[发明专利]用于多核苷酸测序的组合物在审
申请号: | 201980042751.0 | 申请日: | 2019-12-09 |
公开(公告)号: | CN112639125A | 公开(公告)日: | 2021-04-09 |
发明(设计)人: | P.加蒂-拉夫兰科尼;H.桑索姆;M.汉科克 | 申请(专利权)人: | 伊卢米纳剑桥有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869 |
代理公司: | 北京市柳沈律师事务所 11105 | 代理人: | 张文辉 |
地址: | 英国*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 多核苷酸 组合 | ||
1.多核苷酸测序方法,其包括:
(a)将封闭的、标记的核苷酸掺入与模板多核苷酸链的至少一部分互补的拷贝多核苷酸链中;
(b)在存在第一缓冲液组合物的情况下检测所述封闭的、标记的核苷酸的身份;
(c)从掺入所述拷贝链中的所述封闭的、标记的核苷酸以化学方式去除标记物和封闭部分;
(d)用包含所述第一缓冲液组合物的洗涤溶液将所述以化学方式去除的标记物和封闭部分从所述拷贝链洗去,
其中所述第一缓冲液组合物包含抗氧化剂和清除剂化合物。
2.权利要求1的方法,其进一步包括重复步骤(a)至(d),直到确定所述模板多核苷酸链的部分的序列。
3.权利要求1或2的方法,其中所述清除剂化合物包含二硫化物部分或叠氮化物部分。
4.权利要求3的方法,其中所述清除剂化合物包含二硫化物部分。
5.权利要求3的方法,其中所述清除剂化合物是硫辛酸或3,3’-二硫代二丙酸(DDPA)。
6.权利要求1至5中任一项的方法,其中从掺入拷贝多核苷酸链中的所述封闭的、标记的核苷酸去除所述标记物和所述封闭部分包括使所述拷贝链与三(羟甲基)膦接触。
7.权利要求1至6中任一项的方法,其中所述第一缓冲液组合物包含选自由抗坏血酸盐、香草乙酮和6-羟基-2,5,7,8-四甲基苯并二氢吡喃-2-羧酸组成的组的抗氧化剂。
8.权利要求1至7中任一项的方法,其中所述模板多核苷酸链附接至固体支持物。
9.权利要求8的方法,其中所述模板多核苷酸附接至流动池。
10.与测序装置一起使用的盒(cartridge),所述盒包含含有多个组合物的多个室,其中每个室含有单一组合物,其中所述组合物由以下组成:
(a)用于将封闭的、标记的核苷酸掺入与模板多核苷酸链的至少一部分互补的拷贝多核苷酸链中的试剂;
(b)包含抗氧化剂和清除剂的缓冲液组合物;
(c)用于从所述掺入拷贝链中的封闭的、标记的核苷酸以化学方式去除标记物和封闭部分的试剂;和
(d)洗涤缓冲液。
11.与测序装置一起使用的试剂盒,所述试剂盒包含含有多个组合物的多个室,其中每个室含有单一组合物,其中所述组合物由以下组成:
(a)用于将封闭的、标记的核苷酸掺入与模板多核苷酸链的至少一部分互补的拷贝多核苷酸链中的试剂;
(b)包含抗氧化剂和清除剂的缓冲液组合物;
(c)用于从所述掺入拷贝链中的封闭的、标记的核苷酸以化学方式去除标记物和封闭部分的试剂;和
(d)洗涤缓冲液。
12.权利要求10的盒或权利要求12的试剂盒,其中所述清除剂包含二硫化物部分。
13.权利要求10的盒或权利要求11的试剂盒,其中所述清除剂是硫辛酸或3,3’-二硫代二丙酸(DDPA)。
14.多核苷酸测序方法,其包括:
从掺入与模板多核苷酸链的至少一部分互补的拷贝多核苷酸链中的封闭的、标记的核苷酸去除标记物和封闭部分;和
用包含3,3’-二硫代二丙酸(DDPA)的洗涤溶液将所述去除的标记物和封闭部分从所述拷贝链洗去。
15.权利要求14的方法,其进一步包括:
在以化学方式去除所述封闭的、标记的核苷酸之前,检测掺入所述拷贝链中的所述封闭的、标记的核苷酸的身份,
其中检测所述封闭的、标记的核苷酸的身份在存在所述第一缓冲液组合物的情况下进行。
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