[发明专利]一种与猪产仔数相关的cricTCP1标记应用

说明书

本发明属于家畜分子生物技术领域，尤其涉及一种与猪产仔数相关的cricTCP1标记应用，所述circ‑TCP1基因与miR‑183的表达呈反向相关；所述circ‑TCP1与母猪产仔能力呈负相关，miR‑183与母猪产仔能力呈正相关；本申请实现了测试卵巢或血液中circ‑TCP1、miR‑183中任一或两者的表达水平，便可准确快速比较出不同母猪个体间产仔能力高低。

技术领域

本发明属于家畜分子生物技术领域，尤其涉及一种与猪产仔数相关的cricTCP1标记应用。

背景技术

增加窝产仔数一直是全球养猪者和生产商的目标，更大的产仔数加上更短的产仔间隔极有可能使每年每头母猪的产仔量(psy)增加，这是促进母猪饲养经济成功的主要力量(Zak等人2017年；Kemp等人2018年)。卵巢是雌性动物重要的生殖器官，在每一发情周期都经历一系列的生物学过程。母猪的多产性由涉及卵巢编码和非编码基因的复杂转录网络的紧密调节(张等2015；Huang等人2016；Tang等人2018)。同时产仔数是评估猪繁殖性状最直接和最具有价值的性状，提高猪的产仔数对猪产业具有非常重要的意义。产仔数是衡量母猪繁殖性能的重要指标之一，也是猪的重要经济性状。

产仔数性状作为复杂的数量性状，产仔数是复杂多基因控制性状，遗传力很低。总产仔数(totalnumberborn，TNB)的遗传力为(0.062±0.023)，产活仔数(numberbornalive，NBA)的遗传力在纯种群体中为0.049±0.023，在杂交群体中为0.091±0.054，同时，母猪的年龄、胎次、与配公猪的精液品质以及妊娠过程中母猪的营养状况都是影响产仔数的因素。随着生物技术的发展及生猪养殖水平的不断提高，大量研究者鉴别出产仔数相关的标记，使用标记辅助选择(markerassistedselection，MAS)或全基因组选择(genomeselection，GS)可加快猪的繁殖性状的改良。

共价闭合的环状RNAs(circRNAs)正作为一类新的基因表达调节剂出现(Li等人2018年)。现在，积累的工作已经揭示了环状RNA结构在许多物种性腺发育和繁殖性能中的关键作用(quan和li，2018)。下一代测序表明，内源性环状RNA通常以时空特异性的方式在各种猪组织中表达，包括卵巢(Liang等人2017年)。最近的研究表明，人类卵巢源性环状RNA与卵巢衰老有关(Cai等人，2018)；虽然专利号201610841933.2公开了一种与猪产仔数相关的microRNA标记应用，但该方法需要选择猪种垂体进行标记，且研究者仍好奇：不同产仔量的母猪是否有不同的环状RNA结构。

加之，繁殖性能由多基因调控，调控机理十分复杂，根据《母猪产仔数影响因素研究进展》(李川琦等人发表)中记载“目前由国内外专家通过大量的工作，鉴定出的母猪繁殖性能主效基因多达5个，分别为雌激素受体(ESR)、促卵泡激素β亚基(FSHβ)、催乳素基因(PRLR)、视黄醇(RBP4)和肥胖基因(OB)。如发现的梅山猪ESR基因可影响约1.4头/窝的总产仔数和超过1头/窝的产活仔数，确定了ESR基因调控母猪产仔的主基因地位；目前，人们发现的与母猪产仔性能相关的微效基因有20多个，如骨桥基因(OPN)、褪黑素受体基因(MR)和HSD基因家族等，这些基因也可影响母猪的产仔性能。近些年，牛步月通过QTL分析，预测了MMP2、PREI3和SPAG1等10个候选基因；刘林清和Nin等又先后鉴定出了HSD17B1、MLH1和KLK7等与母猪繁殖性能相关基因”，这说明了对于产仔数相关的标记基因仍值得关注与深入探索。

发明内容

本发明的目的在于利用高通量测序技术鉴别影响产仔性能的基因，为鉴别影响产仔数的主效基因位点与机制提供帮助，为产仔数分子育种提供分子标记信息，以期为猪的候选环状RNAs及优良品种选育和利用提供参考。

1.本发明提供标记基因circ-TCP1对miR-183调控在母猪产仔能力判断方面的应用；所述circ-TCP1基因与miR-183的表达呈反向相关；所述circ-TCP1与母猪产仔能力呈负相关，miR-183与母猪产仔能力呈正相关。