[发明专利]基于核酸外切酶Ⅲ的功能化发夹探针、组合物及提高检测Pax-5a基因灵敏度的方法有效
| 申请号: | 201911183868.9 | 申请日: | 2019-11-27 |
| 公开(公告)号: | CN110964817B | 公开(公告)日: | 2022-09-23 |
| 发明(设计)人: | 黎泓波;蒲嘉美;刘明彬;赵卫华;王素琴 | 申请(专利权)人: | 江西师范大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 郑州优盾知识产权代理有限公司 41125 | 代理人: | 冉珊敏 |
| 地址: | 330022 *** | 国省代码: | 江西;36 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 基于 核酸外切酶 功能 发夹 探针 组合 提高 检测 pax 基因 灵敏度 方法 | ||
1.基于核酸外切酶Ⅲ的功能化发夹探针,其特征在于:所述功能化发夹探针序列如SEQID No.1所示,该功能化发夹探针包括G-四链体片段和3’凹陷末端区域,其空间二级结构如:其中,区域Ⅰ为G-四链体序列,区域Ⅱ为目标基因结合序列。
2.包含权利要求1所述的功能化发夹探针的检测组合物,其特征在于:还包括引物、DNA聚合酶、核酸外切酶Ⅲ和氯化血红素溶液。
3.根据权利要求2所述的包含功能化发夹探针的检测组合物,其特征在于:所述引物序列如SEQ ID No.2所示,DNA聚合酶为Klenow Fragment。
4.利用权利要求2或3所述的包含功能化发夹探针的组合物提高检测Pax-5a基因灵敏度的方法,其特征在于,步骤如下:
(1)将发夹探针、引物以及梯度浓度的Pax-5a的标准溶液在反应管中混合,加入缓冲液体系,37℃孵育1小时后,再加入5 U DNA聚合酶、10 mM三磷酸碱基脱氧核苷酸,37℃孵育2小时,然后加热使酶失活;
(2)经过步骤(1)处理的溶液冷却至室温,加入100 U核酸外切酶Ⅲ,37℃孵育1小时,然后加热使酶失活;
(3)经过步骤(2)处理的溶液冷却到室温时,加入氯化血红素溶液,37℃孵育35-40分钟;
(4)向经步骤(3)处理的溶液里加入HEPES缓冲液、双氧水和3,3',5,5'-四甲基联苯胺溶液,反应10-15分钟后,采用紫外可见分光光度计检测350-750 nm吸收峰的变化;
(5)根据检测到的电信号变化值及其对应的Pax-5a的标准溶液浓度,绘制标准曲线;
(6)将以双碱基错配序列、四碱基错配序列、六碱基错配序列和完全错配序列分别作为目标物,检测灵敏度。
5.根据权利要求4所述的提高检测Pax-5a基因灵敏度的方法,其特征在于:所述步骤(1)中发夹探针的浓度为1-10 μM、引物的浓度为1-10 μM、Pax-5a的标准溶液的梯度浓度为10 μM,1 μM,100nM,10 nM,1 nM,100pM,10pM,0 pM。
6.根据权利要求4所述的提高检测Pax-5a基因灵敏度的方法,其特征在于:所述步骤(1)中发夹探针、引物、Pax-5a的标准溶液、DNA聚合酶、三磷酸碱基脱氧核苷酸的量分别为:2 μL、2 μL、1 μL、0.4 μL和1 μL。
7.根据权利要求4所述的提高检测Pax-5a基因灵敏度的方法,其特征在于:所述步骤(2)中核酸外切酶Ⅲ的加入量为2μL。
8.根据权利要求4所述的提高检测Pax-5a基因灵敏度的方法,其特征在于:所述步骤(3)中氯化血红素溶液的浓度为50 μM、加入量为2mL。
9.根据权利要求4所述的提高检测Pax-5a基因灵敏度的方法,其特征在于:所述步骤(4)中HEPES缓冲液的浓度为10 mM,pH为7.2,加入量为96 μL;双氧水的浓度为20mM,加入量为10 μL;3,3',5,5'-四甲基联苯胺溶液的浓度为10mM,加入量为10 μL。
10.根据权利要求4所述的提高检测Pax-5a基因灵敏度的方法,其特征在于:所述步骤(6)中双碱基错配序列、四碱基错配序列、六碱基错配序列和完全错配序列是分别对Pax-5a基因的两个、四个、六个或全部序列进行错配设计。
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