[发明专利]植物超长DNA的提取方法有效

专利信息
申请号: 201910567568.4 申请日: 2019-06-27
公开(公告)号: CN112143776B 公开(公告)日: 2022-11-22
发明(设计)人: 程相锦;余晓露;夏琦;朴民圣;汪德鹏 申请(专利权)人: 武汉希望组生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806
代理公司: 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 代理人: 温可睿
地址: 430000 湖北省武汉市东湖新技术开*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 植物 超长 dna 提取 方法
【权利要求书】:

1.植物超长DNA的提取方法,包括:

步骤1:细胞核分离:

样品与匀浆缓冲液以质量-体积比为1g:(8~15)mL混合,以20500rpm~35000rpm匀浆3次~5次,每次15s~25s;

步骤2细胞核纯化:

匀浆液以匀浆缓冲液稀释后过40μm~100μm滤膜,滤液于0~4℃,60rcf~90rcf离心2min~5min,离心后的沉淀以匀浆缓冲液重悬,-4℃~4℃裂解10min~60min;

2000rcf~3000rcf离心15min~25min,沉淀以匀浆缓冲液清洗2~3次,然后用核洗涤缓冲液洗涤2~3次;

步骤3:裂解细胞核:

洗涤后的沉淀以含有RNaseA的核裂解缓冲液于35~40℃裂解0.5~2h,然后以Proteinase K 48℃~52℃酶解2.5~3.5h;所述含有RNaseA的核裂解缓冲液与步骤1中所述样品的质量-体积比为1g:(5~20)mL;

步骤4:核内DNA纯化:

酶解后的细胞核依次经苯酚抽提、苯酚/氯仿/异戊醇抽提、氯仿/异戊醇抽提后,以无水乙醇沉淀,再以70vol%乙醇洗涤,获得植物超长DNA;

所述匀浆缓冲液的pH值为8.0,其由如下组分组成:

所述核裂解缓冲液pH值为8.0,由如下组分组成:

所述核洗涤缓冲液,pH值为8.0,由如下组分组成:

Tris-HCl 50mM;

EDTA 10mM。

2.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于,步骤1中,匀浆的条件为:35000rpm,4次,每次20s。

3.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于,步骤2中:

所述匀浆液与匀浆缓冲液的体积比为1:1;

所述过40μm~100μm滤膜具体为依次过100μm、40μm滤膜;

所述裂解的温度为0℃,时间为30min。

4.根据权利要求1或3所述的提取方法,其特征在于,步骤2具体为:

匀浆液以等体积的匀浆缓冲液稀释后依次过100μm、40μm的滤膜,滤液于0~4℃,80rcf离心3min,离心后的沉淀以匀浆缓冲液重悬,0℃裂解30min;

2500rcf离心20min,沉淀以匀浆缓冲液清洗2~3次,然后用核洗涤缓冲液洗涤2~3次。

5.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于,步骤3中,

所述RNaseA的浓度为3μL/mL,裂解的条件为37℃,1h;

所述Proteinase K的浓度为20μL/mL,酶解的条件为50℃,3h。

6.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于,步骤4中,

所述苯酚抽提后,经4500rcf离心10min,取上清;

所述苯酚/氯仿/异戊醇抽提后,经4500rcf离心10min,取上清;

所述苯酚/氯仿/异戊醇的体积比为25:24:1,三者混合液的体积与上清的体积比为1:1;

所述氯仿/异戊醇抽提后,经4500rcf离心10min,取上清;

所述氯仿/异戊的体积比为24:1,二者混合液的体积与上清的体积比为1:1。

7.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于,所述匀浆缓冲液还包括纤维素酶和/或果胶酶。

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