[发明专利]肿瘤乳酸微环境相关非编码小RNA分子谱及其应用在审
申请号: | 201911256806.6 | 申请日: | 2019-12-10 |
公开(公告)号: | CN112941176A | 公开(公告)日: | 2021-06-11 |
发明(设计)人: | 蔡启良;陈小亭;莫小辉;都树娟;朱彩霞;王玉燕 | 申请(专利权)人: | 复旦大学 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6851 |
代理公司: | 上海元一成知识产权代理事务所(普通合伙) 31268 | 代理人: | 吴桂琴 |
地址: | 200433 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肿瘤 乳酸 环境 相关 编码 rna 分子 及其 应用 | ||
1.一种定量小分子RNA的方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:
(1)收集样本;样本处于含有乳酸的环境,乳酸的浓度范围是100-250U/L;
(2)茎环法定量PCR;
(3)获得目标miRNA分子或者5’-tiRNA分子。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的样本是离体的实体瘤样本,或者加入乳酸用于模拟肿瘤微环境的样本。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述的样本是体外培养的恶性淋巴瘤细胞。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法还包括深度测序的步骤。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述目标miRNA分子是hsa-miR-9-5p、hsa-miR-210-3p、hsa-miR-7-5p、hsa-miR4521或者hsa-miR-7974;
所述的5’-tiRNA分子是5’-tiRNAHisGUG。
6.一种肿瘤检测标志物,其特征在于,它通过权利要求1的方法获得。
7.如权利要求6所述的肿瘤检测标志物,其特征在于,它含有hsa-miR-9-5p、hsa-miR-210-3p、hsa-miR-7-5p、hsa-miR4521、hsa-miR-7974或者5’-tiRNAHisGUG中的一种或者几种,或者这些RNA相对应的DNA。
8.如权利要求6所述的肿瘤检测标志物,其特征在于,
hsa-miR-9-5p的成熟核苷酸序列如SEQ ID NO 1所示;
hsa-miR-210-3p的成熟核苷酸序列如SEQ ID NO 2所示;
hsa-miR-7-5p的成熟核苷酸序列如SEQ ID NO 3所示;
hsa-miR4521的成熟核苷酸序列如SEQ ID NO 4所示;
hsa-miR-7974的成熟核苷酸序列如SEQ ID NO 5所示;
5’-tiRNAHisGUG的成熟核苷酸序列如SEQ ID NO 6所示。
9.权利要求6所述的肿瘤检测标志物的应用,其特征在于,在正常乳酸浓度的淋巴瘤患者外周血单核细胞中,使用荧光定量PCR法检测;所述的RNA的正常参考值如下:
hsa-miR-9-5p,0.32-4.44;
hsa-miR-210-3p,0.4-1.50;
hsa-miR-7-5p,0.14-2.19;
hsa-miR4521,0.3-1.47;
hsa-miR-7974,0.23-3.69;或者
5’-tiRNAHisGUG,0.62-7.48。
10.权利要求6所述肿瘤检测标志物的应用,其特征在于,所述的RNA作为恶性肿瘤的诊治或者预后评判靶标的标志物。
11.如权利要求10所述的应用,其特征在于,所述的恶性肿瘤是恶性淋巴瘤。
12.如权利要求10所述的应用,其特征在于,所述的恶性肿瘤源自EBV阳性或者EBV阴性的B淋巴瘤细胞。
13.一种检测恶性淋巴瘤的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒含有定量检测hsa-miR-9-5p、hsa-miR-210-3p、hsa-miR-7-5p、hsa-miR4521、hsa-miR-7974或者5’-tiRNAHisGUG的试剂。
14.如权利要求13所述的试剂盒,其特征在于,所述的试剂盒含有hsa-miR-9-5p、hsa-miR-210-3p、hsa-miR-7-5p、hsa-miR4521、hsa-miR-7974或者5’-tiRNAHisGUG的扩增引物。
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