[发明专利]一种能检测多种真菌基因组DNA的微阵列芯片及其制备方法在审
| 申请号: | 201911116939.3 | 申请日: | 2019-11-15 |
| 公开(公告)号: | CN110863037A | 公开(公告)日: | 2020-03-06 |
| 发明(设计)人: | 樊高君;王玲;闫宝山;于大为;邵育晓;徐悦;刘瑞鑫 | 申请(专利权)人: | 北京贝尔生物工程股份有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6837 | 分类号: | C12Q1/6837;C12Q1/6895;C12Q1/04 |
| 代理公司: | 北京悦和知识产权代理有限公司 11714 | 代理人: | 司丽春 |
| 地址: | 102612 北京市*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 检测 多种 真菌 基因组 dna 阵列 芯片 及其 制备 方法 | ||
1.一种能检测多种真菌基因组DNA的微阵列芯片,其特征在于:包括:
经过修饰的芯片固相载体;
和,经过修饰的基因芯片探针,所述经过修饰的基因芯片探针以阵列的方式分布并通过共价键连接于经过修饰的芯片固相载体的修饰基团上,所述经过修饰的基因芯片探针按照5’-3’的方向包括以下结构:5’修饰基团-Cn-(dT)m-寡核苷酸链3’,其中:所述寡核苷酸链表示基因芯片探针的核苷酸序列本体,(dT)m表示m个dT,所述Cn表示具有n个碳原子的直链烷基,所述5’修饰基团能与芯片固相载体本体表面修饰的基团发生化学反应形成共价键连接,8≤m≤15,5≤n≤15;可选的,m=10,n=12;
所述寡核苷酸链选自白色念珠菌、光滑念珠菌、近平滑念珠菌、曲霉菌、热带念珠菌和隐球菌中的两种或两种以上真菌的基因组DNA特异性区域的核苷酸序列或其互补序列。
2.一种能检测多种真菌基因组DNA的微阵列芯片的制备方法,其特征在于:包括以下步骤:
1)修饰芯片固相载体本体使其能与经过修饰的基因芯片探针的修饰基团发生化学反应形成共价键连接;
2)合成经过修饰的基因芯片探针,所述经过修饰的基因芯片探针,按照5’-3’的方向包括以下结构:5’修饰基团-Cn-(dT)m-寡核苷酸链3’,其中:所述寡核苷酸链表示基因芯片探针的核苷酸序列本体,(dT)m表示m个dT,所述Cn表示具有n个碳原子的直链烷基,所述5’修饰基团能与芯片固相载体本体表面修饰的基团发生化学反应形成共价键连接,8≤m≤15,5≤n≤15;可选的,m=10,n=12;所述寡核苷酸链选自白色念珠菌、光滑念珠菌、近平滑念珠菌、曲霉菌、热带念珠菌和隐球菌中的两种或两种以上真菌的基因组DNA特异性区域的核苷酸序列或其互补序列;
3)配制检测探针点样液并将检测探针点样液涡旋震荡混匀后,于芯片点样仪上以阵列的方式向经过修饰的芯片固相载体进行点样。
3.根据权利要求1所述的微阵列芯片或根据权利要求2所述的制备方法,其特征在于:所述经过修饰的基因芯片探针有6种,这6种经过修饰的基因芯片探针中的寡核苷酸链分别为白色念珠菌、光滑念珠菌、近平滑念珠菌、曲霉菌、热带念珠菌和隐球菌的基因组DNA特异性区域的核苷酸序列或其互补序列。
4.根据权利要求3所述的微阵列芯片或根据权利要求3所述的制备方法,其特征在于:芯片固相载体本体为二氧化硅载玻片。
5.根据权利要求4所述的微阵列芯片或根据权利要求4所述的制备方法,其特征在于:芯片固相载体本体的修饰为醛基化修饰,基因芯片探针上的修饰基团为氨基。
6.根据权利要求1所述的微阵列芯片,其特征在于:还包括以阵列的方式分布的阳性质控探针、阴性质控探针、和真菌通用型探针。
7.根据权利要求2所述的制备方法,其特征在于:还包括以下步骤:配制阳性质控探针、阴性质控探针、真菌通用型探针的点样液,于芯片点样仪上以阵列的方式向经过修饰的芯片固相载体进行点样。
8.根据权利要求5所述的制备方法,其特征在于,在修饰芯片固相载体本体前,包括对芯片固相载体本体进行清洗和/或酸碱处理的步骤,在进行清洗和/或酸碱处理时使用了载玻片夹具,所述载玻片夹具包括:
第一载玻片固定托座,其上下表面之间开设有螺纹通孔,并且其上下表面之间开设有载玻片固定通口;
第二载玻片固定托座,其上表面开设有与载玻片固定通口位置相对应的载玻片固定槽;
和,连接杆,所述连接杆的一端固定连接于第二载玻片固定托座的上表面使连接杆与第二载玻片固定托座相垂直,所述连接杆外表面设置有与螺纹通孔的螺纹相匹配的螺纹,连接杆的另一端穿过螺纹通孔将第一、第二载玻片固定托座固定连接;
所述载玻片夹具的材质为耐酸、耐碱的材质。
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