[发明专利]碱基识别方法、系统和测序系统

权利要求书

1.一种碱基识别方法，其特征在于，包括：

将对应测序模板的亮斑集合中的亮斑的坐标对应到待检图像上，以确定所述待检图像的相应坐标位置；

确定所述待检图像的相应坐标位置的强度；

比较所述待检图像的相应坐标位置的强度与预设阈值的大小，基于所述待检图像上强度大于预设阈值的位置的信息进行所述碱基识别；

所述对应测序模板的亮斑集合基于多个图像构建获得，所述图像和所述待检图像均采集自碱基延伸反应，所述图像和所述待检图像对应相同的视野，碱基延伸反应时的该视野中存在多个带有光学可检测标记的核酸分子，至少一部分所述核酸分子在所述图像和/或所述待检图像上表现为亮斑。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，一个所述预设阈值对应一个或多个所述待检图像。

3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述待检图像的相应坐标位置的强度为相对强度，依据该相应坐标位置的绝对强度和该相应坐标位置所在区域的背景强度确定所述相对强度。

4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，确定所述相应坐标位置所在区域的背景强度，包括：

依据像素值对所述相应坐标位置所在的x1*y1区域的像素点进行排序，以获得该x1*y1区域的像素点的数目的分布曲线，x1和y1均为自然数，x1*y1不小于100；

基于所述分布曲线确定所述相应坐标位置所在区域的背景强度。

5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述排序为升序排序，以所述分布曲线的波峰像素值作为所述相应坐标位置所在区域的背景强度，利用公式I_block＝I_j1+(I_j2-I_j3)×t1估算所述分布曲线的波峰像素值，其中，

I_j1、I_j2、I_j3分别为第j1百分位数、第j2百分位数和第j3百分位数对应的像素值，j1、j2和j3均为小于50且不小于1的整数，j28+j3，t1为第一修正系数，t1取值通过j1、j2和j3确定。

6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，j1选自[1,40]，j2选自[6,40]，j3选自[1,30]，40j1+(j2-j3)×t150。

7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述预设阈值选自[0.85,0.95]。

8.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，一个所述预设阈值对应一个所述待检图像的相应坐标位置。

9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于，所述待检图像的相应坐标位置的强度为绝对强度。

10.根据权利要求9所述的方法，其特征在于，确定所述预设阈值，包括：

依据像素值对所述相应坐标位置所在的x2*y2区域的像素点进行排序，以获得该x2*y2区域的像素点的数目的分布曲线，x2和y2均为自然数，x2*y2不小于100；

基于所述分布曲线确定所述预设阈值。

11.根据权利要求10所述的方法，其特征在于，所述排序为升序排序，以所述分布曲线的右侧波谷像素值作为所述预设阈值，利用公式Threshold＝I_j4+(I_j5-I_j6)×t2估算所述右侧波谷像素值，其中，

I_j4、I_j5、I_j6分别为第j4百分位数、第j5百分位数和第j6百分位数对应的像素值，j4、j5和j6均为小于50且不小于1的整数，j58+j6，t2为第二修正系数，t2的取值通过j4、j5和j6确定。