[发明专利]一种遗传性耳聋基因的检测方法在审
| 申请号: | 201910928542.8 | 申请日: | 2019-09-28 |
| 公开(公告)号: | CN110628876A | 公开(公告)日: | 2019-12-31 |
| 发明(设计)人: | 车万里 | 申请(专利权)人: | 北京安博迪恩生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6837 | 分类号: | C12Q1/6837;C12Q1/6883 |
| 代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
| 地址: | 100071 北京市丰台*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 假阳性 退火 基因芯片检测 技术方案要点 遗传性耳聋 反应条件 基因检测 基因芯片 扩增反应 探针杂交 突变基因 次循环 灵敏性 预变性 检测 延伸 变性 耳聋 保温 基因 概率 | ||
1.一种遗传性耳聋基因的检测方法,其特征在于:包括以下步骤:
(a)提取待测样本的基因组DNA;
(b)PCR扩增杂交产物:扩增反应条件为:35-37℃保温3-5min,94-95℃预变性3-5min,95-96℃变性30-32s,55-58℃退火30-32s,68-72℃延伸42-46s,35-38次循环,60-65℃延伸8-12min;
(c)PCR产物与基因芯片杂交:制备磁珠、磁珠纯化、磁珠富集PCR产物、PCR产物变性、制备杂交反应混合物、基因芯片杂交;
(d)基因芯片的洗涤与干燥;
(e)基因芯片的结果分析;
所述基因芯片含有遗传性耳聋突变基因的特异性探针。
2.根据权利要求1所述的遗传性耳聋基因的检测方法,其特征在于:所述步骤(b)中,变性到退火之间的降温速率为0.4-0.8℃/s,退火到延伸之间的升温速率为0.2-0.6℃/s。
3.根据权利要求1所述的遗传性耳聋基因的检测方法,其特征在于:所述步骤(b)中,PCR扩增体系包括:5×Buffer为5.0μl,上游引物为1.0μl,下游引物为2.0μl,dNTP为2.0μl,模板DNA为1.0μl,Prime STAR为0.3μl,ddH2O为13.7μl,总体积为25μl。
4.根据权利要求1所述的遗传性耳聋基因的检测方法,其特征在于:所述步骤(c)中,磁珠富集PCR产物的步骤包括:
(i)将纯化后的磁珠与PCR产物吹吸5-10次混匀,静置5-8min,得到PCR产物-磁珠混合物;
(ii)将产物-磁珠混合物用磁力吸附至溶液澄清,弃去溶液。
5.根据权利要求1所述的遗传性耳聋基因的检测方法,其特征在于:所述步骤(c)中,基因芯片杂交的温度为45-55℃,时间为50-70min。
6.根据权利要求1所述的遗传性耳聋基因的检测方法,其特征在于:所述步骤(d)中,基因芯片洗涤采用洗涤液进行洗涤;洗涤液包括洗涤液I和洗涤液II;
洗涤液I,按体积百分比包括以下组分:ddH2O 96-98%,20×SSC 1.2-2%,10%SDS 0.8-2%;洗涤液II,按体积百分比包括以下组分:ddH2O 99-99.9%,20×SSC按照0.2-0.5%。
7.根据权利要求6所述的遗传性耳聋基因的检测方法,其特征在于:所述步骤(d)中,基因芯片洗涤的洗涤程序包括以下步骤:
(i)洗涤液I的洗涤条件:温度35-38℃,时间130-140s;
(i)洗涤液II的洗涤条件:温度35-38℃,时间100-110s。
8.根据权利要求1所述的遗传性耳聋基因的检测方法,其特征在于:所述基因芯片至少包含一个阳性对照和一个阴性对照。
9.根据权利要求1所述的遗传性耳聋基因的检测方法,其特征在于:所述阳性对照为多聚PolyT,阴性对照为ddH2O。
10.根据权利要求3所述的遗传性耳聋基因的检测方法,其特征在于:所述PCR扩增体系中,上游引物和下游引物的浓度均为0.1-0.5μM。
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