[发明专利]一种用于检测铜绿假单胞菌的引物组、试剂盒及方法在审
申请号: | 201910756956.7 | 申请日: | 2019-08-16 |
公开(公告)号: | CN110295243A | 公开(公告)日: | 2019-10-01 |
发明(设计)人: | 刘静姿;齐财;黄培;周庭波;韩克兵;王磊 | 申请(专利权)人: | 贵州金玖生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/385 |
代理公司: | 北京艾皮专利代理有限公司 11777 | 代理人: | 李德胜 |
地址: | 550002 贵州省贵阳*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 引物组 铜绿假单胞菌 检测 待测样品 环状引物 外部引物 试剂盒 核酸提取试剂 上游内部引物 生物技术领域 下游内部引物 反应结果 上游 复溶液 甜菜碱 有效地 痰液 | ||
本发明公开了一种用于检测铜绿假单胞菌的引物组、试剂盒及方法,属于生物技术领域。本发明提供的检测方法包括以下步骤:首先,利用核酸提取试剂提取待测样品的DNA,得到DNA提取液;接着,将DNA提取液、复溶液、甜菜碱和引物组进行混合,得到反应液;然后,将反应液进行PCR扩增反应,便可根据PCR扩增反应结果判断待测样品中是否含有铜绿假单胞菌。其中,该引物组包括上游外部引物、下游外部引物、上游内部引物、下游内部引物、上游环状引物和下游环状引物。另外,本发明提供的LAMP引物组具有良好的特异性,使用该引物组可以快速有效地检测出痰液中的铜绿假单胞菌,而且操作简单、方便。
技术领域
本发明涉及生物技术领域,具体是一种用于检测铜绿假单胞菌的引物组、试剂盒及方法。
背景技术
铜绿假单胞菌是一种条件致病菌,是呼吸道感染的常见细菌,其分布十分广泛,在免疫功能受损的病人中能够引起严重感染。
环介导等温扩增法(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是一种新的核酸扩增技术,其具有检测周期短、灵敏度高、设备简单以及产物检测便捷等优点。然而,由于现有LAMP引物组的特异性较差,目前主要是通过LAMP技术来检测食品中的铜绿假单胞菌,其不易对痰液等其他样品中的铜绿假单胞菌进行检测,因此存在着一定的局限性。
发明内容
本发明的目的在于提供一种用于检测铜绿假单胞菌的引物组、试剂盒及方法,以解决上述背景技术中提出的问题。
为实现上述目的,本发明实施例提供如下技术方案:
一种用于检测铜绿假单胞菌的引物组,包括上游外部引物、下游外部引物、上游内部引物、下游内部引物、上游环状引物和下游环状引物;
所述上游外部引物的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:1所示:CGGSGCWGTCSAGAAC;
所述下游外部引物的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:2所示:TGSCGGAAAWGCCGWAAG;
所述上游内部引物的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:3所示:ACCSTCGATACGSTTTCCCGTWGTGAGGWGTSCGWGTGGTT;
所述下游内部引物的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:4所示:TCSAATCCCTCSCTCACCGSGGTGCSGAAATGWAAAWGGC;
所述上游环状引物的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:5所示:TCSAGSCGTGCWCCTTC;
所述下游环状引物的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:6所示:AWGGCCSGGCTWATCWAGTT;
其中,上述核苷酸序列中的W代表A或T,S代表G或C。
本发明实施例还提供了一种用于检测铜绿假单胞菌的试剂盒,其包括核酸提取试剂、复溶液、甜菜碱以及引物组混合物,所述的引物组混合物包括上述引物组中的各个引物。
本发明实施例提供的另一种优选方案,所述的引物组混合物包括以下按照体积份计的组分:上游外部引物4-6份、下游外部引物4-6份、上游内部引物3-5份、下游内部引物3-5份、上游环状引物18-22份、下游环状引物18-22份。
本发明实施例提供的另一种优选方案,所述的引物组中,上游外部引物和下游外部引物的摩尔浓度均为4-6pmol/μL。
本发明实施例提供的另一种优选方案,所述的引物组中,上游内部引物和下游内部引物的摩尔浓度均为30-50pmol/μL。
本发明实施例提供的另一种优选方案,所述的引物组中,上游环状引物和下游环状引物的摩尔浓度均为10-30pmol/μL。
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