[发明专利]lncRNA SOX2-OT的筛选方法及其应用

权利要求书

1.肺炎衣原体感染标记物lncRNA SOX2-OT的筛选方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)提取肺炎衣原体感染阳性和阴性的癌组织和癌旁组织中总RNA；

(2)比较肺炎衣原体感染阳性的癌组织、癌旁组织和肺炎衣原体感染阴性的癌组织和癌旁组织之间的lncRNA的表达差异，筛选与肺炎衣原体感染阳性肺癌患者特异相关的lncRNAs；

(3)利用TCGA数据库肺癌患者的RNA测序数据中差异表达的lncRNA对步骤(2)所述lncRNAs进行验证，进行生存分析，筛选出在肺癌患者中高频表达且与肺炎衣原体感染的肺癌患者预后相关lncRNAs；

(4)采用实时荧光定量PCR检测检测步骤(3)筛选出来的所述lncRNAs在肺炎衣原体感染阳性、肺炎衣原体感染阴性的癌组织及癌旁组织中的表达水平，通过Kaplan-Meier生存曲线及COX比例风险回归模型分析步骤(3)筛选出来的所述lncRNAs的表达量与肺炎衣原体感染总生存和无病生存的关系，得肺炎衣原体感染标记物lncRNA SOX2-OT。

2.根据权利要求1所述筛选方法，其特征在于，在步骤(1)中，采用微量免疫荧光实验检测原发性肺癌患者血清中肺炎衣原体的特异性抗体IgG和IgA，待检标本出现中度到强烈的苹果绿荧光显色为肺炎衣原体感染阳性，出现无荧光显色或黑暗背景为肺炎衣原体感染阴性。

3.根据权利要求1所述筛选方法，其特征在于，在步骤(2)中，利用lncRNA基因芯片技术和GeneSpring GX软件分别比较肺炎衣原体感染阳性的癌组织、癌旁组织和肺炎衣原体感染阴性的癌组织和癌旁组织之间的lncRNA的表达差异。

4.利用权利要求1～3任一项所述筛选方法筛选得到的lncRNA SOX2-OT在制备肺癌预后预测试剂中的应用，其特征在于，所述lncRNA SOX2-OT的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。

5.根据权利要求4所述应用，其特征在于，所述肺癌由肺炎衣原体感染引起。

6.一种检测权利要求4所述应用中lncRNA SOX2-OT的引物对，其特征在于，所述引物对包括SOX2-OT-F和SOX2-OT-R，所述SOX2-OT-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，所述SOX2-OT-R的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。

7.一种肺癌预后预测试剂的试剂盒，其特征在于，包括利用权利要求1～3任一项所述筛选方法筛选得到的lncRNA SOX2-OT。