[发明专利]一种宏基因组绝对定量的方法有效
| 申请号: | 201911116970.7 | 申请日: | 2019-11-15 |
| 公开(公告)号: | CN110804655B | 公开(公告)日: | 2023-06-02 |
| 发明(设计)人: | 胡悦;许冬瑾;蒙洁妙 | 申请(专利权)人: | 康美华大基因技术有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12Q1/06 |
| 代理公司: | 北京东方盛凡知识产权代理有限公司 11562 | 代理人: | 杜权 |
| 地址: | 518126 广东省深圳市宝安区西*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 宏基 绝对 定量 方法 | ||
1.一种细菌定量的方法,包括:
在样品中添加第一定量DNA片段,其中,所述第一定量DNA片段的序列为SEQNO:1所示的序列;
对所述样品进行基因组DNA的提取;
在所述提取的基因组DNA中添加第二定量DNA片段,得到总基因组,其中,所述第二定量DNA片段的序列为SEQNO:2所示的序列;
对所述总基因组进行宏基因组文库构建和测序;
利用得到的测序结果的数据计算单位质量的所述样品中的细菌数量;
其中,所述样品中的所述第一定量DNA片段的分子数为:测序所得的所述第一定量DNA片段的拷贝数与单位质量的所述样品中加入的所述第二定量DNA片段的分子数的乘积再除以测序所得的所述第二定量DNA片段的分子数;
所述样品中的基因组DNA的得率为:单位质量的所述样品中的所述总基因组中的所述第一定量DNA片段的分子数除以加入的所述第一定量DNA片段的分子数,之后再乘以所述样品中的基因组DNA的总量;
单位质量的所述样品的细菌的数量为:单位质量的所述样品中加入的所述第二定量DNA片段的分子数、测序所得的细菌的总拷贝数和所述样品的基因组DNA的总量的乘积,再除以测序所得的所述第二定量DNA片段的拷贝数、所述样品中的基因组DNA的得率和所述样品的质量的乘积。
2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述样品为粪便样品。
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