[发明专利]一种同时检测多种病原微生物的引物探针组合、试剂盒以及方法在审
申请号: | 201911200522.5 | 申请日: | 2019-11-29 |
公开(公告)号: | CN110904272A | 公开(公告)日: | 2020-03-24 |
发明(设计)人: | 王艳;庄裕华 | 申请(专利权)人: | 上海海关动植物与食品检验检疫技术中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 上海智信专利代理有限公司 31002 | 代理人: | 余永莉 |
地址: | 200135 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 同时 检测 多种 病原微生物 引物 探针 组合 试剂盒 以及 方法 | ||
1.一种同时检测多种病原微生物的引物探针组合,其特征在于,该引物探针组合包括:
用于检测呼肠孤病毒的如SEQ ID NO:1-2所示的特异性引物对,如SEQ ID NO:3所示的特异性探针;
用于检测牛细小病毒的如SEQ ID NO:4-5所示的特异性引物对,如SEQ ID NO:6所示的特异性探针;
用于检测蓝舌病毒的如SEQ ID NO:7-8所示的特异性引物对,如SEQ ID NO:9所示的特异性探针;
用于检测牛腹泻病毒的如SEQ ID NO:10-11所示的特异性引物对,如SEQ ID NO:12所示的特异性探针;
用于检测牛多瘤病毒的如SEQ ID NO:13-14所示的特异性引物对,如SEQ ID NO:15所示的特异性探针;以及
用于检测狂犬病毒的如SEQ ID NO:16-17所示的特异性引物对,如SEQ ID NO:18所示的特异性探针。
2.根据权利要求1所述的同时检测多种病原微生物的引物探针组合,其特征在于,所述特异性探针的5’端修饰的活性有机基团为氨基。
3.根据权利要求1所述的同时检测多种病原微生物的引物探针组合,其特征在于,所述特异性引物中的SEQ ID NO:1,5,7,10,13,16的5’端修饰有生物素标记。
4.一种同时检测多种病原微生物的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1-3中任意一项所述的同时检测多种病原微生物的引物探针组合。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,其中12条特异性引物的摩尔浓度比值为:SEQ ID NO.1﹕SEQ ID NO.2﹕SEQ ID NO.4﹕SEQ ID NO.5﹕SEQ ID NO.7﹕SEQ ID NO.8﹕SEQ ID NO.10﹕SEQ ID NO.11﹕SEQ ID NO.13﹕SEQ ID NO.14﹕SEQ ID NO.16﹕SEQ ID NO.17=1.5﹕1.5﹕2.0﹕2.0﹕3.0﹕3.0﹕2.0﹕2.0﹕1.5﹕1.5﹕2.0﹕2.0。
6.一种液相芯片技术检测微生物的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1,根据呼肠孤病毒、牛细小病毒、蓝舌病毒、牛腹泻病毒、牛多瘤病毒、狂犬病毒的基因序列分别设计合成对应的具有如SEQ ID NO.3所示的核苷酸序列的呼肠孤病毒探针、具有如SEQ ID NO.6所示的核苷酸序列的牛细小病毒探针、具有如SEQ ID NO.9所示的核苷酸序列的蓝舌病毒探针、具有如SEQ ID NO.12所示的核苷酸序列的牛腹泻病毒探针、具有如SEQ ID NO.15所示的核苷酸序列的牛多瘤病毒探针和具有如SEQ ID NO.18所示的核苷酸序列的狂犬病毒探针;
S2,将呼肠孤病毒探针、牛细小病毒探针、蓝舌病毒探针、牛腹泻病毒探针、牛多瘤病毒探针、狂犬病毒探针分别与第一、第二、第三、第四、第五和第六荧光编码微球相连,分别获得第一、第二、第三、第四、第五和第六偶联微球的探针溶液;
S3,将呼肠孤病毒、牛细小病毒、蓝舌病毒、牛腹泻病毒、牛多瘤病毒、狂犬病毒阴性样品,经DNA抽提和PCR扩增获得PCR产物,将第一、第二、第三、第四、第五和第六偶联微球的探针溶液混合形成混合偶联微球的探针溶液,然后将PCR产物加入混合偶联微球的探针溶液,在Luminex仪器中读取信号,根据该信号确定阈值;
S4,将待测样品,经DNA抽提和PCR扩增获得待测PCR产物,将待测PCR产物加入混合偶联微球的探针溶液,在Luminex仪器中读取信号,与阈值比较,判断待测样品为阴性或阳性。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述呼肠孤病毒探针、牛细小病毒探针、蓝舌病毒探针、牛腹泻病毒探针、牛多瘤病毒探针、狂犬病毒探针的Tm值保持在56℃-58℃。
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,获得待测PCR产物具体方法包括如下步骤:
P1,提供用于检测呼肠孤病毒的SEQ ID NO:1-2所示的核苷酸序列的特异性引物对,用于检测牛细小病毒的SEQ ID NO:4-5所示的核苷酸序列的特异性引物对,用于检测蓝舌病毒的SEQ ID NO:7-8所示的核苷酸序列的特异性引物对,用于检测牛腹泻病毒的SEQ IDNO:10-11所示的核苷酸序列的特异性引物对,用于检测牛多瘤病毒的SEQ ID NO:13-14所示的核苷酸序列的特异性引物对,以及用于检测狂犬病毒的SEQ ID NO:16-17所示的核苷酸序列的特异性引物对,其中,所述特异性引物中的SEQ ID NO:1,5,7,10,13,16的5’端修饰有生物素标记;以及
P2,利用所述特异性引物对扩增,分别获得呼肠孤病毒目的基因、牛细小病毒目的基因、蓝舌病毒目的基因、牛腹泻病毒目的基因、牛多瘤病毒目的基因、狂犬病毒目的基因及包含呼肠孤病毒目的基因、牛细小病毒目的基因、蓝舌病毒目的基因、牛腹泻病毒目的基因、牛多瘤病毒目的基因、狂犬病毒目的基因的多重PCR产物。
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