[发明专利]一种用于基因测序的细胞组织核酸提取方法在审

专利信息
申请号: 202010187946.9 申请日: 2020-03-17
公开(公告)号: CN111349629A 公开(公告)日: 2020-06-30
发明(设计)人: 雍金贵;施荣辉 申请(专利权)人: 通用生物系统(安徽)有限公司
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12Q1/6806
代理公司: 合肥正则元起专利代理事务所(普通合伙) 34160 代理人: 杨润
地址: 239000 安徽*** 国省代码: 安徽;34
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 基因 细胞 组织 核酸 提取 方法
【说明书】:

发明公开了一种用于基因测序的细胞组织核酸提取方法,具体步骤如下:S1、取动物组织于离心管中,加入STE缓冲液,使用涡旋振荡器,混合,得溶液一;S2、向溶液一中加入十二烷基磺酸钠溶液和蛋白酶K,放入翻转离心装置,混匀,得溶液二;S3、将离心管冷却至室温,先向溶液二中加入Tris‑饱和酚、氯仿和异戊醇的混合溶液,经翻转摇匀、离心,得溶液三;S4、将溶液三中的上清液转移至另一离心管中,加入冰无水乙醇,析出团状物后用移液枪吸入干净的离心管中,用75%乙醇洗涤两次,晾干后即得纯化后的核酸;通过使用本发明提供的翻转离心装置,可以方便对离心管进行竖直方向的旋转,也可以对离心管进行水平方向的旋转,达到对样品摇匀、离心的效果。

技术领域

本发明涉及核酸纯化技术领域,具体涉及一种用于基因测序的细胞组织核酸提取方法。

背景技术

基因测序使用的DNA和RNA样品常常依赖于获得纯化的核酸样品。DNA或RNA的来源众多,如组织、细胞、全血、血浆、血清、提取物,其可以获自生物体(例如,人、动物、植物、细菌、病毒等),核酸的纯化通常需要分离DNA或RNA与样品源中的其他组分,以使多核酸不含其他细胞酶、蛋白质、化合物和/或碎片。

最早的纯化DNA或RNA的技术之一是使用例如蛋白酶K裂解细胞或组织样品,向裂解物中添加等体积的苯酚氯仿溶液来提取非核酸物质(例如,蛋白质、细胞器等),并移出含有核酸的水相以供进一步使用。通常通过用乙醇或异丙醇沉淀从水相回收核酸。该技术的改良包括进一步向有机相添加少量的异戊醇以助于RNases失活。虽然苯酚氯仿提取可以获得高纯度和高回收率核酸,但是该方法仍有缺点,如操作过程中需要对核酸样品进行反复离心和翻转混合,目前没有一种可供两种用途的装置来实现此操作。

发明内容

本发明的目的在于提供一种用于基因测序的细胞组织核酸提取方法,通过酚氯仿提取核酸的方法,可以对核酸进行有效纯化;通过使用本发明提供的翻转离心装置,可以方便对离心管进行竖直方向的旋转,使离心管中的样品充分混合均匀,也可以对离心管进行水平方向的旋转,达到离心的效果。

本发明的目的可以通过以下技术方案实现:

一种用于基因测序的细胞组织核酸提取方法,具体步骤如下:

S1、取动物组织于离心管中,加入STE缓冲液,使用涡旋振荡器,混合0.5-2h,使组织细胞与STE缓冲液充分混合,得溶液一,每克动物组织加入8-12mLSTE缓冲液;

S2、向溶液一中加入10%的十二烷基磺酸钠溶液和10mg/μL的蛋白酶K,用封口膜封口,放入翻转离心装置的离心管槽中,盖上固定盖,并用锁紧杆锁紧固定盖,启动电热丝和风扇,升温至35-50℃,启动第二电机,翻转离心管5-10h,得溶液二;

S3、将离心管冷却至室温,先向溶液二中加入Tris-饱和酚,置于翻转离心装置中,启动第二电机,翻转摇匀0.5-1h,再加入氯仿和异戊醇的混合溶液,继续翻转摇匀0.5-1h,然后关闭第二电机,启动第一电机离心15~30min,得溶液三;

S4、将溶液三中的上清液转移至另一离心管中,加入-20~-10℃的无水乙醇,静置15~30min,析出团状物后用移液枪吸入干净的离心管中,用75%乙醇洗涤两次,即得纯化后的核酸。

酚是强蛋白质变性剂,能有效使动物组织内的蛋白质变性而除去,氯仿有强烈的脂溶性,能够去除动物组织内的脂类杂质,酚与水有较大的互溶性,如果单独使用酚对蛋白质进行抽提,抽提后会有大量的酚溶解到水相中,在后续操作中酚会抑制很多酶反应,而将酚与氯仿混合使用,则会大大减少酚的残留量;加入异戊醇,可以降低界面之间的表面张力,从而可以减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡,另外,异戊醇有助于离心后混合溶液的分相;十二烷基磺酸钠溶液能够溶解细胞膜上的脂类与蛋白质,从而破坏细胞膜,并解离细胞中的核蛋白,而且十二烷基磺酸钠还能与蛋白质结合而沉淀,从而达到分离蛋白质的作用;蛋白酶K能水解消化蛋白质,特别是与DNA结合的组蛋白,从而达到去除蛋白质的作用。

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