[发明专利]用具有新颖引物组的LAMP测定检测草坪草中真菌的方法在审
申请号: | 201980011873.3 | 申请日: | 2019-02-05 |
公开(公告)号: | CN111684081A | 公开(公告)日: | 2020-09-18 |
发明(设计)人: | M·帕尔米萨诺;C·沃勒 | 申请(专利权)人: | 先正达参股股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895 |
代理公司: | 中国贸促会专利商标事务所有限公司 11038 | 代理人: | 傅宇昌 |
地址: | 瑞士*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用具 新颖 引物 lamp 测定 检测 草坪 真菌 方法 | ||
1.一种用环介导等温扩增(LAMP)测定来检测草坪草样品中真菌DNA的方法,该测定含有用于至少一种草坪病原性真菌的真菌DNA的引物,这些草坪病原性真菌选自:币斑病核盘菌、立枯丝核菌物种、瓜果腐霉菌、禾顶囊壳菌物种、雪霉叶枯菌物种、夏季斑枯病菌、禾生炭疽菌、谷物炭疽菌和终极腐霉菌终极变种,该方法包括:
使草坪样品经受LAMP反应,其中该LAMP反应使用四个或更多个核酸序列的引物组,该组中的每个引物具有15个到50个核酸,并且其中引物的组包含至少一个选自以下的引物组:
(a)用于检测币斑病核盘菌DNA的引物组,该币斑病核盘菌DNA包含或选自各自分别具有与SEQ ID NO:14、15、16和17至少90%同一的序列的引物;
(b)用于检测立枯丝核菌DNA的引物组,该引物组包含或选自各自分别具有与SEQ IDNO:20、21、22和23至少90%同一的序列的引物,或包含或选自各自分别具有与SEQ ID NO:62、63、66和67至少90%同一的序列的引物;
(c)用于检测雪霉叶枯菌雪霉变种DNA的引物组,该引物组包含或选自各自分别具有与SEQ ID NO:26、27、28和29至少90%同一的序列的引物;
(d)用于检测瓜果腐霉菌DNA的引物组,该引物组包含或选自各自分别具有与SEQ IDNO:32、33、36和37至少90%同一的序列的引物;
(e)用于检测禾顶囊壳菌燕麦变种DNA的引物组,该引物组包含或选自各自分别具有与SEQ ID NO:38、39、42和43至少90%同一的序列的引物;
(f)用于检测雪霉叶枯菌大孢变种DNA的引物组,该引物组包含或选自各自分别具有与SEQ ID NO:44、45、48和49至少90%同一的序列的引物;
(g)用于检测夏季斑枯病菌DNA的引物组,该引物组包含或选自各自分别具有与SEQ IDNO:50、51、54和55至少90%同一的序列的引物;
(h)用于检测禾生炭疽菌DNA的引物组,该引物组包含或选自各自分别具有与SEQ IDNO:74 75、78和79至少90%同一的序列的引物;
(i)用于检测谷物炭疽菌DNA的引物组,该引物组包含或选自各自分别具有与SEQ IDNO:80、81、84和85至少90%同一的序列的引物;以及
(j)用于检测终极腐霉菌终极变种DNA的引物组,该引物组包含或选自各自分别具有与SEQ ID NO:86、87、90和91至少90%同一的序列的引物。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,该用于检测币斑病核盘菌DNA的引物组包含或选自各自分别具有与SEQ ID NO:14、15、16、17、18和19至少90%同一的序列的引物。
3.根据权利要求1所述的方法,其中,该用于检测立枯丝核菌DNA的引物组包含或选自各自分别具有与SEQ ID NO:62、63、64、65、66和67至少90%同一的序列的引物。
4.根据权利要求1所述的方法,其中,该用于检测立枯丝核菌DNA的引物组包含或选自各自分别具有与SEQ ID NO:20、21、22、23、24和25至少90%同一的序列的引物。
5.根据权利要求1所述的方法,其中,该用于检测雪霉叶枯菌雪霉变种DNA的引物组包含或选自各自分别具有与SEQ ID NO:26、27、28、29、30和31至少90%同一的序列的引物。
6.根据权利要求1所述的方法,其中,该用于检测瓜果腐霉菌DNA的引物组包含或选自各自分别具有与SEQ ID NO:32、33、34、35、36和37至少90%同一的序列的引物。
7.根据权利要求1所述的方法,其中,该用于检测瓜果腐霉菌DNA的引物组包含或选自各自分别具有与SEQ ID NO:68、69、70、71、72和73至少90%同一的序列的引物。
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