[发明专利]一种基于COPB2与NUPR1的前列腺癌预测系统在审
| 申请号: | 201910672776.0 | 申请日: | 2019-07-24 |
| 公开(公告)号: | CN111004847A | 公开(公告)日: | 2020-04-14 |
| 发明(设计)人: | 糜远源;祝黎洁;邵红宝;汪骏 | 申请(专利权)人: | 无锡市第三人民医院 |
| 主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G01N33/68;G01N33/574 |
| 代理公司: | 北京中政联科专利代理事务所(普通合伙) 11489 | 代理人: | 郭晓佩 |
| 地址: | 214000 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基于 copb2 nupr1 前列腺癌 预测 系统 | ||
1.一种基于COPB2与NUPR1的前列腺癌预测系统,其特征在于,所述系统涉及以下步骤:
S1、研究COPB2、NUPR1单个或者组合的表达量与临床PCA的关系,以及与CRPC患者进展及预后相关性;
S2、探索COPB2与NUPR1在前列腺癌中互相调控的关系,并探索对肿瘤增殖和侵袭的影响及其关键机制,所述S2具体的包括以下步骤:
A1、Affymetrix全基因表达谱芯片的制作及IPA分析;
A2、研究COPB2与NUPR1在前列腺癌中相互调控并对肿瘤增殖和侵袭的影响;
A3、Co-IP检测COPB2与NUPR1相互结合;
A4、检测COPB2与NUPR1定位变化;
A5、寻找COPB2与NUPR1互相调控下游关键信号。
2.根据权利要求1所述的一种基于COPB2与NUPR1的前列腺癌预测系统,其特征在于,所述S1中:
先收集200例前列腺癌组织标本,病理诊断200例癌及癌旁组织;
免疫组化半定量测定组织中COPB2和NUPR1的表达;
设定染色阳性率评分标准:0%为0分;1-25%为1分;26-50%为2分;51-75%为3分;76-100%为4分,染色程度区分标准:无为0分;低为1分;中为2分;高为3分;
单倍型积分值(IHS)=染色阳性率×染色程度,高于6分为高表达,低于6分为低表达;
将检测结果进行分组:COPB2低表达、COPB2高表达、NUPR1低表达、NUPR1高表达、COPB2高表达+NUPR1低表达、COPB2高表达+NUPR1高表达、COPB2低表达+NUPR1低表达、COPB2低表达+NUPR1高表达;
收集上述200例患者初诊PSA值、病理、预后资料,利用SPSS、Fisher及卡方检验分析分类变量与COPB2和NUPR1表达量的关系,利用Cox回归模型预测复发及进展因素,最后采用Kaplan-Meier分析绘制复发及无病生存曲线。
3.根据权利要求1所述的一种基于COPB2与NUPR1的前列腺癌预测系统,其特征在于,所述A1中具体操作步骤为:
准备COPB2干扰组和阴性对照组,每组3个复孔,提取总RNA,RNA质检,芯片杂交、洗染和扫描,最后完成芯片上机分析;
制作火山图、散点图、聚类图、疾病与功能分析、经典通路分析,并采用IngenuityPathway Analysis软件分析预测COPB2干扰后关键基因的改变,通过Z-score值,激活预测蛋白NUPR1作为研究的对象,利用生物信息学及IPA软件制作NUPR1的调控网络图。
4.根据权利要求1所述的一种基于COPB2与NUPR1的前列腺癌预测系统,其特征在于:所述A2中包括以下部分:
病毒感染细胞、
增殖、侵袭功能学实验、
裸鼠皮下成瘤实验。
5.根据权利要求4所述的一种基于COPB2与NUPR1的前列腺癌预测系统,其特征在于,所述病毒感染细胞具体步骤为:
实验设siCOPB2+siNUPR1、OE-COPB2+siNUPR1、siCOPB2、OE-COPB2、对照COPB2和对照NUPR1共6组,病毒感染PC-3/DU-145/CWR22RV1/LNCaP细胞,预实验确定最佳MOI、感染条件及感染效率,正式实验为感染3天后观察感染效率,每组细胞分为两份,一份提取细胞总RNA,一份提取总蛋白,RNA→cDNA→qRT-PCR检测3组中COPB2mRNA定量表达;根据WesternBlot法步骤检测3组中COPB2蛋白的表达。
6.根据权利要求1所述的一种基于COPB2与NUPR1的前列腺癌预测系统,其特征在于,所述增殖、侵袭功能学实验包括以下内容:
CCK8法检测细胞生长、
流式细胞周期、
流式细胞凋亡、
克隆形成检测细胞增殖能力、
划痕愈合实验检测细胞迁移能力、
检测细胞侵袭能力。
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