[发明专利]CYP2D6*10基因的SYBR Green I检测引物、试剂盒及检测方法在审
申请号: | 201911102601.2 | 申请日: | 2019-11-12 |
公开(公告)号: | CN110819722A | 公开(公告)日: | 2020-02-21 |
发明(设计)人: | 谢少华 | 申请(专利权)人: | 爱尔生基因医学科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 武汉蓝宝石专利代理事务所(特殊普通合伙) 42242 | 代理人: | 王振宇 |
地址: | 430000 湖北省武汉市东湖新技术开发区高*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | cyp2d6 10 基因 sybr green 检测 引物 试剂盒 方法 | ||
1.一组CYP2D6*10基因的SYBR Green I检测引物,其特征在于,包括CYP2D6*10野生型上游引物、CYP2D6*10突变型上游引物、CYP2D6*10野生型和CYP2D6*10突变型通用下游引物,所述CYP2D6*10野生型上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,CYP2D6*10突变型上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示,通用下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示。
2.一种CYP2D6*10基因的SYBR Green I检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述的一组CYP2D6*10基因的SYBR Green I检测引物。
3.根据权利要求2所述的一种CYP2D6*10基因的SYBR Green I检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括从待检测样本中提取DNA的样本处理试剂、PCR缓冲液、DNA聚合酶、阴性对照品、阳性对照品、显色试剂。
4.根据权利要求3所述的一种CYP2D6*10基因的SYBR Green I检测试剂盒,其特征在于,所述阳性对照品包括CYP2D6*10野生型阳性对照和CYP2D6*10突变型阳性对照,所述CYP2D6*10野生型阳性对照和CYP2D6*10突变型阳性苷酸序列依次如SEQ ID NO:4~SEQ IDNO:5所示。
5.根据权利要求4所述的一种CYP2D6*10基因的SYBR Green I检测试剂盒,其特征在于,CYP2D6*10基因的突变型阳性对照包含CYP2D6*10基因突变型阳性模板序列,所述CYP2D6*10基因突变型阳性模板序列为由CYP2D6*10基因突变型上游引物与CYP2D6*10基因公共下游引物扩增出的PCR产物。
6.根据权利要求4所述的一种CYP2D6*10基因的SYBR Green I检测试剂盒,其特征在于,CYP2D6*10基因的野生型阳性对照包含CYP2D6*10基因野生型阳性模板序列,所述CYP2D6*10基因野生型阳性模板序列为由CYP2D6*10基因野生型上游引物与CYP2D6*10基因公共下游引物扩增出的PCR产物。
7.一种基于权利要求2-6任一项所述试剂盒的CYP2D6*10基因的SYBR Green I检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)获取样本基因组DNA;
(2)以样本基因组DNA为模板,利用SYBRGreen Ⅰ染料法分别对CYP2D6*10基因的野生型反应体系和突变反应体系的实时荧光PCR扩增;
(3)数据采集和分析:将阈值线调整至背景信号及阴性扩增线以上,通过实时荧光PCR仪收集信号,计算所述野生型反应体系和突变型反应体系的ΔCt值来确定所述样品的DNA的基因型。
8.根据权利要求7所述的检测方法,其特征在于,所述实时荧光PCR扩增程序为:94℃6min;94℃15s,60℃40s,40个循环,62℃收集荧光信号;94℃15s,60℃1min,94℃30s,62℃15s。
9.根据权利要求7所述的检测方法,其特征在于,所述步骤3)中按照以下判断标准确定所述样品DNA的基因型:
-2.5≤ΔCt=野生型Ct值-突变型Ct值≤3,判定为杂合型样本;
ΔCt=突变型Ct值-野生型Ct值>2.5,判定为野生型样本;
ΔCt=野生型Ct值-突变型Ct值>3,判定为突变型样本。
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