[发明专利]检测引发血流感染的球菌的引物和/或探针组合物及其应用

说明书

本申请提供了检测引发血流感染的球菌的引物和/或探针组合物及其应用。本申请具体涉及用于检测肺炎链球菌、粪肠球菌、屎肠球菌、化脓性链球菌、无乳链球菌、脑膜炎奈瑟菌以及凝固酶阴性葡萄球菌和金黄色葡萄球菌中的一种或多种的引物和/或探针组合物或相关的试剂或试剂盒，由此大大缩短这些球菌的检测周期，提高了效率和检测通量，迎合了检测需求。此外，本申请的方法及其相关产品具有较高的特异性、灵敏度和准确性。

技术领域

本申请属于分子生物学领域，具体涉及用于检测引发血流感染的球菌，特别是革兰氏阳性球菌的引物和/或探针组合物及其应用。

背景技术

血流感染(BSI)是指各种病原菌入血液循环引起的全身炎症反应、感染及中毒，是一种严重危及生命的感染性疾病。由于该病起病隐匿、发展迅速，若未能及时有效治疗，会危及患者生命。但是，血流感染的临床表现缺乏特异性，易漏诊、误诊，因此早期诊断血流感染具有重要的临床意义。

引起血流感染的病原菌主要分为三类:革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌和真菌。在常见的血流感染病原菌中，革兰氏阳性菌主要包括各种球菌，如肺炎链球菌、粪肠球菌、屎肠球菌、化脓性链球菌、无乳链球菌以及凝固酶阴性葡萄球菌和金黄色葡萄球菌等，而脑膜炎奈瑟菌(又称为脑膜炎球菌)为革兰氏阴性球菌。

一直以来，血培养是公认的诊断血流感染的“金标准”，通过生化方法或显微镜观察来确定病原菌。然而，该方法所需周期长，对于较难生长的病原菌或者已使用过抗菌药物治疗的患者敏感度较低，因而在血流感染早期诊断中的作用十分有限。缺乏准确诊断结果导致临床医师难以选择最佳的治疗方案，而盲目使用抗生素可能会导致患者的生存率降低、细菌耐药性的出现以及治疗费用的增加等不良后果。

因此，亟需能够对血流感染进行早期诊断的方法及相关产品。

发明内容

为了解决上述问题，第一方面，本申请提供了用于检测引发血流感染的球菌的引物和/或探针组合物，其包含选自用于检测以下一种或多种靶标的引物和/或探针：肺炎链球菌自溶素基因(lytA基因)，粪肠球菌转录调控基因(Ef0027基因)，屎肠球菌d-丙氨酸聚连接酶基因(ddl基因)，化脓性链球菌致热外毒素B基因(speB基因)，无乳链球菌表面免疫相关蛋白基因(Sip基因)，脑膜炎奈瑟菌荚膜转移基因A(ctrA基因)，凝固酶阴性葡萄球菌超氧化物歧化酶基因(sodA基因)，以及金黄色葡萄球菌甲氧西林耐药辅助基因(femA基因)。

在具体实施方案中，本申请提供的用于检测引发血流感染的球菌的引物和/或探针组合物包含分别用于检测所述lytA基因、所述Ef0027基因、所述ddl基因、所述speB基因、所述Sip基因、所述ctrA基因、所述sodA基因和所述femA基因的引物和/或探针中的任意两种、三种、四种、五种、六种、七种或八种。

例如，在一实施方案中，本申请提供的用于检测引发血流感染的球菌的引物和/或探针组合物包含分别用于检测所述lytA基因和/或所述Ef0027基因的引物和/或探针。

在一实施方案中，本申请提供的用于检测引发血流感染的球菌的引物和/或探针组合物包含分别用于检测所述ddl基因和/或所述speB基因的引物和/或探针。

在一实施方案中，本申请提供的用于检测引发血流感染的球菌的引物和/或探针组合物包含分别用于检测所述Sip基因和/或所述ctrA基因的引物和/或探针。

在一实施方案中，本申请提供的用于检测引发血流感染的球菌的引物和/或探针组合物包含分别用于检测所述sodA基因和/或所述femA基因的引物和/或探针。

在另一实施方案中，本申请提供的用于检测引发血流感染的球菌的引物和/或探针组合物中，用于检测所述lytA基因的引物序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示，探针序列如SEQ ID NO.3所示。