[发明专利]药物靶标的预测方法、装置、计算机设备和存储介质

权利要求书

1.一种药物靶标的预测方法，其特征在于，所述方法包括：

获取需要对接的小分子配体；

获取多个蛋白受体的蛋白结构和活性位点数据；

根据所述多个蛋白受体的蛋白结构和所述活性位点数据分别计算所述多个蛋白受体的活性中心坐标值和对接盒子的坐标值，所述活性中心坐标值用于确定所述小分子配体与各蛋白受体的对接位置，所述对接盒子的坐标值用于确定所述小分子配体与各蛋白受体的对接空间，且所述对接盒子为小分子配体与蛋白受体最佳结合的对接空间；

基于所述多个蛋白受体的活性中心坐标值和所述对接盒子的坐标值，将所述小分子配体与所述多个蛋白受体分别进行反向对接；

根据反向对接的结果，从所述多个蛋白受体中预测与所述小分子配体对应的药物靶标。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，在所述获取需要对接的小分子配体之前，所述方法还包括：

获取原始小分子配体；

将所述原始小分子配体的存储格式进行格式转换，得到预设格式的小分子配体；

所述获取需要对接的小分子配体，包括：

获取需要对接的所述预设格式的小分子配体。

3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，在所述获取多个蛋白受体的蛋白结构和活性位点数据之后，所述方法还包括：

将所述多个蛋白受体的存储格式进行格式转换，得到所述预设格式的蛋白受体；

所述基于所述多个蛋白受体的活性中心坐标值和所述对接盒子的坐标值，将所述小分子配体与所述多个蛋白受体分别进行反向对接，包括：

基于所述多个蛋白受体的活性中心坐标值和所述对接盒子的坐标值，将所述预设格式的小分子配体与多个所述预设格式的蛋白受体分别进行反向对接。

4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，所述预设格式为pdbqt格式。

5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述基于所述多个蛋白受体的活性中心坐标值和所述对接盒子的坐标值，将所述小分子配体与所述多个蛋白受体分别进行反向对接，包括：

基于所述多个蛋白受体的活性中心坐标值和所述对接盒子的坐标值，利用多线程的方式将所述小分子配体与所述多个蛋白受体分别进行反向对接。

6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述反向对接的结果包括多个对接构象；所述根据反向对接的结果，预测与所述小分子配体对应的药物靶标，包括：

对所述反向对接的结果进行解析，从所述多个对接构象中获取自由能变化最小的对接构象；

根据自由能变化最小的对接构象，预测与所述小分子配体对应的药物靶标。

7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述反向对接的结果还包括对接产生的错误信息；所述方法还包括：

将所述对接构象和所述对接构象的自由能变化值保存在第一路径中；

将所述对接产生的错误信息保存在第二路径中。

8.一种药物靶标的预测装置，其特征在于，所述装置包括：

第一获取模块，用于获取需要对接的小分子配体；

第二获取模块，用于获取多个蛋白受体的蛋白结构和活性位点数据；

计算模块，用于根据所述多个蛋白受体的蛋白结构和所述活性位点数据分别计算所述多个蛋白受体的活性中心坐标值和对接盒子的坐标值，所述活性中心坐标值用于确定所述小分子配体与各蛋白受体的对接位置，所述对接盒子的坐标值用于确定所述小分子配体与各蛋白受体的对接空间，且所述对接盒子为小分子配体与蛋白受体最佳结合的对接空间；

对接模块，用于基于所述多个蛋白受体的活性中心坐标值和所述对接盒子的坐标值，将所述小分子配体与所述多个蛋白受体分别进行反向对接；

预测模块，用于根据反向对接的结果，从所述多个蛋白受体中预测与所述小分子配体对应的药物靶标。

9.一种计算机设备，包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机程序，其特征在于，所述处理器执行所述计算机程序时实现权利要求1至7中任一项所述方法的步骤。

10.一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，其特征在于，所述计算机程序被处理器执行时实现权利要求1至7中任一项所述的方法的步骤。