[发明专利]一种鉴定苦瓜品种真实性的方法及其专用SSR引物组合

说明书

本发明属于分子标记及其检测领域，具体涉及一种鉴定苦瓜品种真实性的方法及其专用SSR引物组合。鉴定苦瓜品种真实性的SSR位点，根据苦瓜的参考基因组Momordica charantia与36份种质资源全基因组重测序数据进行数据挖掘所获得；上述SSR引物组合选自：第一SSR引物对至第二十SSR引物对，分别用于PCR扩增上述第一SSR位点至第二十SSR位点，分别优选为与序列表中的SEQ ID NO：1‑40的核苷酸序列的同源性为85％‑100％的核苷酸序列。本发明可用于对苦瓜品种进行自种子开始的全生命周期的真实性鉴定，并为苦瓜种质资源和新品种保护提供技术支持。

技术领域

本发明属于分子标记及其检测领域，具体涉及一种鉴定苦瓜品种真实性的方法及其专用SSR引物组合。

背景技术

苦瓜是葫芦科苦瓜属植物，原产于东印度，广泛栽培于热带到温带地区，我国南北方均有栽培，是一种深受人民喜爱的瓜类蔬菜作物。

苦瓜在我国已经有悠久的栽培历史，由于其是世界性的蔬菜作物，在世界各国之间的苦瓜品种均由于人民对其风味与使用方式的不同，导致了不同国家和地区之间的苦瓜品种存在着一定的差异，其遗传多样性较为丰富。近年来随着育种技术的发展，各国都需要外来的种质资源进行本国的品种改良工作，故而引种驯化工作大规模展开，又因为不同国家地区之间的文化差异，导致引种驯化中产生了一定的同名异种与同种异名显现，这进一步导致了这些品种所选育或杂交出的后代亲缘关系不清，无法确定真实性等问题，进一步导致了种子市场的混乱。现阶段我们急需一种可以快速有效的鉴定苦瓜品种真实性的方法。

DUS测试是大部分农作物进行真实性鉴定的方法，其主要依靠表型性状的鉴定来判断品种的真实性。但是在现今的育种环境下，经常会发生亲缘关系很远(育种背景不同)，但是DUS鉴定结果一致的情况，这是由于DUS测试只鉴定表型性状，无法对其DNA进行检测，这就忽略了对遗传背景的考量，故而其鉴定结果并不能完全代表品种真实性。而现阶段已经有一部分作物开始推行基于SSR分子标记鉴定的真实性鉴定标准，SSR标记是一种稳定可靠的，基于DNA的鉴定技术，其成本相对较低，鉴定速度快，也是一种国际上公认的分子鉴定技术。但是，现有技术中还没有利用SSR标记进行苦瓜品种真实性鉴定的方法的报到。

发明内容

本发明提供了一种鉴定苦瓜品种真实性的方法及其专用SSR引物组合，可以得出稳定、高效的鉴定结果：待测苦瓜品种是否属于标准苦瓜品种中的某一种，以及具体是哪一种。

本发明是通过以下的技术方案实现的：