[发明专利]一种快速检测山羊ADIPOQ基因SNP的方法及专用试剂盒在审
申请号: | 201911107828.6 | 申请日: | 2019-11-13 |
公开(公告)号: | CN110643720A | 公开(公告)日: | 2020-01-03 |
发明(设计)人: | 安清明;黄永震;刘贤;王旭;文逸凡;杨鹏;王大会;李志明;王献伟;贺花;张子敬 | 申请(专利权)人: | 铜仁学院 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 61200 西安通大专利代理有限责任公司 | 代理人: | 范巍 |
地址: | 554300 贵州省铜*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 山羊 单核苷酸多态性位点 基因 琼脂糖凝胶电泳 限制性内切酶 全基因组DNA 专用试剂盒 电泳结果 分子标记 分子育种 辅助选择 快速检测 良种繁育 基因型 体高 消化 检测 | ||
1.一种检测山羊ADIPOQ基因单核苷酸多态性的方法,其特征在于:包括以下步骤:
以山羊基因组DNA为模板,通过PCR扩增ADIPOQ基因的部分片段,将扩增产物经限制性内切酶AvaII酶切后进行琼脂糖凝胶电泳,根据电泳结果鉴定山羊ADIPOQ基因单核苷酸多态性位点的基因型,所述山羊ADIPOQ基因单核苷酸多态性位点为山羊ADIPOQ基因参考基因组序列NC_030808.1的14059C>T单核苷酸突变位点。
2.如权利要求1所述一种检测山羊ADIPOQ基因单核苷酸多态性的方法,其特征在于:所述ADIPOQ基因的部分片段包含14059C>T单核苷酸突变位点,扩增该片段的引物对为:
上游引物F1:5’-GGTTAAGCTTCTTTACCACAGAGTG-3’
下游引物R1:5’-CTTCCACACTGACCGAAGTC-3’。
3.如权利要求1所述一种检测山羊ADIPOQ基因单核苷酸多态性的方法,其特征在于:所述PCR的扩增反应体系包括10ng/μL模板DNA 1μL以及10pmol/L的上、下游扩增引物各0.5μL。
4.如权利要求1所述一种检测山羊ADIPOQ基因单核苷酸多态性的方法,其特征在于:所述PCR采用的扩增反应程序为:94~95℃预变性5min;94~95℃变性30s,54.1℃退火30s,72℃延伸25~60s,35个循环;72℃延伸10min。
5.如权利要求1所述一种检测山羊ADIPOQ基因单核苷酸多态性的方法,其特征在于:所述琼脂糖凝胶的质量浓度为2.5%。
6.如权利要求1所述一种检测山羊ADIPOQ基因单核苷酸多态性的方法,其特征在于:所述山羊ADIPOQ基因单核苷酸多态性位点的电泳鉴定结果为:CC基因型表现为46bp和272bp的两条条带,CT基因型表现为272bp、46bp和318bp的三条条带,TT基因型表现为318bp的一条条带。
7.一种如权利要求1所述的检测山羊ADIPOQ基因单核苷酸多态性的方法在山羊分子标记辅助选择育种中的应用。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于:所述山羊ADIPOQ基因单核苷酸多态性位点的CT和TT基因型为山羊生长性状早期选择的分子育种基因标记。
9.一种检测山羊ADIPOQ基因单核苷酸多态性的试剂盒,其特征在于:包括基于PCR-RFLP法对位于山羊ADIPOQ基因参考基因组序列NC_030808.1的14059C>T单核苷酸突变位点进行基因分型的扩增引物对,以及限制性内切酶AvaII。
10.根据权利要求9所述一种检测山羊ADIPOQ基因单核苷酸多态性的试剂盒,其特征在于:所述扩增引物对的序列为:
上游引物F1:5’-GGTTAAGCTTCTTTACCACAGAGTG-3’
下游引物R1:5’-CTTCCACACTGACCGAAGTC-3’。
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