[发明专利]一种与小儿先天性心脏病相关的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种与小儿先天性心脏病相关的SNP分子标记，属于医学分子生物学领域。所述分子标记选自MTHFR基因rs1801131和rs1801133中的至少一种，其中rs1801131为A或C，rs1801133为C或T。利用本发明的分子标记可以进行小儿先天性心脏病的辅助诊断，对后续临床治疗具有指导意义。

技术领域

本发明属于医学分子生物学领域，具体地，涉及一种与小儿先天性心脏病相关的SNP分子标记及其应用。

背景技术

先天性心脏病(congenital heart disease，CHD)是心脏、血管在胚胎发育过程中发育障碍所致的心脏、血管形态、结构、功能和代谢上的异常。最新的统计结果显示，存活新生儿中先天性心脏病的发病率为0.07％～1.17％，世界各国报道的发病率无明显差别。根据世界卫生组织的资料，全球每年约有150万儿童出生时患有CHD。我国每年有13万以上的CHD患儿出生，7岁以下儿童中先天性心脏病人数达54万，是造成儿童死亡或伤残的重要原因，并且给社会和家庭带来严重的经济和精神等方面的负担。CHD的病因目前尚未阐明，但多数学者认为，除了少数CHD是单基因突变和染色体畸变所致外，大多数CHD属于多基因遗传病，是由遗传因素和环境因素相互作用造成的，一些先天性心脏病高发家系的研究也证实了这一点。

然而，与先天性心脏病相关的基因突变及其类型仍鲜有报道。

发明内容

为了解决上述技术问题，发明人通过小儿先天性心脏病患者全血检测MTHFR基因的两个多态性位点并检测相关血清学标志物Hcy水平，探讨基因突变与疾病间的相关性。，出乎意料地，MTHFR基因rs1801131、rs1801133位点突变是先天性心脏病的风险因素，从而完成本发明。

本发明的第一方面提供一种与小儿先天性心脏病相关的SNP分子标记，所述分子标记选自MTHFR基因rs1801131和rs1801133中的至少一种，其中rs1801131为A或C，rs1801133为C或T。

MTHFR是同型半胱氨酸(homocysteine，Hcy)代谢关键酶之一。MTHFR基因的突变会导致血浆Hcy水平增高，诱导心血管疾病的发生，Hcy主要通过促进血管内皮细胞损伤、血管平滑肌细胞增殖、脂质过氧化和血液凝固性增高等机制，诱导动脉粥样硬化的发生。

在本发明中，rs1801131 AC基因型或CC基因型患小儿先天性心脏病的风险高于rs1801131 AA基因型。其中，纯合突变型即CC基因型患小儿先天性心脏病的风险最高。

在本发明中，rs1801133 CT基因型或TT基因型患小儿先天性心脏病的风险高于rs1801131 CC基因型。

在本发明中，rs1801131 AC基因型或CC基因型，并且rs1801133 CT基因型或TT基因型患小儿先天性心脏病的风险高于其他基因型。其中，rs1801131CC基因型，并且rs1801133 CT基因型或TT基因型患小儿先天性心脏病的风险最高。

在本发明中，所述小儿先天性心脏病选自冠状动脉粥样硬化性心脏病、原发性高血压、冠心病、动脉硬化。

本发明第二方面提供用于检测本发明第一方面所述SNP分子标记的试剂在制备用于预测和诊断小儿先天性心脏病的试剂盒中的应用。

在本发明的一些实施方案中，所述试剂为能够扩增所述SNP分子标记的引物组合。

在本发明的一些实施方案中，扩增rs1801131的引物组合包括具有SEQ ID NO.1所示核苷酸序列的上游引物和具有SEQ ID NO.2所示核苷酸序列的下游引物；扩增rs1801133的引物组合包括具有SEQ ID NO.3所示核苷酸序列的上游引物和具有SEQ ID NO.4所示核苷酸序列的下游引物。