[发明专利]与公猪精子直线运动相关的分子遗传标记及其应用和获取方法

权利要求书

1.与公猪精子直线运动相关的分子遗传标记，其特征在于，所述的分子遗传标记至少包括以下标记之一：

标记一：位于猪第15号染色体的第136112947位核苷酸位点，该位点的碱基为C或T，对应核苷酸序列表SEQ ID NO.1的第101位碱基；

标记二：位于猪第3号染色体的第18505448位核苷酸位点，该位点的碱基序列为A或G，对应核苷酸序列表SEQ ID NO.2的第101位碱基；

标记三：位于猪第11号染色体的第63272581位核苷酸位点，该位点的碱基序列为C或T，对应核苷酸序列表SEQ ID NO.3的第101位碱基。

2.用于扩增权利要求1所述分子遗传标记的引物或鉴定权利要求1所述分子遗传标记的探针。

3.含有权利要求2所述引物或探针的试剂盒。

4.一种如权利要求1所述分子遗传标记在检测公猪精子直线运动能力、辅助猪的人工授精、辅助选育和/或选育精子直线运动能力高的种猪中的应用。

5.一种选育或辅助选育公猪精子直线运动能力高的种猪的方法，其特征在于，所述方法为：提取公猪的总DNA，检测公猪第5号染色体的第136112947位核苷酸或公猪第11号染色体的第63272581位核苷酸，测出第136112947位核苷酸或公猪第11号染色体的第63272581位核苷酸的序列为C或T、或C和T，确定待测猪的基因型是CC型、TT型或CT型，选择CC型基因的公猪进行下一步选种和/或育种；或检测公猪第3号染色体的第18505448位核苷酸位点，测出第18505448位核苷酸的序列为A或G、或A和G，确定待测猪的基因型是AA型、GG型或GA型，选择AA型基因的公猪进行下一步选种和/或育种。

6.根据权利要求5所述的方法，其特征在于，所述CC基因型为公猪第5号染色体的第136112947位核苷酸或公猪第11号染色体的第63272581位核苷酸为C的纯合体；TT基因型为第5号染色体的第136112947位核苷酸或公猪第11号染色体的第63272581位核苷酸为T的纯合体；CT基因型为猪第5号染色体的第136112947位核苷酸或公猪第11号染色体的第63272581位核苷酸为C与T的杂合体；所述AA基因型为公猪第3号染色体的第18505448位核苷酸为A的纯合体；GG基因型为第3号染色体的第18505448位核苷酸为G的纯合体；GA基因型为猪第5号染色体的第18505448位核苷酸为A与G的杂合体。

7.一种获取与公猪精子直线运动相关的分子遗传标记的方法，其特征在于，所述方法为：采集公猪的耳组织样品和/或血液为样品，提取总DNA，并对DNA进行质量检测，获得全基因组的SNP标记基因型；采用基因比对的方法对获得的SNP标记的物理位置，对于基因组位置未知的SNP不用于关联分析，对所有常染色体上的SNP标记，进行质量控制筛选出SNP，之后对筛选出来的SNP进行全基因组关联分析获得分子遗传标记，所述质量控制标准为：个体检出率≥90％；SNP检出率≥90％；最小等位基因频率≥0.01；哈迪温伯格平衡的p值≥10⁶。