[发明专利]用于质谱诊断地中海贫血症的特征蛋白质谱模型及其用途在审
| 申请号: | 201910945999.X | 申请日: | 2019-10-01 |
| 公开(公告)号: | CN110658252A | 公开(公告)日: | 2020-01-07 |
| 发明(设计)人: | 常亮;牛燕燕;吕倩;王兴宇;付书辉;马庆伟;向华 | 申请(专利权)人: | 长沙湘华质谱医学科技有限公司 |
| 主分类号: | G01N27/62 | 分类号: | G01N27/62;G01N33/68;G01N33/72 |
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| 地址: | 410205 湖南省长沙市长沙高新*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 地中海贫血症 特征蛋白 药物疗效评价 质谱模型 筛查 治疗 地中海贫血 诊断 效果评价 药物疗效 种检测 可用 | ||
1.一种用于诊断地中海贫血的特征蛋白的质谱模型,该质谱模型包括序列分别如SEQID No.1-3所示的特征蛋白标记组合物,其中,该质谱模型的制备方法包括:
1)收集多例临床确诊的患者全血和正常对照人员的全血作为两组全血标本,进行低温冷冻备用;
2)对全血蛋白多肽进行质谱前预处理;
3)对预处理过的两组全血多肽进行质谱检测读取,获得两组全血多肽的指纹图谱;
4)对所有的癌患者和正常人全血多肽的指纹图谱进行标准化处理,并收集数据;
5)对所得数据进实验质控处理,共有以下质谱峰(m/z):5042,5809,5933,6986,7562,7667,7932,8085,8475,8580,15120,15329,15859,15989
6)从步骤5)中筛选出具有下述质荷比的3个地中海贫血症特征多肽峰:15120m/z,15859m/z,15989m/z的三个蛋白峰,并根据所述蛋白多肽标记和质荷比峰的变化建立用于诊断地中海贫血症的质谱模型,其中,所述3个地中海贫血症特征蛋白的多肽序列均为正常对照蛋白,序列分别如SEQ ID No.1-3所示。
2.权利要求1的质谱模型,其中所述三个蛋白峰的m/z偏差允许范围±0.15%,以及,健康人群特征蛋白(SEQ ID NO:1-2)峰的表征质荷比分别为:15120m/z(α珠蛋白片段)或15119m/z(α珠蛋白片段)、15859m/z(β珠蛋白片段)或15867m/z(β珠蛋白片段),和/或,所述地中海贫血患者特征蛋白(SEQ ID NO:1-2)峰的表征质荷比分别为:15120m/z(α珠蛋白片段)或15112m/z(α珠蛋白片段)、15859m/z(β珠蛋白片段)或15853m/z(β珠蛋白片段)。
3.权利要求1或2的质谱模型,其中当表征β珠蛋白片段峰的15859m/z下调表达或2岁以上人群中表征ν珠蛋白片段峰的15989m/z上调表达,预示被检测人为地中海贫血患者或潜在患者;地中海贫血患者治疗后,当表征ν珠蛋白片段峰的15989m/z相对于原表达量而上调表达时,预示被检测人的药物疗效效果比较好,可以继续使用该药物或该方法进行治疗。
4.权利要求3的质谱模型,其中以15120m/z峰强度作为标准强度1,
将15859m/z峰强度的临界值设定为0.5;当15859m/z表达低于0.5时,预示被检测人为地中海贫血患者或潜在患者;在疗效追踪过程中,当15989m/z相对于原表达量的上调表达超过0.1时,预示被检测人为地中海贫血患者或潜在患者当前采用的治疗方法或是药物疗效较好。
5.权利要求1-5的质谱模型,其中步骤2)样本处理过程中,预先加入接近待检蛋白分子量范围的1-3种内标蛋白标准品,优选脱辅基肌红蛋白(Apomyoglobin)的标准品进行相对定量,能更加准确地对血红蛋白进行相对定量,其中所述脱辅基肌红蛋白(Apomyoglobin的蛋白质谱峰值m/z为16952。
6.通过权利要求1-5的质谱模型所制备的用于诊断地中海贫血症的诊断产品。
7.权利要求6的诊断产品,其中所述诊断产品选自诊断试剂盒,该试剂盒由全血质控品、缓冲液、基质溶液组成,基于飞行时间质谱的地中海贫血检测软件、地中海贫血质谱检测专用靶板,该试剂盒可用于待测样品进行质谱时提供标准数据或曲线的比对,以判断待测样品中是否是地中海贫血患者或是药物及治疗方法是否有效。
8.权利要求7的诊断产品,其中该试剂盒还包含用于进行相对定量的内标蛋白标准品脱辅基肌红蛋白(Apomyoglobin),该内标蛋白标准品接近特征蛋白检测范围,通过比较内标蛋白的峰值强度,可直接换算出特征蛋白的峰值绝对强度及其上调或下调的变化值,其中该蛋白质谱峰值m/z为16952。
9.通过权利要求1-5所述的质谱模型,在制备诊断地中海贫血症的产品中的用途。
10.权利要求9的用途,其中所述产品包括:诊断试剂、检测专用靶板、芯片、载体、试剂盒等。
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