[发明专利]一种检测肺动脉高压病的Caveolin-1基因探针组及其应用

说明书

本发明公开了一种检测肺动脉高压病的Caveolin‑1基因探针组，所述基因探针组是用于检测细胞质膜微囊蛋白‑1(Caveolin‑1)基因突变的基因探针组合物，所述基因探针组合物由237条探针组成，本发明还公开了上述Caveolin‑1基因探针组在制备肺动脉高压病的诊断试剂盒方面的应用以及利用上述Caveolin‑1基因探针组进行的非疾病诊断治疗目的的肺动脉高压病的基因突变体外检测方法。

技术领域

本发明属于基因突变技术领域，具体涉及一种检测肺动脉高压病的Caveolin-1基因探针组及其应用。

背景技术

肺动脉高压(PH)是一种在静息状态下，经右心导管检测平均肺动脉压力≥20mmHg的肺血管疾病。美国50家医院入院记录数据显示特发性和家族性PH人数占PH患者总人数的49.7％，其中部分特发性和家族性PH患者是细胞质膜微囊蛋白-1(Caveolin-1)基因突变携带者。因此设计用于BMPR2基因突变检测的基因探针对于PH精准诊疗具有重要的意义。

发明内容

本发明的目的在于提供一种检测肺动脉高压病的Caveolin-1基因探针组。

本发明的目的还在于提供上述Caveolin-1基因探针组在制备肺动脉高压病的诊断试剂盒方面的应用。

本发明的最后一个目的在于提供一种非疾病诊断治疗目的的肺动脉高压病的基因突变体外检测方法。

本发明的上述第一个目的是通过如下技术方案来实现的：一种检测肺动脉高压病的Caveolin-1基因探针组，所述基因探针组是用于检测细胞质膜微囊蛋白-1(Caveolin-1)基因突变的基因探针组合物，所述基因探针组合物由以下237条探针组成，具体如下所示(基因探针在人类参考基因组HG19对应染色体上的位置)：

本发明中的Caveolin-1基因探针组是用于肺动脉高压相关基因Caveolin-1基因突变检测的探针组合，该基因探针组包括针对Caveolin-1基因5’UTR区、外显子区、剪切区和3’UTR区的一组探针组合物。

优选的，所述探针组合物覆盖上述Caveolin-1基因的外显子区和表达调控区，是用于检测Caveolin-1基因的致病碱基突变如碱基替换、基因缺失、基因插入的探针组合物。

优选的，所述探针组合物中每两个相邻的探针序列之间存在重叠，每两个相邻的探针序列之间的重叠的长度为每条探针长度的1/2～2/3，在每条探针上形成两层或三层的探针覆盖区域。

本发明的上述第二个目的可以通过如下技术方案来实现：上述Caveolin-1基因探针组在制备肺动脉高压病的诊断试剂盒方面的应用。

本发明的上述最后一个目的可以通过如下技术方案来实现：一种非疾病诊断治疗目的的肺动脉高压病的基因突变体外检测方法，包括以下步骤：

(1)提取受试者的基因组DNA，或者提取受试者的RNA，反转录成cDNA；

(2)将所述DNA或cDNA打断至150-200bp的范围；

(3)对上述打断的DNA采用illumina TruSeq DNA library preparation试剂盒，进行DNA小片段文库的制备；

(4)将DNA小片段文库和上述的Caveolin-1基因探针组进行杂交，检测基因突变。

本发明的优点是：相对于全基因组测序，大大节约了所需要的测序数据量；一次性检测致病基因的所有突变，实现对疾病基因诊断的零遗漏，为疾病的治疗和干预提供保障；高深度的测序，实现对基因突变的高准确性检测；成本低，对测序数据量要求不高；高深度测序实现对突变检测的准确性。