[发明专利]同时检测甘蔗花叶病3种病原的一步法多重RT-PCR检测方法在审
申请号: | 202010007660.8 | 申请日: | 2020-01-05 |
公开(公告)号: | CN110951924A | 公开(公告)日: | 2020-04-03 |
发明(设计)人: | 单红丽;黄应昆;王晓燕;李婕;张荣跃;仓晓燕;尹炯;罗志明 | 申请(专利权)人: | 云南省农业科学院甘蔗研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 云南凌云律师事务所 53207 | 代理人: | 康珉 |
地址: | 661699 云南省红河*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 同时 检测 甘蔗 花叶病 病原 一步法 多重 rt pcr 方法 | ||
1.同时检测甘蔗花叶病3种病原的一步法多重RT-PCR检测方法,3种甘蔗花叶病病原为甘蔗线条花叶病毒、高粱花叶病毒、甘蔗花叶病毒,其特征在于:
所述一步法多重RT-PCR检测方法中采用甘蔗线条花叶病毒引物检测甘蔗线条花叶病毒,所述甘蔗线条花叶病毒引物由SCSMV上游引物和SCSMV下游引物组成,目的片段长度为800bp,SCSMV上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,SCSMV下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;高粱花叶病毒引物检测高粱花叶病毒,所述高粱花叶病毒引物由SrMV上游引物和SrMV下游引物组成,目的片段长度为450bp,SrMV上游引物的核苷酸序列如SEQ IDNO:3所示,SrMV下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示;甘蔗花叶病毒引物检测甘蔗花叶病毒,所述甘蔗花叶病毒引物由SCMV上游引物和SCMV下游引物组成,目的片段长度为200bp,SCMV上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示,SCMV下游引物的核苷酸序列如SEQID NO:6所示;
检测结果判定为:
当检测样品扩增到800bp大小的单一条带时,该样品为甘蔗线条花叶病毒阳性;若无800bp条带,则为甘蔗线条花叶病毒阴性;
当检测样品扩增到450bp大小的单一条带时,该样品为高粱花叶病毒阳性;若无450bp条带,则为高粱花叶病毒阴性;
当检测样品扩增到200bp大小的单一条带时,该样品为甘蔗花叶病毒阳性;若无200bp条带,则为甘蔗花叶病毒阴性;
当检测样品同时扩增到上述三条条带、或同时扩增到上述任意两条条带,则该样品感染了对应的病毒。
2.根据权利要求1所述的一步法多重RT-PCR检测方法,其特征在于:20μL一步法多重RT-PCR反应体系中有灭菌ddH2O 8.4μL,2×1Step Buffer 8.0μL,5U/μL PrimeScript 1Step Enzyme Mix 0.8μL,20μmoL/L SCSMV上、下游引物各0.25μL,20μmol/L SrMV上、下游引物各0.4μL,20μmol/L SCMV上、下游引物各0.25μL,RNA模板1.0μL;一步法多重RT-PCR反应条件为:50℃反转录30min,94℃预变性5min;然后94℃变性30s,62℃退火30s,72℃延伸1min,共35个循环;最后72℃延伸10min,降温至12℃结束反应。
3.采用一步法多重RT-PCR检测方法同时检测甘蔗花叶病3种病原的特异性引物组,其特征在于:由甘蔗线条花叶病毒引物、高粱花叶病毒引物和甘蔗花叶病毒引物组成,甘蔗线条花叶病毒引物用于检测甘蔗线条花叶病毒,所述甘蔗线条花叶病毒引物由SCSMV上游引物和SCSMV下游引物组成,目的片段长度为800bp,SCSMV上游引物的核苷酸序列如SEQ IDNO:1所示,SCSMV下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;高粱花叶病毒引物用于检测高粱花叶病毒,所述高粱花叶病毒引物由SrMV上游引物和SrMV下游引物组成,目的片段长度为450bp,SrMV上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,SrMV下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示;甘蔗花叶病毒引物用于检测甘蔗花叶病毒,所述甘蔗花叶病毒引物由SCMV上游引物和SCMV下游引物组成,目的片段长度为200bp,SCMV上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示,SCMV下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示。
4.一种同时检测甘蔗花叶病3种病原的一步法多重RT-PCR检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求3所述的采用一步法多重RT-PCR检测方法同时检测甘蔗花叶病3种病原的特异性引物组,所述甘蔗花叶病3种病原为甘蔗线条花叶病毒、高粱花叶病毒、甘蔗花叶病毒。
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