[发明专利]一种病毒蛋白的快速酶解与检测方法在审

专利信息
申请号: 202010145555.0 申请日: 2020-03-04
公开(公告)号: CN111505177A 公开(公告)日: 2020-08-07
发明(设计)人: 胡金波;王静;邓林涛 申请(专利权)人: 上海元金生物科技有限公司
主分类号: G01N30/06 分类号: G01N30/06;G01N30/88
代理公司: 上海微策知识产权代理事务所(普通合伙) 31333 代理人: 汤俊明
地址: 201600 上海*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 病毒 蛋白 快速 检测 方法
【说明书】:

本申请属于病毒蛋白检测技术领域,具体涉及一种病毒蛋白的快速酶解与检测方法。本发明提供了一种病毒蛋白的快速酶解与检测方法,包括以下步骤:1)将体外表达的病毒蛋白样本溶于盐酸中,震荡混匀;2)超声处理;3)向超声后的样品中加入与步骤1)等体积的盐酸,震荡混匀;4)孵育;5)将孵育后的样品超声,然后在12000‑15000rpm离心5‑10分钟;6)取上清液置于超滤管中真空抽滤,将滤液冻干后进行检测;7)将检测结果与数据库进行比对得蛋白鉴定结果。本方法通过胃蛋白酶和buffer搭配,达到了灭活和酶解的效果。通过蛋白质水平进行病毒鉴定,样本量极其少,避免大量培养和繁殖细胞,极大降低了病毒感染给科研人员的风险,而且节约了培养细胞的时间和成本。

技术领域

本申请属于病毒蛋白检测技术领域,具体涉及一种病毒蛋白的快速酶解与检测方法。

背景技术

通过质谱对生物系统中蛋白进行定性定量,已经成为一种主流的分析工具。基于质谱的蛋白组研究通常依赖于蛋白被消化成肽段,然后进行后续的定性定量分析。因此蛋白的酶解对于后续质谱实验至关重要,也是最耗时的一个实验。质谱的结果与样本类型,裂解条件,酶解消化和分馏方法等等密切相关。实验室最常见的溶液酶切手段是FASP(filter-aidedsample preparation),当然还有最传统的In-solution(溶液内)酶切的方法。每一种酶切方法各有优劣,in-solution法比较费时,成本相对小,但是鉴定蛋白数目少且重复性较差。FASP方法虽然十分高效,但是实验步骤较多,需要较长时间,并且还需要承担过滤的费用成本,且不同的裂解配方(SDS和8M尿素)所鉴定的蛋白不同。最后,这两种方法都是针对大量蛋白,利用胰蛋白酶的酶解的方法。而针对微量蛋白的酶解和质谱鉴定,目前没有一个比较快速且高效的方法。

针对目前对微量蛋白样品,特别是病毒量级的蛋白样品的检测和鉴定,没有一个比较完善的方法,兼顾样品本身的生物学特性和质量、体积极微量的特点。FASP和in-solution的酶解只适用于大量蛋白的酶解,且花费时间较长。

发明内容

为了解决上述技术问题,本发明提供了一种病毒蛋白的快速酶解与检测方法,包括以下步骤:1)将体外表达的病毒蛋白样本溶于盐酸中,震荡混匀;2)超声处理;3)向超声后的样品中加入与步骤1)等体积的盐酸,震荡混匀;4)孵育;5)将孵育后的样品超声,然后在12000-15000rpm离心5-10分钟;6)取上清液置于超滤管中真空抽滤,将滤液冻干后进行检测;7)将检测结果与数据库进行比对得蛋白鉴定结果,其中,所述步骤1)中,盐酸中含0.01-0.03mg/mL胃蛋白酶。

作为一种优选的技术方案,步骤1)中病毒蛋白样本与盐酸的比例为1:(190-210)pg/μL。

作为一种优选的技术方案,所述盐酸的浓度为18-22mM。

作为一种优选的技术方案,步骤2)中超声2-4次,每次8-12秒。

作为一种优选的技术方案,步骤2)中超声3次,每次10秒。

作为一种优选的技术方案,所述步骤3)中的盐酸浓度和步骤1)中相同。

作为一种优选的技术方案,在37℃培养箱或金属浴孵育1小时。

作为一种优选的技术方案,步骤5)中将孵育后的样品超声8-12s,然后在12000-15000rpm离心5-10分钟。

作为一种优选的技术方案,在14000rpm离心5-10分钟。

作为一种优选的技术方案,步骤6)中取上清液置于10kd超滤管中真空抽滤,将滤液冻干后进行LC-MS/MS检测。

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