[发明专利]一种遗传性耳聋基因的检测方法在审

专利信息
申请号: 201910928542.8 申请日: 2019-09-28
公开(公告)号: CN110628876A 公开(公告)日: 2019-12-31
发明(设计)人: 车万里 申请(专利权)人: 北京安博迪恩生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6837 分类号: C12Q1/6837;C12Q1/6883
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 100071 北京市丰台*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 假阳性 退火 基因芯片检测 技术方案要点 遗传性耳聋 反应条件 基因检测 基因芯片 扩增反应 探针杂交 突变基因 次循环 灵敏性 预变性 检测 延伸 变性 耳聋 保温 基因 概率
【权利要求书】:

1.一种遗传性耳聋基因的检测方法,其特征在于:包括以下步骤:

(a)提取待测样本的基因组DNA;

(b)PCR扩增杂交产物:扩增反应条件为:35-37℃保温3-5min,94-95℃预变性3-5min,95-96℃变性30-32s,55-58℃退火30-32s,68-72℃延伸42-46s,35-38次循环,60-65℃延伸8-12min;

(c)PCR产物与基因芯片杂交:制备磁珠、磁珠纯化、磁珠富集PCR产物、PCR产物变性、制备杂交反应混合物、基因芯片杂交;

(d)基因芯片的洗涤与干燥;

(e)基因芯片的结果分析;

所述基因芯片含有遗传性耳聋突变基因的特异性探针。

2.根据权利要求1所述的遗传性耳聋基因的检测方法,其特征在于:所述步骤(b)中,变性到退火之间的降温速率为0.4-0.8℃/s,退火到延伸之间的升温速率为0.2-0.6℃/s。

3.根据权利要求1所述的遗传性耳聋基因的检测方法,其特征在于:所述步骤(b)中,PCR扩增体系包括:5×Buffer为5.0μl,上游引物为1.0μl,下游引物为2.0μl,dNTP为2.0μl,模板DNA为1.0μl,Prime STAR为0.3μl,ddH2O为13.7μl,总体积为25μl。

4.根据权利要求1所述的遗传性耳聋基因的检测方法,其特征在于:所述步骤(c)中,磁珠富集PCR产物的步骤包括:

(i)将纯化后的磁珠与PCR产物吹吸5-10次混匀,静置5-8min,得到PCR产物-磁珠混合物;

(ii)将产物-磁珠混合物用磁力吸附至溶液澄清,弃去溶液。

5.根据权利要求1所述的遗传性耳聋基因的检测方法,其特征在于:所述步骤(c)中,基因芯片杂交的温度为45-55℃,时间为50-70min。

6.根据权利要求1所述的遗传性耳聋基因的检测方法,其特征在于:所述步骤(d)中,基因芯片洗涤采用洗涤液进行洗涤;洗涤液包括洗涤液I和洗涤液II;

洗涤液I,按体积百分比包括以下组分:ddH2O 96-98%,20×SSC 1.2-2%,10%SDS 0.8-2%;洗涤液II,按体积百分比包括以下组分:ddH2O 99-99.9%,20×SSC按照0.2-0.5%。

7.根据权利要求6所述的遗传性耳聋基因的检测方法,其特征在于:所述步骤(d)中,基因芯片洗涤的洗涤程序包括以下步骤:

(i)洗涤液I的洗涤条件:温度35-38℃,时间130-140s;

(i)洗涤液II的洗涤条件:温度35-38℃,时间100-110s。

8.根据权利要求1所述的遗传性耳聋基因的检测方法,其特征在于:所述基因芯片至少包含一个阳性对照和一个阴性对照。

9.根据权利要求1所述的遗传性耳聋基因的检测方法,其特征在于:所述阳性对照为多聚PolyT,阴性对照为ddH2O。

10.根据权利要求3所述的遗传性耳聋基因的检测方法,其特征在于:所述PCR扩增体系中,上游引物和下游引物的浓度均为0.1-0.5μM。

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