[发明专利]一种长单链DNA的制备方法有效

专利信息
申请号: 201910989379.6 申请日: 2019-10-17
公开(公告)号: CN110699407B 公开(公告)日: 2023-08-01
发明(设计)人: 顾宏周;张俏;夏凯 申请(专利权)人: 复旦大学附属肿瘤医院
主分类号: C12P19/34 分类号: C12P19/34;C12N9/22
代理公司: 上海容慧专利代理事务所(普通合伙) 31287 代理人: 于晓菁
地址: 200032 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 长单链 dna 制备 方法
【权利要求书】:

1.一种长单链DNA的制备方法,其特征在于,包括设计并构建重组噬菌粒,获得噬菌粒环状单链DNA,以及同时采用I类脱氧核酶和II类脱氧核酶突变体切割环状单链DNA的步骤;

所述设计并构建重组噬菌粒,包括在目标单链DNA序列的5'端和3'端分别添加I类脱氧核酶和II类脱氧核酶突变体的底物域序列,或分别添加I类脱氧核酶和II类脱氧核酶突变体序列;

所述I类脱氧核酶为I-R3,其底物域序列如SEQ ID NO:1所示,酶域序列如SEQ ID NO:2所示的序列;

所述II类脱氧核酶突变体为II-R1a,II-R1b,II-R1c,II-R1d中的一种,所述II类脱氧核酶突变体为II-R1a的底物域序列如SEQ ID NO:3所示,酶域序列如SEQ ID NO:4所示的序列;

所述II类脱氧核酶突变体为II-R1b的底物域序列如SEQ ID NO:5所示,酶域序列如SEQID NO:6所示的序列;

所述II类脱氧核酶突变体为II-R1c的底物域序列如SEQ ID NO:7所示,酶域序列如SEQID NO:8所示的序列;

所述II类脱氧核酶突变体为II-R1d的底物域序列如SEQ ID NO:9所示,酶域序列如SEQID NO:10所示的序列。

2.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于,所述获得噬菌体环状单链DNA,包括将构建好的重组噬菌粒转化大肠杆菌细胞内进行复制,之后通过辅助噬菌体的侵染,离心去除大肠杆菌,收集上清并沉淀噬菌体颗粒,再利用碱裂解法剥去噬菌体蛋白外壳,即可得到所述环状单链DNA。

3.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于,在切割环状单链DNA的步骤之后,还包括纯化回收酶切得到的所述长单链DNA。

4.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于,所述同时采用I类脱氧核酶和II类脱氧核酶突变体切割环状单链DNA的温度为37℃-50℃,时间为0.5h-24h。

5.权利要求1-4任一项所述的制备方法或权利要求1-4任一项的制备方法制得的长单链DNA在DNA纳米、基因编辑、基因治疗、DNA探针等方面的应用。

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