[发明专利]用于检测黄热病毒疫苗株的RT-LAMP试剂盒及其专用引物和应用有效
申请号: | 202010194593.5 | 申请日: | 2020-03-19 |
公开(公告)号: | CN111424116B | 公开(公告)日: | 2023-06-23 |
发明(设计)人: | 袁静;蒋栋;刘翟;陈晨;闫超;薛冠华;马莉萍;曾辉 | 申请(专利权)人: | 首都儿科研究所;中国科学院武汉病毒研究所;首都医科大学附属北京地坛医院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 北京尚诚知识产权代理有限公司 11322 | 代理人: | 叶占洋;鲁兵 |
地址: | 100020*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 黄热病 疫苗 rt lamp 试剂盒 及其 专用 引物 应用 | ||
1.一种用于检测黄热病毒疫苗株的RT-LAMP试剂盒,其特征在于,包含用于检测黄热病毒疫苗株的RT-LAMP引物组,其为序列表中SEQ ID NO:2所示的引物F3、SEQ ID NO:3所示的引物B3、SEQ ID NO:4所示的引物FIP、SEQ ID NO:5所示的引物BIP、SEQ ID NO:6所示的引物LF和SEQ ID NO:7所示的引物LB;
所述RT-LAMP引物组在25μL反应体系中的使用浓度为:引物F3和B3的终浓度独立地为2~8pmol,引物FIP和BIP的终浓度独立地为24~36pmol,引物LF和LB的终浓度独立地为10~16pmol;
所述RT-LAMP试剂盒中还包含基础反应试剂,所述基础反应试剂包括:10×ThermopolReaction Buffer、100mM MgSO4、5mM betaine、10mM dNTP、8U Bst DNA polymerase和7.5UWarmStart RTx reverse transcriptase;所述基础反应试剂在25μL反应体系中的使用量分别为:10×Thermopol Reaction Buffer 2.5μl、100mM MgSO4 1.5μl、5mM betaine4μl、10mM dNTP3.5μl,Bst DNA polymerase 1μl,WarmStart RTx reverse transcriptase0.5μl;
所述反应体系在进行恒温扩增反应时,控制反应温度为63℃-65℃。
2.根据权利要求1所述的RT-LAMP试剂盒,其特征在于,所述引物F3和B3的终浓度独立地为4pmol,引物FIP和BIP的终浓度独立地为32pmol,引物LF和LB的终浓度独立地为12pmol。
3.根据权利要求1或2所述的RT-LAMP试剂盒,其特征在于,所述RT-LAMP试剂盒还包含阳性对照和阴性对照,所述阳性对照包含黄热病毒疫苗株基因组RNA,所述阴性对照为不含黄热病毒疫苗株基因组RNA的反应体系。
4.一种采用权利要求1-3中任一项所述的RT-LAMP试剂盒检测黄热病毒疫苗株的非疾病诊断目的方法,包括以下步骤:
S1:提取待测样品RNA;
S2:反应体系配制:25μL反应体系包含2μL待测样品RNA、10×Thermopol ReactionBuffer2.5μl、100mM MgSO4 1.5μl、5mM betaine 4μl、10mM dNTP 3.5μl,8U Bst DNApolymerase 1μl,7.5U WarmStart RTx reverse transcriptase 0.5μl,引物加入量为:100μM FIP/BIP引物各0.8μl,100μM LF/LB引物各0.3μl,100μM F3/B3所示引物各0.1μl,ddH2O补至25μl;
S3:将反应体系置63℃-65℃条件下恒温扩增反应45-60min,获得反应液;
S4:结果分析:使用钙黄绿素颜色指示剂或浊度仪对所述反应液进行检测分析。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,步骤S3中将反应体系置65℃条件下恒温扩增反应50min。
6.根据权利要求4或5所述的方法,其特征在于,步骤S4中所述结果分析的具体方法为:当使用钙黄绿素颜色指示剂进行检测时,在反应液中添加1μl的钙黄绿素颜色指示剂,呈现绿色表示待测样品中存在黄热病毒疫苗株,为阳性,呈现橙色表示待测样品中不存在黄热病毒疫苗株,为阴性;
当使用浊度仪进行检测时,浊度上升(0.1)表示待测样品中存在黄热病毒疫苗株,为阳性,浊度无变化表示待测样品中不存在黄热病毒疫苗株,为阴性。
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