[发明专利]第552位点发生突变的SPNS2突变基因及其检测方法

说明书

本发明提供了一种人SPNS2基因的g.[552insTTGA]突变形式，突变所在片段序列如SEQ ID NO：1所示。SPNS2基因发生g.[552insTTGA]突变的南方男性T‑LBL患者具有高的复发转移风险，且突变基因含量越高，则复发转移风险越高。可以采用5’‑AACGTGCTCAACTACCTGGA‑3’和5’‑ACAACGGATGGGCCGTCAA‑3’引物对发生g.[552insTTGA]突变的SPNS2突变基因片段进行PCR扩增和突变检测。本发明提供的SPNS2基因的g.[552insTTGA]突变将有助于南方男性T‑LBL患者复发转移风险的预测，因此可以制定相应的个体化方案及早进行干预和治疗；同时也有助于南方男性T‑LBL复发转移机制的探究。

技术领域

本发明涉及医学分子生物学领域，具体涉及发生g.[552insTTGA]突变和g.[571insTGCTATA]突变的SPNS2突变基因以及突变基因的检测方法。

背景技术

T细胞性淋巴母细胞淋巴瘤（T-lmphoblastic lymphoma,T-LBL）和T细胞性急性淋巴细胞白血病（T-Acute lymphoblastic leukemia,T-ALL）均是起源于不成熟前体T淋巴细胞的恶性肿瘤，并且它们在临床表现和预后等疾病表征以及相关生物学特征（包括细胞形态学、免疫表型、基因型和细胞遗传学等）上十分相似，因此2008版WHO诊断标准将T-LBL与T-ALL划分为同一类疾病，其癌细胞常侵犯纵隔、骨髓、中枢神经系统和淋巴结，其中骨髓原始及幼稚淋巴细胞含量≥25%即诊断为T-ALL，而25%或骨髓未受累则诊断为T-LBL。T-LBL在临床确诊时通常已经是III或IV期的进展期表现了，其病程短，进展迅速，预后差，病程早期易发生骨髓侵犯，并易转化为T-ALL；治疗原则上以化疗为主，加局部放射治疗。T-LBL/T-ALL占所有LBL/ALL的85%～90%，多发于儿童和青少年，男性多于女性，预后较B-LBL/B-ALL差，该病起病隐匿，易早期广泛转移，超过90%的患儿就诊时已处于肿瘤的中晚期，高危儿童以及大部分成人患者预后很差，此外对标准治疗无应答或复发的患者预后极差，死亡率高；肿瘤细胞易侵犯脊髓及中枢神经系统，对于患者的身体健康和生命造成了很大的损害和威胁。

包括T-LBL/T-ALL在内的肿瘤在本质上是一种基因病，特定基因异常导致了肿瘤的发生发展，因此揭示肿瘤中的体细胞基因突变对于解析其发生发展从而指导临床诊治具有重大意义。目前已经从T-LBL/T-ALL癌灶组织中检测出了多种基因突变，然而这些突变在T-LBL/T-ALL发生发展过程中发挥的作用以及具体的机制尚未完全明晰，另外一方面由于T-LBL/T-ALL的异质性和复杂性以及患者种群的多样性，更多新的特征突变还在逐步被揭示中。虽然如此，由于肿瘤患者的临床表现和发展很大程度上取决于肿瘤的发展变化，而特定的肿瘤基因突变尤其是驱动基因等关键基因上的突变对于肿瘤的发展变化起着关键作用，因此特定基因突变可以做为肿瘤的临床分子标志物，其中一个重要应用就是用于包括复发转移在内的预后判断。了解基因突变在肿瘤预后中的意义，将有助于从分子本质上对肿瘤的危险度进行分层和评估，从而对不同危险度的肿瘤患者给予个体化治疗，可以提高对肿瘤的诊治并帮助改善患者的预后，符合精准医疗的理念。