[发明专利]采用实时荧光定量PCR技术检测黔北麻羊CTSB基因组织表达谱的方法在审
申请号: | 201910794203.5 | 申请日: | 2019-08-27 |
公开(公告)号: | CN110331191A | 公开(公告)日: | 2019-10-15 |
发明(设计)人: | 陈祥;周志楠;洪磊;敖叶;吴雨;唐文;韦仕南 | 申请(专利权)人: | 贵州大学 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851 |
代理公司: | 贵阳中新专利商标事务所 52100 | 代理人: | 李亮;程新敏 |
地址: | 550025 贵州省贵*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 实时荧光定量PCR 基因组织 技术检测 表达谱 特异性强 有效解决 自动化 污染 | ||
1.一种采用实时荧光定量PCR技术检测黔北麻羊CTSB基因组织表达谱的方法,其特征在于:包括如下步骤:
(1)提取屠宰后的发情期产单羔、产多羔的黔北麻羊母羊下丘脑、垂体、子宫、输卵管和卵巢10个性腺组织的总RNA;采用超微量分光光度计与1%琼脂糖凝胶电泳检测提取总RNA的特异性、完整性以及纯度;
(2)对提取的符合要求的总RNA依据逆转录试剂盒合成cDNA第一链;并以逆转录后的cDNA第一链为模板,分别对目的基因CTSB和内参基因β-actin进行普通PCR扩增;
(3)目的基因CTSB上游引物的序列为5'-TGACTCGCATGTAGGTTGC-3'、下游引物的序列为5'-TGGAGACGCTGTAGGAA-3';内参基因β-actin上游引物的序列为5'-AGATGTGGATCAGCAAGCAG-3'、下游引物的序列为5'-CCAATCTCATCTCGTTTTCTG-3';PCR扩增产物使用1.5%琼脂糖凝胶电泳进行检测。
(4)将电泳检测出的目的条带切下,切胶回收产物与pMD19-T载体连接,再转化为大肠杆菌DH5α感受态细胞,经蓝白斑筛选后,将鉴定为阳性的菌液进行测序,将测序正确的菌液进行扩繁与质粒提取工作,并将获得的重组质粒进行定量稀释,以稀释后的重组质粒作为模板,采用实时荧光定量PCR扩增目的基因CTSB与内参基因β-actin,获得标准曲线与熔解曲线;利用2-ΔΔCt相对定量法计算目的基因CTSB的相对表达量,并检测差异表达量。
2.根据权利要求1所述的采用实时荧光定量PCR技术检测黔北麻羊CTSB基因组织表达谱的方法,其特征在于:步骤(2)中对目的基因CTSB和内参基因β-actin进行扩增时,PCR程序为:预变性95℃5min,95℃变性30s,55℃退火45s,72℃延伸30s,72℃终延伸7min;反应体系为20μL,其中包括:2x Taq PCR Master Mix 10μL,DNA模板2μL,上、下游引物各1μL,ddH2O 6μL。
3.根据权利要求1所述的采用实时荧光定量PCR技术检测黔北麻羊CTSB基因组织表达谱的方法,其特征在于:步骤(4)中切胶回收产物与pMD-19T载体进行连接的体系为10μL,其中包括pMDTM19-T Vector 1μL,切胶回收产物4μL,Solution I连接酶5μL,16℃金属浴连接12h。
4.根据权利要求1所述的采用实时荧光定量PCR技术检测黔北麻羊CTSB基因组织表达谱的方法,其特征在于:步骤(4)中转化为大肠杆菌感受态细胞的方法如下:
1)将大肠杆菌DH5α感受态细胞置于冰上解冻后轻轻摇晃将细胞悬浮;
2)将金属浴过夜连接的连接液加入大肠杆菌DH5α感受态细胞中,并用枪头轻轻将细胞与连接液混匀,放置冰上静置20min;
3)在将其放入42℃水浴锅内恒温加热90s,加热后放置冰上冷却10min;
4)向试管中加入普通液体培养基,放置摇箱内以37℃,200rpm振荡1h;
5)振荡后的体液放入冷冻离心机中5000rpm离心5min,离心管底部有细胞析出,用枪头吸掉上清液,用枪头来回吹打剩余的培养基将细胞与培养基混匀;
6)将细胞悬液均匀的涂在含有X-gal和IPTG的含AMP的固体培养基平板上;
7)将平板放置37℃恒温箱内1h,待平板表面液体干后倒置培养12-16h。
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