lamp 试剂盒 方法 | ||
1.一组用于快速检测犬瘟热病毒的引物组,其特征在于,其包括:
外引物F3:核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;
外引物B3:核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;
内引物FIP:核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;
内引物BIP:核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;
环引物LF:核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示;
环引物LB:核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示。
2.权利要求1所述的引物组在制备检测犬瘟热病毒的RT-LAMP试剂盒中的应用。
3.一种用于快速检测犬瘟热病毒的荧光可视化RT-LAMP试剂盒,,其特征在于,其包括如权利要求1中所述的外引物F3、外引物B3、内引物FIP、内引物BIP、环引物LF、环引物LB、荧光目视检测剂、含有Bst DNA聚合酶和逆转录酶的酶反应液。
4.根据权利要求3所述的荧光可视化RT-LAMP试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括2×反应缓冲液。
5.根据权利要求3所述的荧光可视化RT-LAMP试剂盒,其特征在于,所述试剂盒10×Thermopol buffer、50mmol/L MgSO4溶液、5.0mmol/L甜菜碱溶液和10mmol/L dNTPs。
6.根据权利要求3-5中任一项所述的荧光可视化RT-LAMP试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括阳性质控标准品和阴性质控标准品,所述阳性质控标准品为含有犬瘟热病毒N基因的重组质粒,所述犬瘟热病毒N基因的序列如SEQ ID NO.7所示,阴性质控标准品为无RNA酶蒸馏水。
7.一种用于检测犬瘟热病毒的方法,其特征在于,其包括如下步骤:
S1、从样品中提取RNA;
S2、对步骤S1提取的所述RNA进行等温扩增;其中,在反应体系中,采用如权利要求要求1所述的引物组,置于63℃恒温反应;
S3、结果判定:60分钟内呈现绿色为阳性,60分钟内呈现橘黄色为阴性。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,在步骤S2中,所述反应体系包括:
18μL的RT-LAMP预混液:2×反应缓冲液12.5μL、5μmol/L的外引物F3 1μL、5μmol/L的外引物B3 1μL、40μmol/L的内引物FIP 1μL、40μmol/L的内引物BIP 1μL、20μmol/L的环引物LF0.75μL、20μmol/L的环引物LB 0.75μL;
酶溶液1μL;
荧光目视检测试剂1μL;
和样品RNA 5μL。
9.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,在步骤S2中,所述反应体系包括:
17μL的RT-LAMP预混液:10×Thermopol buffer 2.5μL、50mmol/L MgSO4 3.5μL溶液、5.0mmol/L甜菜碱溶液2.5μL、10mmol/L dNTPs 3μL、5μmol/L的外引物F3 1μL、5μmol/L的外引物B3 1μL、40μmol/L的内引物FIP 1μL、40μmol/L的内引物BIP 1μL、20μmol/L的环引物LF0.75μL、20μmol/L的环引物LB 0.75μL;
8.0U/μL的Bst DNA聚合酶0.8μL和10U/μL AMV逆转录酶0.2μL;
10mmol/L MnCl2溶液1.5μL、1.0mmol/L的钙黄绿素溶液0.5μL;
和样品RNA 5μL。
10.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,在步骤S2中,设置阳性质控和阴性质控进行检测,其中,所述阳性质控为含有犬瘟热病毒N基因的质粒,所述犬瘟热病毒N基因的序列如SEQ ID NO.7所示,所述阴性质控为无RNA酶蒸馏水。
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