[发明专利]一种肉制品中PCR反应检测鼠源性成分的体系及方法在审
申请号: | 201910749949.4 | 申请日: | 2019-08-14 |
公开(公告)号: | CN110527712A | 公开(公告)日: | 2019-12-03 |
发明(设计)人: | 刘慧玲;涂晓波;赵芳;万志刚;吕敬章;黄欣迪;匡燕云 | 申请(专利权)人: | 深圳市检验检疫科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 44314 深圳市瑞方达知识产权事务所(普通合伙) | 代理人: | 张秋红;林俭良<国际申请>=<国际公布> |
地址: | 518000 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 荧光标记探针 实时荧光PCR 碱基序列 鼠源性 待测样品 肉制品 反应混合液 检测灵敏度 上游引物F 下游引物R 合成引物 基因序列 染料混合 上游引物 设计引物 下游引物 双蒸水 检测 参比 参考 分析 | ||
1.一种肉制品中PCR反应检测鼠源性成分的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1、提取待测样品DNA;
S2、设计引物和荧光标记探针:以16S rRNA基因为参考,从GenBank中获取基因序列作为模板,合成引物和荧光标记探针;
上游引物F的碱基序列:
5’-TCCAGGTCGGTTTCTATC-3’;
下游引物R的碱基序列:
5’-TCTGCCACCCTAATAACC-3’;
荧光标记探针序列P的碱基序列:
5’-FAM-AGTACGAAAGGACA-MGB-3’;
S3、建立实时荧光PCR反应体系:将步骤S1提取的待测样品DNA作为模板;将实时荧光PCR反应混合液、所述DNA模板、所述上游引物、所述下游引物、所述荧光标记探针、Rox参比染料混合并采用双蒸水补足,建立所述实时荧光PCR反应体系;
S4、PCR扩增反应:将所述实时荧光PCR反应体系置于95℃的温度条件下进行预变性反应;再将置于95℃的温度条件下进行变性反应,并于60℃的温度条件下退火,依次循环30~45次,于60℃收集荧光信号;
S5、分析鼠源性成分:测定并计算实时荧光PCR反应物的平均Ct值,并判断待测样品中是否含有鼠源性成分;
当Ct值≤35.0,则判定为待测样品含有鼠源性成分;
当Ct值≥40.0,则判定为待测样品不含有鼠源性成分;
当35.0<Ct值<40.0,则重复步骤S1~S4,当再次扩增后Ct值仍为<40.0,则判定待测样品含有鼠源性成分;当再次扩增后Ct值≥40.0,则判定为待测样品不含有鼠源性成分。
2.根据权利要求1所述的肉制品中PCR反应检测鼠源性成分的方法,其特征在于,所述S1步骤包括以下步骤:取待测样品于离心管中,加入裂解液,进行离心反应并于离心后取其上清液;加入溶剂混匀;加入沉淀剂以形成沉淀,去除上清液,并对所述沉淀进行洗涤,晾干;加入溶剂溶解所述沉淀,制成DNA溶液并于-20℃保存待用;
或者,所述S1步骤包括采用DNA提取试剂盒,提取待测样品的组织中的基因组DNA。
3.根据权利要求2所述的肉制品中PCR反应检测鼠源性成分的方法,其特征在于,所述DNA溶液的浓度为10μg/mL~100μg/mL,且A260/A280吸光值比在1.7~1.9之间。
4.根据权利要求1所述的肉制品中PCR反应检测鼠源性成分的方法,其特征在于,在所述S3步骤中,所述上游引物的浓度为10μmol/L。
5.根据权利要求1所述的肉制品中PCR反应检测鼠源性成分的方法,其特征在于,在所述S3步骤中,所述下游引物的浓度为10μmol/L。
6.根据权利要求1所述的肉制品中PCR反应检测鼠源性成分的方法,其特征在于,在所述S3步骤中,所述荧光标记探针的浓度为10μmol/L。
7.根据权利要求1所述的肉制品中PCR反应检测鼠源性成分的方法,其特征在于,在所述S3步骤中,所述上游引物与所述荧光标记探针的用量比例可以为1:1;
所述下游引物与所述荧光标记探针的用量比例可以为1:1。
8.根据权利要求3所述的肉制品中PCR反应检测鼠源性成分的方法,其特征在于,在所述S3步骤中,各组分的体积比为:
实时荧光PCR反应混合液:50%;
上游引物:4%;
下游引物:4%;
荧光标记探针:4%;
待测样品DNA模板:4%;
Rox参比染料:1%
双蒸水:余量。
9.根据权利要求1所述的肉制品中PCR反应检测鼠源性成分的方法,其特征在于,在所述S4步骤中,通过将所述实时荧光PCR反应体系置于荧光PCR仪上并设定对应参数以进行PCR扩增。
10.一种肉制品中PCR反应检测鼠源性成分的体系,应用于权利要求1至9任一项所述的肉制品中PCR反应检测鼠源性成分的方法,其特征在于,包括实时荧光PCR反应混合液、上游引物、下游引物、荧光标记探针、待测样品DNA模板、Rox参比染料、双蒸水;
其中,上游引物F的碱基序列:
5’-TCCAGGTCGGTTTCTATC-3’;
下游引物R的碱基序列:
5’-TCTGCCACCCTAATAACC-3’
荧光标记探针序列P的碱基序列:
5’-FAM-AGTACGAAAGGACA-MGB-3’。
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