[发明专利]一种与绵羊尾脂重相关的分子标记及其应用

说明书

本发明提供了一种与绵羊尾脂重相关的分子标记应用。其中该分子标记表现为SEQ ID NO:1所示核苷酸序列的C/G突变多态性。本发明的分子标记与绵羊尾脂重紧密相关，可用于瘦尾型绵羊的育种和低脂型优质肉羊新品种的培育，为绵羊肉质的遗传改良提供了基因工程手段，具有重大的实际应用价值。

技术领域

本发明属于分子标记制备技术领域，具体涉及与绵羊尾脂重相关的分子标记及其应用。

背景技术

绵羊是最早被驯化的草食家畜,在漫长的驯化过程中,动物的行为习惯、体型外貌以及重要经济性状因受到自然选择和强烈的人工选择而发生巨大变化(甘尚权,张伟,沈敏,等.绵羊X染色体59383635位点多态性与脂尾性状的相关性分析[J].遗传，2013,35(10):1209-1216.)。绵羊的脂尾和瘦尾是由环境和基因共同决定的复杂性状，而尾部脂肪沉积又与尾部脂肪组织中脂肪间质干细胞的增殖与成脂分化相关(杨敏，韩吉龙，刘建斌,等.绵羊尾部脂肪沉积基因定位及细胞生物学机制研究进展.[J]中国畜牧杂志.2018，54(6)：23-29.)。研究表明，野生绵羊最早属于瘦尾羊，但由于人工驯化和自然选择，瘦尾羊部分进化为脂尾型绵羊。脂尾型绵羊分布较广，全世界约有超过25％的绵羊品种属于脂尾(臀)型绵羊品种(Moradi M H,Nejati-Javaremi A,Moradi-Shahrbabak M,et al.Genomicscan of selective sweeps in thin and fat tail sheep breeds for identifying ofcandidate regions associated with fat deposition[J].BMC Genetics,2012,13(1):10.)；中国绵羊品种中约有80％为脂尾型绵羊(Wei C,Wang H,Liu G,et al.Genome-wideanalysis reveals population structure and selection in Chinese indigenoussheep breeds[J].BMC Genomics,2015,16(1):194.)，其中是以小尾寒羊、蒙古羊等为代表的蒙古系羊和以哈萨克羊为代表的哈萨克系羊为主。这些品种的绵羊具有较强的脂肪沉积能力，其主要特征是尾臀部充满大量脂肪，而脂肪是机体储存能量的主要方式。绵羊在水草丰美的夏季，大量沉积体内脂肪，以便在寒冬枯草季节利用其脂肪维持机体的新陈代谢需要得以“保命”。但近年来随着人们生活水平的不断提高，长期摄入高脂肪食物所引起的心脑血管疾病越来越受到人们的关注，高脂肉类逐渐受到冷落,脂尾型绵羊品种也越来越不受消费者欢迎。此外牧民定居点不断扩建、牧草种植等配套设施不断完善，尾脂的“保命”作用也已不值一提。而且从饲养成本考虑,生产1kg脂肪消耗的饲草可产生2kg瘦肉，显然过多的尾脂沉积也会加大饲养成本。因此在肉羊生产实践中，通过遗传改良减少绵羊尾部脂肪沉积是提高生产效益的有效途径，对低脂肉用型绵羊的培育具有重要的理论价值与实际意义。

本发明通过对绵羊13号染色体进行研究，寻找多态性位点并进行分型，探讨其不同基因型与绵羊尾脂重的关联性，旨在为绵羊肉质的遗传改良方面提供基因素材，加速我国自主知识产权的低脂型优质肉羊新品种的培育进程。

发明内容

本发明的目的在于克服现有技术的缺陷，提供了一种与绵羊尾脂重相关的分子标记及其应用。

本发明基于全基因组重测序数据，使用两组间的遗传分化系数(F_st)检测尾脂选择信号，将F_st值较大的染色体区作为受选择的候选区域，结果发现在绵羊13号染色体48905555-49105512区域的F_st值较大，因此对其部分DNA序列进行PCR扩增和序列分析，发现在13号染色体第48979196位存在一个C/G多态性位点，进一步使用KASPar引物对对570只湖羊的多态性位点进行检测和建立最小二乘模型，对基因型与尾脂重进行关联分析，最终确定了本发明扩增的片段可以作为与绵羊尾脂重相关的分子标记。