[发明专利]CDH17基因中与鸡蛋蛋壳品质性状相关的单倍型标记与应用

权利要求书

1.一种CDH17基因中与鸡蛋蛋壳品质性状相关的单倍型标记，其特征在于，所述的单倍型标记位于位于蛋鸡CDH17基因部分编码区序列中，所述的单倍型标记的核苷酸序列如SEQID NO：1所示，该序列长度为1254bp，所述单倍型标记包括4个SNP位点：

SNP1位点：在SEQ ID NO.1所示序列中第198bp处存在T/C多态性位；

SNP2位点：在SEQ ID NO.1所示序列中第218bp处存在G/A多态性位点；

SNP3位点：在SEQ ID NO.1所示序列中第239bp处存在A/G多态性位点；

SNP4位点：在SEQ ID NO.1所示序列中第261bp处存在C/A多态性位点。

2.如权利要求1所述的单倍型标记，其特征在于，所述序列中的第198bp、218bp、239bp和261bp处的优势等位基因分别是T、G、A、C；优势基因型分别为TT、GG、AA和CC。

3.一种用于扩增权利要求1-2任一所述单倍型标记的引物对，其特征在于，所述引物对包括：上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。

4.一种与鸡蛋蛋壳品质性状相关的CDH17基因SNP的检测试剂盒，其特征在于，包括权利要求3所述的引物对。

5.如权利要求4所述的检测试剂盒，其特征在于，所述检测试剂盒还包括10×buffer、dNTPs、TaqDNA聚合酶；或者所述检测试剂盒还包括PCRmix。

6.一种鸡CDH17基因蛋壳品质性状相关SNP的检测方法，其特征在于，采用权利要求3所述的引物对、或者权利要求4所述的检测试剂盒进行检测。

7.一种单倍型组合的构建方法，其特征在于，首先采用权利要求6所述的方法检测出所述4个SNP位点；然后构建出七种单倍型，H1：TGAC，H2：TGAA，H3：TGGC，H4：TAAC，H5：TAGC，H6：CAGC，H7：CAGA；再根据所述单倍型构建的单倍型组合并与鸡蛋蛋壳品质表型相关联，单倍型组合H1H1、H2H2蛋壳强度和蛋壳厚度最高。

8.一种包含权利要求1所述的单倍型标记的单倍型组合，其特征在于，所述单倍型组合为包含所述4个SNP位点的组合，具体为TGAC/TGAC或者TGAA/TGAA，所述两种单倍型组合具有最高的蛋壳强度和蛋壳厚度。

9.权利要求1-2任一所述的单倍型标记、权利要求4所述的检测试剂盒、权利要求8所述的单倍型组合在鸡蛋蛋壳品质性状标记辅助选择中的应用。

10.一种筛选鸡蛋蛋壳品质的方法，其特征在于，测定权利要求1所述的4个SNP位点，根据单倍型组合预测蛋壳强度和蛋壳厚度的高低，单倍型组合为TGAC/TGAC具有最高的蛋壳强度和蛋壳厚度。