[发明专利]用于分析解离解链曲线数据的方法在审
申请号: | 201980009862.1 | 申请日: | 2019-01-22 |
公开(公告)号: | CN111868256A | 公开(公告)日: | 2020-10-30 |
发明(设计)人: | B·德克雷内;K·德坎尼埃;J·范德威尔德 | 申请(专利权)人: | 比奥卡尔齐斯股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844 |
代理公司: | 中国贸促会专利商标事务所有限公司 11038 | 代理人: | 张小勇 |
地址: | 比利时*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 分析 解离 解链 曲线 数据 方法 | ||
1.一种用于分析来自测试样品的核酸的解链曲线原始数据的方法,所述方法包括以下步骤:
-从核酸产生解链曲线原始数据;
-对原始数据执行离散小波转换以产生离散小波转换系数,还被称为dwt系数;
-执行dwt系数的分析;
并基于分析结果对测试样品进行分类。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述解链曲线原始数据是从具有一个或多个SNP的核酸或具有长度变化优选为插入或缺失的核酸获得的。
3.根据权利要求1至2所述的方法,其中所述解链曲线原始数据是从具有微小的微卫星变化的核酸获得的,所述核酸优选为具有均聚物重复序列变化的核酸。
4.根据权利要求1至3所述的方法,其中所述核酸是扩增的核酸。
5.根据权利要求1至4所述的方法,其中所述解链曲线原始数据是通过在染料标记的核酸优选染料标记的信标探针的存在下使扩增的核酸解离而产生的。
6.根据权利要求1至5所述的方法,其中从核酸产生解链曲线原始数据的步骤之后是对原始数据执行数据归约以生成原始数据的选集的步骤,并且其中对原始数据的选集执行离散小波转换。
7.根据权利要求1至6所述的方法,其中执行dwt系数的分析的步骤包括选择被鉴定为最相关的那些dwt系数,以及执行所选择的dwt系数的分析。
8.根据权利要求1至7所述的方法,其中所述离散小波转换是一维小波转换。
9.根据权利要求1至8所述的方法,其中所述离散小波转换使用来自Daubechies家族的母小波,优选是DB8小波。
10.根据权利要求1至9所述的方法,其中所述分类是基因分型记录和基因分型的一种或多种视觉展示。
11.根据前述权利要求中的任一项所述的方法,其中在自动化系统中执行以下步骤:
-从核酸产生解链曲线原始数据;
-任选地,对原始数据执行数据归约以生成原始数据的选集;
-对原始数据或原始数据的选集执行离散小波转换以产生离散小波转换系数,其还被称为dwt系数;
-执行dwt系数的分析,
其中执行dwt系数的分析任选包括选择被鉴定为最相关的那些dwt系数,并执行所选择的dwt系数的分析;和
-基于分析结果对测试样品进行分类。
12.根据权利要求7至10所述的方法,其中所述方法是计算机实现的方法。
13.一种数据处理设备,其包括用于执行根据权利要求12所述的计算机实现的方法的装置。
14.一种包括指令的计算机程序,当所述程序由计算机执行时,所述指令使所述计算机执行根据权利要求12所述的计算机实现的方法。
15.一种包括指令的计算机可读介质,在由计算机执行时所述指令使所述计算机执行根据权利要求12所述的计算机实现的方法。
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