[发明专利]山羊ZBP1基因第一内含子内与产羔数关联的单倍型标记及其应用有效

专利信息
申请号: 201911266436.4 申请日: 2019-12-11
公开(公告)号: CN110923333B 公开(公告)日: 2020-09-29
发明(设计)人: 陶虎;陈明新;张年;杨娟;熊琪;李晓锋;索效军;杨前平;刘洋;田宏;张鹤山;熊军波;张凤 申请(专利权)人: 湖北省农业科学院畜牧兽医研究所
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 武汉智嘉联合知识产权代理事务所(普通合伙) 42231 代理人: 易贤卫
地址: 430064 湖北省*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 山羊 zbp1 基因 第一 内含 产羔数 关联 单倍型 标记 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种山羊ZBP1基因第一内含子内与总体产羔数关联的单倍型标记,其特征在于,所述山羊为波尔山羊、黑头羊和麻城黑山羊中任一种;

所述的单倍型标记位于山羊ZBP1基因第一内含子的部分DNA序列中,所述单倍型标记的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示,该序列长度为2522bp;所述单倍型标记包括:

ZBP1 g.352CT位点的分子标记:其在SEQ ID NO.1所示序列中第249bp处存在一处CT碱基突变,其序列如SEQ ID NO.2所示;

ZBP1 g.955CT位点的分子标记:其在SEQ ID NO.1所示序列中第852bp处存在一处CT碱基突变,其序列如SEQ ID NO.3所示;

ZBP1 g.1880GA位点的分子标记:其在SEQ ID NO.1所示序列中第1777bp处存在一处GA碱基突变,其序列如SEQ ID NO.4所示;

ZBP1 g.2566TC位点的分子标记:其在SEQ ID NO.1所示序列中第2463bp处存在一处TC碱基突变,其序列如SEQ ID NO.5所示。

2.如权利要求1所述的单倍型标记,其特征在于,所述序列SEQ ID NO.1的第249bp处的C或T的碱基多态性位点,表现为CC、CT或TT三种基因型,其中C为优势等位基因。

3.如权利要求1所述的单倍型标记,其特征在于,所述序列SEQ ID NO.1的第852bp处的C或T的碱基多态性位点,表现为CC、CT或TT三种基因型,其中C为优势等位基因。

4.如权利要求1所述的单倍型标记,其特征在于,所述序列SEQ ID NO.1的第1777bp处的G或A的碱基多态性位点,表现为GG、GA或AA三种基因型,其中G为优势等位基因。

5.如权利要求1所述的单倍型标记,其特征在于,所述序列SEQ ID NO.1的第2463bp处的C或T的碱基多态性位点,表现为CC、CT或TT三种基因型,其中T为优势等位基因。

6.权利要求1-5任一所述的单倍型标记在波尔山羊、黑头羊和麻城黑山羊的总体产羔数性状标记辅助选择中的应用,其特征在于,所述ZBP1 g.352CT位点在波尔山羊群体中,CC基因型的总产羔数显著高于CT基因型,在黑头羊群体中,CC基因型和TT基因型的总产羔数极显著高于CT基因型,即所述ZBP1g.352CT位点在波尔山羊和黑头羊群体中与总产羔数显著相关;

所述ZBP1 g.955CT位点在波尔山羊群体中,TT基因型的总产羔数显著高于CC基因型,即所述ZBP1 g.955CT位点在波尔山羊群体中与总产羔数显著相关;

所述ZBP1 g.1880GA位点在波尔山羊群体中,AA基因型和GA基因型的总产羔数显著高于GG基因型,即所述ZBP1 g.1880GA位点在波尔山羊群体中与总产羔数显著相关;

所述ZBP1 g.2566TC位点在波尔山羊群体中,TT基因型的总产羔数显著高于CT基因型,在麻城黑山羊群体中,CC基因型的总产羔数显著高于TT基因型,即所述ZBP1 g.2566TC位点在波尔山羊和麻城黑山羊群体中与总产羔数显著相关。

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