[发明专利]一种基于SNP标记评估母猪泌乳力的方法在审
申请号: | 202010093285.3 | 申请日: | 2020-02-14 |
公开(公告)号: | CN112941197A | 公开(公告)日: | 2021-06-11 |
发明(设计)人: | 唐中林;陈云;易国强;杨亚岚 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院深圳农业基因组研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 北京康思博达知识产权代理事务所(普通合伙) 11426 | 代理人: | 刘冬梅;范国锋 |
地址: | 518000 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 snp 标记 评估 母猪 泌乳力 方法 | ||
本发明公开了一种基于SNP标记评估母猪泌乳力的方法,所述方法通过鉴定位于国际猪基因组10.2版本参考序列Chromosome1:16,077,935处SNP位点的基因型,来筛选21天断奶仔猪个体重和窝重高的猪个体,其中,所述国际猪基因组10.2版本参考序列Chromosome1:16,077,935处的SNP位点的基因型为TT的猪,相较于基因型为TC和CC的猪有更高的21天断奶仔猪个体重和窝重,采用本发明所述的方法,可以增加优良猪种的选育速度,加快猪分子育种的步伐,同时提高了猪群的经济效益与社会价值。
技术领域
本发明属于分子生物学技术领域,具体涉及与母猪泌乳力相关的分子标记及基于分子标记评估母猪泌乳力的方法,尤其涉及基于SNP标记评估断奶仔猪个体重和窝重等泌乳力指标的方法。
背景技术
猪为六畜之首,生猪养殖业在世界尤其是我国国民经济中占重要地位,猪繁殖性状是生产中较为重要的经济性状类别之一。利用现代育种技术针对猪繁殖性状进行有效选育,将对于提高养猪业的整体效益有着十分重要的作用。
猪的繁殖性状包括窝产仔数、初生重、21日龄窝重、断奶仔猪数和产仔间隔等。繁殖性状遗传力均较低,传统选育效果不好,需要利用标记辅助选择提高选种准确性,并加快遗传进展。我国是一个养猪大国,且蕴藏各具特点的优良地方品种,因此,开展持续且高效的遗传改良来保持猪种的优良品质并加以改良十分迫切。
单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性,是由单个SNP的置换、颠换、缺失或插入所引起的遗传变异现象。SNP是第三代分子遗传标记,据统计,人类基因组中每1,000个核苷酸就有一个SNP,人类30亿碱基中共有300万以上的SNPs。SNP在分子遗传学、药物遗传学、人类疾病诊断和治疗、法医学和基因组学等理论研究方面也扮演着重要角色,具有很大的发展潜力。
现有技术中,科学家已经对猪繁殖性状相关基因及SNP标记做了很多研究。例如,李凤娥和陈克飞等研究了ESR基因中不同SNP位点和基因型对产仔数的影响;赵要风等对促卵泡素β亚基基因(FSHβ)的SNP与产仔数进行关联分析,证明该基因座位在约克夏、长白和杜洛克等商品猪中与产仔数紧密连锁。但是,目前对于与猪断奶仔猪个体重和窝重相关的基因以及标志性SNP研究报道较少。因此,我们需要对相关性状进行深入研究,在分子水平上探索影响断奶仔猪体重和窝重的遗传机制,这对于全面而深入揭示母猪繁殖性能具有重要的理论意义和实践意义。
发明内容
为了克服上述问题,本发明人进行了锐意研究,提供了一种基于SNP标记评估母猪泌乳力的方法,所述方法通过鉴定位于国际猪基因组10.2版本参考序列Chromosome1:16,077,935处SNP位点的基因型,来筛选21天断奶仔猪个体重和窝重高的猪个体,以增加优良猪种的选育速度,加快猪分子育种的步伐,提高猪群的经济效益和社会价值,从而完成了本发明。
具体来说,本发明的目的在于提供一种基于SNP标记评估母猪泌乳力的方法,其中,所述方法包括以下步骤:
步骤1,获得与母猪泌乳力相关的SNP标记及其基因型;
步骤2,提取待测母猪的基因组DNA;
步骤3,检测待测母猪相关SNP标记的基因型;
步骤4,根据基因型评估待测母猪的泌乳力。
其中,与母猪泌乳力相关的指标为21天断奶仔猪个体重和窝重。
其中,所述与母猪泌乳力相关的SNP标记位于ENSSSCG00000004081基因上。
其中,所述与母猪泌乳力相关的SNP标记位于国际猪基因组10.2版本参考序列Chromosome1:16,077,935处,具有T/C多态性。
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