[发明专利]植物超长DNA的提取方法有效
| 申请号: | 201910567568.4 | 申请日: | 2019-06-27 |
| 公开(公告)号: | CN112143776B | 公开(公告)日: | 2022-11-22 |
| 发明(设计)人: | 程相锦;余晓露;夏琦;朴民圣;汪德鹏 | 申请(专利权)人: | 武汉希望组生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806 |
| 代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 温可睿 |
| 地址: | 430000 湖北省武汉市东湖新技术开*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 植物 超长 dna 提取 方法 | ||
1.植物超长DNA的提取方法,包括:
步骤1:细胞核分离:
样品与匀浆缓冲液以质量-体积比为1g:(8~15)mL混合,以20500rpm~35000rpm匀浆3次~5次,每次15s~25s;
步骤2细胞核纯化:
匀浆液以匀浆缓冲液稀释后过40μm~100μm滤膜,滤液于0~4℃,60rcf~90rcf离心2min~5min,离心后的沉淀以匀浆缓冲液重悬,-4℃~4℃裂解10min~60min;
2000rcf~3000rcf离心15min~25min,沉淀以匀浆缓冲液清洗2~3次,然后用核洗涤缓冲液洗涤2~3次;
步骤3:裂解细胞核:
洗涤后的沉淀以含有RNaseA的核裂解缓冲液于35~40℃裂解0.5~2h,然后以Proteinase K 48℃~52℃酶解2.5~3.5h;所述含有RNaseA的核裂解缓冲液与步骤1中所述样品的质量-体积比为1g:(5~20)mL;
步骤4:核内DNA纯化:
酶解后的细胞核依次经苯酚抽提、苯酚/氯仿/异戊醇抽提、氯仿/异戊醇抽提后,以无水乙醇沉淀,再以70vol%乙醇洗涤,获得植物超长DNA;
所述匀浆缓冲液的pH值为8.0,其由如下组分组成:
所述核裂解缓冲液pH值为8.0,由如下组分组成:
所述核洗涤缓冲液,pH值为8.0,由如下组分组成:
Tris-HCl 50mM;
EDTA 10mM。
2.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于,步骤1中,匀浆的条件为:35000rpm,4次,每次20s。
3.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于,步骤2中:
所述匀浆液与匀浆缓冲液的体积比为1:1;
所述过40μm~100μm滤膜具体为依次过100μm、40μm滤膜;
所述裂解的温度为0℃,时间为30min。
4.根据权利要求1或3所述的提取方法,其特征在于,步骤2具体为:
匀浆液以等体积的匀浆缓冲液稀释后依次过100μm、40μm的滤膜,滤液于0~4℃,80rcf离心3min,离心后的沉淀以匀浆缓冲液重悬,0℃裂解30min;
2500rcf离心20min,沉淀以匀浆缓冲液清洗2~3次,然后用核洗涤缓冲液洗涤2~3次。
5.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于,步骤3中,
所述RNaseA的浓度为3μL/mL,裂解的条件为37℃,1h;
所述Proteinase K的浓度为20μL/mL,酶解的条件为50℃,3h。
6.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于,步骤4中,
所述苯酚抽提后,经4500rcf离心10min,取上清;
所述苯酚/氯仿/异戊醇抽提后,经4500rcf离心10min,取上清;
所述苯酚/氯仿/异戊醇的体积比为25:24:1,三者混合液的体积与上清的体积比为1:1;
所述氯仿/异戊醇抽提后,经4500rcf离心10min,取上清;
所述氯仿/异戊的体积比为24:1,二者混合液的体积与上清的体积比为1:1。
7.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于,所述匀浆缓冲液还包括纤维素酶和/或果胶酶。
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