[发明专利]适于米粉专用稻筛选的SNP功能分子标记及其应用

权利要求书

1.水稻Wx^g2基因的SNP功能分子标记，其特征在于，该SNP为T/C多态，Wx^g2基因为T基因型，T/C多态位点位于Wx基因第10外显子第115碱基处。

2.水稻Alk^lASV基因的SNP功能分子标记，其特征在于，该SNP为GC/TT多态，Alk^lASV基因为GC基因型，GC/TT多态位点位于Alk基因第8外显子第864、865碱基处。

3.扩增权利要求1所述水稻Wx^g2基因的SNP功能分子标记的引物组，其特征在于，由引物对Wx-P_T和引物对Wx-P_C组成；其中，引物对Wx-P_T和引物对Wx-P_C的前引物为通用前引物Wx-F10，其核苷酸序列为SEQ ID No.1所示；引物对Wx-P_T的后引物的核苷酸序列为SEQ IDNo.2所示；引物对Wx-P_C的后引物的核苷酸序列为SEQ ID No.3所示。

4.扩增权利要求2所述水稻Alk^lASV基因的SNP功能分子标记的引物组，其特征在于，由引物对Alk-P_GC和引物对Alk-P_TT组成；其中，引物对Alk-P_GC和引物对Alk-P_TT的后引物为通用后引物Alk-R，其核苷酸序列为SEQ ID No.6所示；引物对Alk-P_GC的前引物的核苷酸序列为SEQID No.4所示；引物对Alk-P_TT的前引物的核苷酸序列为SEQ ID No.5所示。

5.权利要求1或2所述的SNP功能分子标记在选育米粉稻新品系中的应用，或权利要求3或4所述的引物组在选育米粉稻新品系中的应用。

6.按照权利要求5所述的应用，其特征在于，所述米粉稻新品系是同时携带有Wx^g2和Alk^lASV双纯合基因的水稻新品系。

7.应用权利要求3所述的引物组检测水稻中是否含有Wx^g2基因以及Wx^g2基因是纯合还是杂合的方法，其特征在于，包括：

(1)以待测水稻材料的基因组DNA为模板，用权利要求3所述的引物组进行PCR扩增；

(2)Wx^g2基因SNP功能分子标记扩增产物的鉴定：如引物对Wx-P_T扩增产物产生条带，引物对Wx-P_C扩增产物不产生条带，则待测水稻含有Wx^g2基因，且Wx^g2基因型为纯合；如引物对Wx-P_T扩增产物不产生条带，引物对Wx-P_C扩增产物产生条带，则待测水稻不含有Wx^g2基因；如引物对Wx-P_T和Wx-P_C扩增产物均产生条带，则待测水稻含有Wx^g2基因，Wx^g2的基因型为杂合。

8.按照权利要求7所述的应用，其特征在于：Wx-P_T和Wx-P_C引物对的扩增产物长度分别为140bp和135bp。