[发明专利]一种用于东亚西番莲病毒全基因组测定的成套引物对及其应用

权利要求书

1.成套引物对，其由引物对1-引物对7组成；

所述引物对1由EAPV-S1-F和EAPV-S1-R组成；

所述引物对2由EAPV-S2-F和EAPV-S2-R组成；

所述引物对3由EAPV-S3-F和EAPV-S3-R组成；

所述引物对4由EAPV-S4-F和EAPV-S4-R组成；

所述引物对5由EAPV-S5-F和EAPV-S5-R组成；

所述引物对6由EAPV-S6-F和EAPV-S6-R组成；

所述引物对7由EAPV-S7-F和EAPV-S7-R组成；

所述EAPV-S1-F为序列表中序列1所示的单链DNA分子；

所述EAPV-S1-R为序列表中序列2所示的单链DNA分子；

所述EAPV-S2-F为序列表中序列3所示的单链DNA分子；

所述EAPV-S2-R为序列表中序列4所示的单链DNA分子；

所述EAPV-S3-F为序列表中序列5所示的单链DNA分子；

所述EAPV-S3-R为序列表中序列6所示的单链DNA分子；

所述EAPV-S4-F为序列表中序列7所示的单链DNA分子；

所述EAPV-S4-R为序列表中序列8所示的单链DNA分子；

所述EAPV-S5-F为序列表中序列9所示的单链DNA分子；

所述EAPV-S5-R为序列表中序列10所示的单链DNA分子；

所述EAPV-S6-F为序列表中序列11所示的单链DNA分子；

所述EAPV-S6-R为序列表中序列12所示的单链DNA分子；

所述EAPV-S7-F为序列表中序列13所示的单链DNA分子；

所述EAPV-S7-R为序列表中序列14所示的单链DNA分子。

2.权利要求1所述的成套引物对在如下M1)-M12)任一中的应用：

M1)制备克隆和/或测序东亚西番莲病毒全基因组的产品；

M2)克隆和/或测序东亚西番莲病毒全基因组；

M3)制备获得东亚西番莲病毒全基因组序列的产品；

M4)获得东亚西番莲病毒全基因组序列；

M5)制备东亚西番莲病毒的检测和/或鉴定的产品；

M6)东亚西番莲病毒的检测和/或鉴定；

M7)制备检测或辅助检测待测病毒是否为东亚西番莲病毒的产品；

M8)检测或辅助检测待测病毒是否为东亚西番莲病毒；

M9)制备检测或辅助检测待测样品是否感染或携带东亚西番莲病毒的产品；

M10)检测或辅助检测待测样品是否感染或携带东亚西番莲病毒；

M11)制备东亚西番莲病毒的进化分析和/或分子流行病学研究的产品；

M12)东亚西番莲病毒的进化分析和/或分子流行病学研究。

3.含有权利要求1所述的成套引物对的试剂盒；

所述试剂盒的功能为如下N1)-N6)中任一种：

N1)克隆和/或测序东亚西番莲病毒全基因组；

N2)获得东亚西番莲病毒全基因组序列；

N3)东亚西番莲病毒的检测和/或鉴定；

N4)检测或辅助检测待测病毒是否为东亚西番莲病毒；

N5)检测或辅助检测待测样品是否感染或携带东亚西番莲病毒；

N6)东亚西番莲病毒的进化分析和/或分子流行病学研究。

4.一种获得东亚西番莲病毒全基因组序列的方法，包括如下步骤：

P1)以东亚西番莲病毒或感染东亚西番莲病毒的样品的cDNA为模板，分别采用权利要求1中所述的引物对1、引物对2、引物对3、引物对4、引物对5、引物对6和引物对7进行PCR扩增，分别得到扩增产物1、扩增产物2、扩增产物3、扩增产物4、扩增产物5、扩增产物6和扩增产物7；

P2)对所述P1)获得的各个扩增产物进行测序，分别得到扩增产物1序列、扩增产物2序列、扩增产物3序列、扩增产物4序列、扩增产物5序列、扩增产物6序列和扩增产物7序列，并将所述扩增产物1序列、所述扩增产物2序列、所述扩增产物3序列、所述扩增产物4序列、所述扩增产物5序列、所述扩增产物6序列和所述扩增产物7序列进行比对分析和拼接，获得所述东亚西番莲病毒全基因组序列。