[发明专利]一种利用三重实时荧光定量RT-PCR检测寨卡病毒、基孔肯雅病毒和马雅罗病毒的方法有效
申请号: | 201910542087.8 | 申请日: | 2019-06-21 |
公开(公告)号: | CN110305985B | 公开(公告)日: | 2022-05-17 |
发明(设计)人: | 李建东;赖丽金;张全福;李阿茜;梁米芳;李德新;孙丽娜;王芹;尚翠;李川 | 申请(专利权)人: | 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 商秀玲 |
地址: | 102206 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 利用 三重 实时 荧光 定量 rt pcr 检测 病毒 基孔肯雅 马雅罗 方法 | ||
1.用于寨卡病毒、基孔肯雅病毒和马雅罗病毒的三重实时荧光定量RT-PCR检测的引物探针组合,其特征在于,由三对特异性引物和三条特异性探针组成,其中,所述特异性引物的序列如SEQ ID NO.1-6所示,所述特异性探针的序列如SEQ ID NO.7-9所示。
2.根据权利要求1所述的引物探针组合,其特征在于,所述特异性探针分别标记产生不同荧光色的荧光基团,所述荧光基团包括荧光报告基团和荧光猝灭基团;
所述荧光报告基团为选自FAM、HEX、Texas Red、CY5、TET、JOE、CY3、TAMRA、ROX、LCRED640、LC RED705中的任一种;所述荧光猝灭基团为选自BHQ1、BHQ2、BHQ3、Dabcyl中的任一种。
3.根据权利要求1或2所述的引物探针组合,其特征在于,序列如SEQ ID NO.7所示的特异性探针的5’端标记FAM荧光报告基团,3’端标记BHQ1荧光淬灭基团;序列如SEQ ID NO.8所示的特异性探针的5’端标记HEX荧光报告基团,3’端标记BHQ1荧光淬灭基团;序列如SEQID NO.9所示的特异性探针的5’端标记Texas Red荧光报告基团,3’端标记BHQ2荧光淬灭基团。
4.权利要求1~3任一项所述的引物探针组合在制备用于检测寨卡病毒、基孔肯雅病毒和马雅罗病毒的试剂盒中的应用。
5.一种用于寨卡病毒、基孔肯雅病毒和马雅罗病毒检测的试剂盒,其特征在于,包含权利要求1~3任一项所述的引物探针组合。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒在进行三重实时荧光定量RT-PCR检测时的反应程序为:50℃预变性30min;95℃变性10min;95℃退火10s,60℃延伸45s,45个循环。
7.根据权利要求5或6所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒在进行三重实时荧光定量RT-PCR检测时的25μL反应体系为:2×缓冲液12.5μL,20μmol/L上、下游特异性引物各0.25μL,20μmol/L特异性探针各0.125μL,25×RT-PCR逆转录酶和DNA聚合酶1μL,RNA模板5μL,用无RNA酶去离子水补至25μL。
8.一种非疾病诊断目的的利用三重实时荧光定量RT-PCR检测寨卡病毒、基孔肯雅病毒和马雅罗病毒方法,其特征在于,以待测样品的RNA为检测模板,利用如SEQ ID NO.1-6所示的特异性引物和如SEQ ID NO.7-9所示的特异性探针进行三重实时荧光定量RT-PCR,根据扩增曲线判断待测样品中是否含有寨卡病毒、基孔肯雅病毒和马雅罗病毒。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述三重实时荧光定量RT-PCR的反应程序为:50℃预变性30min;95℃变性10min;95℃退火10s,60℃延伸45s,45个循环;
所述三重实时荧光定量RT-PCR的25μL反应体系为:2×缓冲液12.5μL,20μmol/L上、下游特异性引物各0.25μL,20μmol/L特异性探针各0.125μL,25×RT-PCR逆转录酶和DNA聚合酶1μL,RNA模板5μL,RNase Free Water补足至25μL。
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