[发明专利]肿瘤乳酸微环境相关非编码小RNA分子谱及其应用在审

专利信息
申请号: 201911256806.6 申请日: 2019-12-10
公开(公告)号: CN112941176A 公开(公告)日: 2021-06-11
发明(设计)人: 蔡启良;陈小亭;莫小辉;都树娟;朱彩霞;王玉燕 申请(专利权)人: 复旦大学
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6851
代理公司: 上海元一成知识产权代理事务所(普通合伙) 31268 代理人: 吴桂琴
地址: 200433 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 肿瘤 乳酸 环境 相关 编码 rna 分子 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种定量小分子RNA的方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:

(1)收集样本;样本处于含有乳酸的环境,乳酸的浓度范围是100-250U/L;

(2)茎环法定量PCR;

(3)获得目标miRNA分子或者5’-tiRNA分子。

2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的样本是离体的实体瘤样本,或者加入乳酸用于模拟肿瘤微环境的样本。

3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的样本是体外培养的恶性淋巴瘤细胞。

4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法还包括深度测序的步骤。

5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述目标miRNA分子是hsa-miR-9-5p、hsa-miR-210-3p、hsa-miR-7-5p、hsa-miR4521或者hsa-miR-7974;

所述的5’-tiRNA分子是5’-tiRNAHisGUG

6.一种肿瘤检测标志物,其特征在于,它通过权利要求1的方法获得。

7.如权利要求6所述的肿瘤检测标志物,其特征在于,它含有hsa-miR-9-5p、hsa-miR-210-3p、hsa-miR-7-5p、hsa-miR4521、hsa-miR-7974或者5’-tiRNAHisGUG中的一种或者几种,或者这些RNA相对应的DNA。

8.如权利要求6所述的肿瘤检测标志物,其特征在于,

hsa-miR-9-5p的成熟核苷酸序列如SEQ ID NO 1所示;

hsa-miR-210-3p的成熟核苷酸序列如SEQ ID NO 2所示;

hsa-miR-7-5p的成熟核苷酸序列如SEQ ID NO 3所示;

hsa-miR4521的成熟核苷酸序列如SEQ ID NO 4所示;

hsa-miR-7974的成熟核苷酸序列如SEQ ID NO 5所示;

5’-tiRNAHisGUG的成熟核苷酸序列如SEQ ID NO 6所示。

9.权利要求6所述的肿瘤检测标志物的应用,其特征在于,在正常乳酸浓度的淋巴瘤患者外周血单核细胞中,使用荧光定量PCR法检测;所述的RNA的正常参考值如下:

hsa-miR-9-5p,0.32-4.44;

hsa-miR-210-3p,0.4-1.50;

hsa-miR-7-5p,0.14-2.19;

hsa-miR4521,0.3-1.47;

hsa-miR-7974,0.23-3.69;或者

5’-tiRNAHisGUG,0.62-7.48。

10.权利要求6所述肿瘤检测标志物的应用,其特征在于,所述的RNA作为恶性肿瘤的诊治或者预后评判靶标的标志物。

11.如权利要求10所述的应用,其特征在于,所述的恶性肿瘤是恶性淋巴瘤。

12.如权利要求10所述的应用,其特征在于,所述的恶性肿瘤源自EBV阳性或者EBV阴性的B淋巴瘤细胞。

13.一种检测恶性淋巴瘤的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒含有定量检测hsa-miR-9-5p、hsa-miR-210-3p、hsa-miR-7-5p、hsa-miR4521、hsa-miR-7974或者5’-tiRNAHisGUG的试剂。

14.如权利要求13所述的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒含有hsa-miR-9-5p、hsa-miR-210-3p、hsa-miR-7-5p、hsa-miR4521、hsa-miR-7974或者5’-tiRNAHisGUG的扩增引物。

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