[发明专利]山羊ZBP1基因第一内含子内与产羔数关联的单倍型标记及其应用有效
| 申请号: | 201911266436.4 | 申请日: | 2019-12-11 |
| 公开(公告)号: | CN110923333B | 公开(公告)日: | 2020-09-29 |
| 发明(设计)人: | 陶虎;陈明新;张年;杨娟;熊琪;李晓锋;索效军;杨前平;刘洋;田宏;张鹤山;熊军波;张凤 | 申请(专利权)人: | 湖北省农业科学院畜牧兽医研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司: | 武汉智嘉联合知识产权代理事务所(普通合伙) 42231 | 代理人: | 易贤卫 |
| 地址: | 430064 湖北省*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 山羊 zbp1 基因 第一 内含 产羔数 关联 单倍型 标记 及其 应用 | ||
1.一种山羊ZBP1基因第一内含子内与总体产羔数关联的单倍型标记,其特征在于,所述山羊为波尔山羊、黑头羊和麻城黑山羊中任一种;
所述的单倍型标记位于山羊ZBP1基因第一内含子的部分DNA序列中,所述单倍型标记的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示,该序列长度为2522bp;所述单倍型标记包括:
ZBP1 g.352CT位点的分子标记:其在SEQ ID NO.1所示序列中第249bp处存在一处CT碱基突变,其序列如SEQ ID NO.2所示;
ZBP1 g.955CT位点的分子标记:其在SEQ ID NO.1所示序列中第852bp处存在一处CT碱基突变,其序列如SEQ ID NO.3所示;
ZBP1 g.1880GA位点的分子标记:其在SEQ ID NO.1所示序列中第1777bp处存在一处GA碱基突变,其序列如SEQ ID NO.4所示;
ZBP1 g.2566TC位点的分子标记:其在SEQ ID NO.1所示序列中第2463bp处存在一处TC碱基突变,其序列如SEQ ID NO.5所示。
2.如权利要求1所述的单倍型标记,其特征在于,所述序列SEQ ID NO.1的第249bp处的C或T的碱基多态性位点,表现为CC、CT或TT三种基因型,其中C为优势等位基因。
3.如权利要求1所述的单倍型标记,其特征在于,所述序列SEQ ID NO.1的第852bp处的C或T的碱基多态性位点,表现为CC、CT或TT三种基因型,其中C为优势等位基因。
4.如权利要求1所述的单倍型标记,其特征在于,所述序列SEQ ID NO.1的第1777bp处的G或A的碱基多态性位点,表现为GG、GA或AA三种基因型,其中G为优势等位基因。
5.如权利要求1所述的单倍型标记,其特征在于,所述序列SEQ ID NO.1的第2463bp处的C或T的碱基多态性位点,表现为CC、CT或TT三种基因型,其中T为优势等位基因。
6.权利要求1-5任一所述的单倍型标记在波尔山羊、黑头羊和麻城黑山羊的总体产羔数性状标记辅助选择中的应用,其特征在于,所述ZBP1 g.352CT位点在波尔山羊群体中,CC基因型的总产羔数显著高于CT基因型,在黑头羊群体中,CC基因型和TT基因型的总产羔数极显著高于CT基因型,即所述ZBP1g.352CT位点在波尔山羊和黑头羊群体中与总产羔数显著相关;
所述ZBP1 g.955CT位点在波尔山羊群体中,TT基因型的总产羔数显著高于CC基因型,即所述ZBP1 g.955CT位点在波尔山羊群体中与总产羔数显著相关;
所述ZBP1 g.1880GA位点在波尔山羊群体中,AA基因型和GA基因型的总产羔数显著高于GG基因型,即所述ZBP1 g.1880GA位点在波尔山羊群体中与总产羔数显著相关;
所述ZBP1 g.2566TC位点在波尔山羊群体中,TT基因型的总产羔数显著高于CT基因型,在麻城黑山羊群体中,CC基因型的总产羔数显著高于TT基因型,即所述ZBP1 g.2566TC位点在波尔山羊和麻城黑山羊群体中与总产羔数显著相关。
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