[发明专利]DNA纳米球及其制备方法和应用有效
| 申请号: | 201910542713.3 | 申请日: | 2019-06-21 |
| 公开(公告)号: | CN112111560B | 公开(公告)日: | 2023-07-25 |
| 发明(设计)人: | 陈莹;杨晋;徐崇钧;黄鑫;赵胜明;章文蔚;陈奥 | 申请(专利权)人: | 深圳华大智造科技股份有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12Q1/6874;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 赵天月 |
| 地址: | 518083 广东省深圳*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | dna 纳米 及其 制备 方法 应用 | ||
1.一种DNA纳米球的制备方法,其特征在于,包括:
基于环状单链DNA进行滚环扩增,以便获得所述DNA纳米球;
其中,利用具有胡斯坦面结构的物质和至少两条扩增引物进行所述滚环扩增,
所述具有胡斯坦面结构的物质选自下列中的至少一种:
三聚氰酸(Cyanuric Acid),三聚氰胺(Melamine),螺环亚氨基乙内酰脲(spiroiminodihydamoin),胍基乙内酰脲(Guanidinehydantoin),草尿酸(oxaluric acid)或恶唑酮(oxazolone)。
2.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于,在相同的滚环扩增时间内,相较于一条扩增引物,利用具有胡斯坦面结构的物质和至少两条扩增引物进行滚环扩增,所述DNA纳米球用于测序具有提高的测序质量。
3.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于,在相同的滚环扩增时间内,相较于一条扩增引物,利用具有胡斯坦面结构的物质和至少两条扩增引物进行滚环扩增,所述DNA纳米球的拷贝数至少增加了一倍。
4.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于,相较于一条扩增引物,利用具有胡斯坦面结构的物质和至少两条扩增引物进行滚环扩增,所述DNA纳米球用于测序具有降低的重复序列比例。
5.一种DNA纳米球,其特征在于,所述DNA纳米球中结合有具有胡斯坦面结构的物质;所述DNA纳米球通过权利要求1~4中任一项所述的制备方法获得。
6.一种芯片,其特征在于,所述芯片上固定有权利要求5所述的DNA纳米球。
7.根据权利要求6所述的芯片,其特征在于,所述DNA纳米球通过网状小孔或者六甲基二硅氮烷固定在所述芯片上。
8.一种基于DNA样本的测序方法,其特征在于,包括:
将所述DNA样本进行片段化处理,末端修复,以便获得经修复的DNA片段;
基于所述经修复的DNA片段,连接测序接头,进行环化处理,以便获得环状单链DNA;
基于所述环状单链DNA,根据权利要求1~4任一项所述的制备方法制备DNA纳米球;
将所述DNA纳米球固定到芯片上,测序,以便获得所述DNA样本的测序结果。
9.根据权利要求8所述的测序方法,其特征在于,所述DNA样本为全基因组DNA。
10.一种提高测序质量的方法,其特征在于,根据权利要求8或9所述的测序方法对DNA样本进行测序。
11.具有胡斯坦面结构的物质和至少两条扩增引物在制备DNA纳米球领域中的用途,其特征在于,所述具有胡斯坦面结构的物质选自下列中的至少一种:三聚氰酸(CyanuricAcid),三聚氰胺(Melamine),螺环亚氨基乙内酰脲(spiroiminodihydamoin),胍基乙内酰脲(Guanidinehydantoin),草尿酸(oxaluric acid)或恶唑酮(oxazolone)。
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