[发明专利]药物靶标的预测方法、装置、计算机设备和存储介质

说明书

本申请涉及一种药物靶标的预测方法、装置、计算机设备和存储介质，获取小分子配体、多个蛋白受体的蛋白结构和活性位点数据，根据多个蛋白受体的蛋白结构和活性位点数据分别计算多个蛋白受体的活性中心坐标值和对接盒子的坐标值，从而基于多个蛋白受体的活性中心坐标值和对接盒子的坐标值，将小分子配体与多个蛋白受体分别进行反向对接，并根据反向对接的结果，从多个蛋白受体中预测与小分子配体对应的药物靶标。基于多个蛋白受体的活性中心坐标值和对接盒子的坐标值进行反向对接，提升了小分子配体与多个蛋白受体的对接准确性，解决传统技术中小分子化合物与蛋白质靶标的反向对接准确性不高的技术问题。

技术领域

本申请涉及药物信息学领域，特别是涉及一种药物靶标的预测方法、装置、计算机设备和存储介质。

背景技术

随着高通量蛋白质纯化、结晶学和核磁共振光谱技术的发展，促进了人们更多地了解蛋白质和蛋白质—配体复合物的结构细节。计算策略也渗透到药物发现的各个方面，例如用于药物先导物识别的虚拟筛选技术(Vitrual Screening，VS)。VS技术是一种直接合理的药物发现方法，具有成本低，有效筛查的优点。VS技术包括基于配体的和基于结构的方法。

对于基于结构的药物设计，分子对接成为药物研究中越来越重要的工具。通过找到可以意外地与先导化合物或现有药物结合的靶标，进而能够减少药物的不良副作用，或通过药物重新定位扩大药物的适应症。反向对接技术正是一种通过与蛋白质数据库自动对接来寻找小分子化合物潜在蛋白质靶标的计算机辅助药物设计技术。

但是，在传统技术中，小分子化合物与蛋白质靶标的反向对接存在准确性不高的技术问题。

发明内容

基于此，有必要针对传统技术中小分子化合物与蛋白质靶标的反向对接准确性不高的技术问题，提供一种药物靶标的预测方法、装置、计算机设备和存储介质。

一种药物靶标的预测方法，所述方法包括：

获取需要对接的小分子配体；

获取多个蛋白受体的蛋白结构和活性位点数据；

根据所述多个蛋白受体的蛋白结构和所述活性位点数据分别计算所述多个蛋白受体的活性中心坐标值和对接盒子的坐标值；

基于所述多个蛋白受体的活性中心坐标值和所述对接盒子的坐标值，将所述小分子配体与所述多个蛋白受体分别进行反向对接；

根据反向对接的结果，从所述多个蛋白受体中预测与所述小分子配体对应的药物靶标。

在其中一个实施例中，在所述获取需要对接的小分子配体之前，所述方法还包括：

获取原始小分子配体；

将所述原始小分子配体的存储格式进行格式转换，得到预设格式的小分子配体；

所述获取需要对接的小分子配体，包括：

获取需要对接的所述预设格式的小分子配体。

在其中一个实施例中，在所述获取多个蛋白受体的蛋白结构和活性位点数据之后，所述方法还包括：

将所述多个蛋白受体的存储格式进行格式转换，得到所述预设格式的蛋白受体；

所述基于所述多个蛋白受体的活性中心坐标值和所述对接盒子的坐标值，将所述小分子配体与所述多个蛋白受体分别进行反向对接，包括：

基于所述多个蛋白受体的活性中心坐标值和所述对接盒子的坐标值，将所述预设格式的小分子配体与多个所述预设格式的蛋白受体分别进行反向对接。

在其中一个实施例中，所述预设格式为pdbqt格式。