[发明专利]一种宏基因组绝对定量的方法有效

专利信息
申请号: 201911116970.7 申请日: 2019-11-15
公开(公告)号: CN110804655B 公开(公告)日: 2023-06-02
发明(设计)人: 胡悦;许冬瑾;蒙洁妙 申请(专利权)人: 康美华大基因技术有限公司
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869;C12Q1/06
代理公司: 北京东方盛凡知识产权代理有限公司 11562 代理人: 杜权
地址: 518126 广东省深圳市宝安区西*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 宏基 绝对 定量 方法
【权利要求书】:

1.一种细菌定量的方法,包括:

在样品中添加第一定量DNA片段,其中,所述第一定量DNA片段的序列为SEQNO:1所示的序列;

对所述样品进行基因组DNA的提取;

在所述提取的基因组DNA中添加第二定量DNA片段,得到总基因组,其中,所述第二定量DNA片段的序列为SEQNO:2所示的序列;

对所述总基因组进行宏基因组文库构建和测序;

利用得到的测序结果的数据计算单位质量的所述样品中的细菌数量;

其中,所述样品中的所述第一定量DNA片段的分子数为:测序所得的所述第一定量DNA片段的拷贝数与单位质量的所述样品中加入的所述第二定量DNA片段的分子数的乘积再除以测序所得的所述第二定量DNA片段的分子数;

所述样品中的基因组DNA的得率为:单位质量的所述样品中的所述总基因组中的所述第一定量DNA片段的分子数除以加入的所述第一定量DNA片段的分子数,之后再乘以所述样品中的基因组DNA的总量;

单位质量的所述样品的细菌的数量为:单位质量的所述样品中加入的所述第二定量DNA片段的分子数、测序所得的细菌的总拷贝数和所述样品的基因组DNA的总量的乘积,再除以测序所得的所述第二定量DNA片段的拷贝数、所述样品中的基因组DNA的得率和所述样品的质量的乘积。

2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述样品为粪便样品。

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