[发明专利]评价方法、评价程序和评价装置在审

专利信息
申请号: 201980096262.3 申请日: 2019-05-13
公开(公告)号: CN113811949A 公开(公告)日: 2021-12-17
发明(设计)人: 片冈正弘;松村量;茂栉薰 申请(专利权)人: 富士通株式会社
主分类号: G16B30/10 分类号: G16B30/10
代理公司: 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 代理人: 康晓宇
地址: 日本神*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 评价 方法 程序 装置
【权利要求书】:

1.一种评价方法,其特征在于,计算机执行如下处理:

取得碱基序列数据,

通过使所取得的所述碱基序列数据中所含的多个碱基的所述碱基序列数据上的位置移位而生成新的碱基序列数据,

确定通过将所生成的所述新的碱基序列数据中所含的多个碱基从所述新的碱基序列数据上的基准位置以规定规则划分而生成的多个部分碱基序列中的包含推测产生了基因变异的碱基的部分碱基序列,

根据所确定的所述部分碱基序列以及所述多个部分碱基序列中的与所确定的所述部分碱基序列具有规定的位置关系的部分碱基序列的排列在通过将规定的碱基序列数据中所含的多个碱基从所述规定的碱基序列数据上的所述基准位置以所述规定规则划分而生成的多个部分碱基序列中出现的出现状况,进行与所取得的所述碱基序列数据相关的评价。

2.根据权利要求1所述的评价方法,其特征在于,生成所述新的碱基序列数据的处理通过在与所取得的所述碱基序列数据上的所述基准位置的部分碱基序列连续的部分碱基序列插入碱基而生成所述新的碱基序列数据。

3.根据权利要求1所述的评价方法,其特征在于,生成所述新的碱基序列数据的处理通过使与所取得的所述碱基序列数据上的所述基准位置的部分碱基序列连续的部分碱基序列的碱基缺失而生成所述新的碱基序列数据。

4.根据权利要求1、2或3所述的评价方法,其特征在于,确定所述多个部分碱基序列的处理确定通过从所述新的碱基序列数据上的基准位置以密码子单位划分而生成的多个部分碱基序列中的包含推测产生了基因变异的密码子的部分碱基序列。

5.根据权利要求1、2或3所述的评价方法,其特征在于,确定所述多个部分碱基序列的处理确定通过从所述新的碱基序列数据上的基准位置以蛋白质单位划分而生成的多个部分碱基序列中的包含推测产生了基因变异的蛋白质的部分碱基序列。

6.根据权利要求1、2或3所述的评价方法,其特征在于,所述进行评价的处理将所述排列与通过将规定的碱基序列数据中所含的多个碱基从所述规定的碱基序列数据上的所述基准位置以所述规定规则划分而生成的多个部分碱基序列进行比较来评价连续且一致的部分碱基序列的数量。

7.一种评价程序,其特征在于,使计算机执行如下处理:

取得碱基序列数据,

通过使所取得的所述碱基序列数据中所含的多个碱基的所述碱基序列数据上的位置移位而生成新的碱基序列数据,

确定通过将所生成的所述新的碱基序列数据中所含的多个碱基从所述新的碱基序列数据上的基准位置以规定规则划分而生成的多个部分碱基序列中的包含推测产生了基因变异的碱基的部分碱基序列,

根据所确定的所述部分碱基序列以及所述多个部分碱基序列中的与所确定的所述部分碱基序列具有规定的位置关系的部分碱基序列的排列在通过将规定的碱基序列数据中所含的多个碱基从所述规定的碱基序列数据上的所述基准位置以所述规定规则划分而生成的多个部分碱基序列中出现的出现状况,进行与所取得的所述碱基序列数据相关的评价。

8.根据权利要求7所述的评价程序,其特征在于,生成所述新的碱基序列数据的处理通过在与所取得的所述碱基序列数据上的所述基准位置的部分碱基序列连续的部分碱基序列插入碱基而生成所述新的碱基序列数据。

9.根据权利要求7所述的评价程序,其特征在于,生成所述新的碱基序列数据的处理通过使与所取得的所述碱基序列数据上的所述基准位置的部分碱基序列连续的部分碱基序列的碱基缺失而生成所述新的碱基序列数据。

10.根据权利要求7、8或9所述的评价程序,其特征在于,确定所述多个部分碱基序列的处理确定通过从所述新的碱基序列数据上的基准位置以密码子单位划分而生成的多个部分碱基序列中的包含推测产生了基因变异的密码子的部分碱基序列。

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