[发明专利]一组用于鉴别乌龟、花龟及其杂交种的SNP标记有效
| 申请号: | 201910691177.3 | 申请日: | 2019-07-29 |
| 公开(公告)号: | CN110317883B | 公开(公告)日: | 2022-10-21 |
| 发明(设计)人: | 汪波;聂晶;胡敏;徐玲;肖凌;周豫新;黄小清;覃桂 | 申请(专利权)人: | 湖北省药品监督检验研究院 |
| 主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6869 |
| 代理公司: | 武汉智嘉联合知识产权代理事务所(普通合伙) 42231 | 代理人: | 徐绍新 |
| 地址: | 430075 湖北省武*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一组 用于 鉴别 乌龟 及其 杂交种 snp 标记 | ||
1.一组用于鉴别乌龟、花龟及其杂交种的SNP标记,其特征在于,所述SNP标记为:
第一SNP标记,所述第一SNP标记的多态性位点位于SEQ ID NO:1所示核苷酸序列的第88位,该位点的碱基为A或G,或
第二SNP标记,所述第二SNP标记的多态性位点位于SEQ ID NO:2所示核苷酸序列的第105位,该位点的碱基为T或C,或
第三SNP标记,所述第三SNP标记的多态性位点位于SEQ ID NO:3所示核苷酸序列的第178位,该位点的碱基为C或T,或
第四SNP标记,所述第四SNP标记的多态性位点位于SEQ ID NO:4所示核苷酸序列的第233位,该位点的碱基为C或T。
2.一组用于检测权利要求1所述的SNP标记的引物对,其特征在于,所述引物对为:
第一引物对,所述第一引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO:5-6所示,用于检测所述第一SNP标记,或
第二引物对,所述第二引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO:7-8所示,用于检测所述第二SNP标记,或
第三引物对,所述第三引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO:9-10所示,用于检测所述第三SNP标记,或
第四引物对,所述第四引物对的核苷酸序列如SEQ ID NO:11-12所示,用于检测所述第四SNP标记。
3.权利要求1所述的一组SNP标记或权利要求2所述的一组引物对在鉴别乌龟、花龟及其杂交种中的用途。
4.一种鉴别乌龟、花龟及其杂交种的方法,其特征在于包括以下步骤:
1)提取待测样品的基因组DNA;
2)以待测样品的基因组DNA为模板,利用权利要求2中所述的引物对进行PCR扩增;
3)对步骤2)的PCR扩增产物进行测序;
4)根据测序结果在所选SNP标记处的不同,对样品来源进行鉴定。
5.如权利要求4所述鉴别乌龟、花龟及其杂交种的方法,其特征在于:
1)若选用第一引物对进行PCR扩增,则PCR产物核酸序列的第一SNP标记为单峰且碱基为A,判定为乌龟;为单峰且碱基为G,判定为花龟;为双峰且碱基为A/G,判定为杂交种;
2)若选用第二引物对进行PCR扩增,则PCR产物核酸序列的第二SNP标记为单峰且碱基为T,判定为乌龟;为单峰且碱基为C,判定为花龟;为双峰且碱基为T/C,判定为杂交种;
3)若选用第三引物对进行PCR扩增,则PCR产物核酸序列的第三SNP标记为单峰且碱基为C,判定为乌龟;为单峰且碱基为T,判定为花龟;为双峰且碱基为C/T,判定为杂交种;
4)若选用第四引物对进行PCR扩增,则PCR产物核酸序列的第四SNP标记为单峰且碱基为C,判定为乌龟;为单峰且碱基为T,判定为花龟;为双峰且碱基为C/T,判定为杂交种。
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