[发明专利]一种免疫组化病理图像CD3阳性细胞核分割方法及系统有效
申请号: | 201910517113.1 | 申请日: | 2019-06-14 |
公开(公告)号: | CN110415255B | 公开(公告)日: | 2021-08-20 |
发明(设计)人: | 刘再毅;梁长虹;覃杰;赵可;王瑛;陈鑫;黄燕琪;姚溯;李振辉 | 申请(专利权)人: | 广东省人民医院(广东省医学科学院) |
主分类号: | G06T7/11 | 分类号: | G06T7/11;G06T7/136;G06T7/194 |
代理公司: | 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 | 代理人: | 李斌 |
地址: | 510080 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 免疫 病理 图像 cd3 阳性 细胞核 分割 方法 系统 | ||
1.一种免疫组化病理图像CD3阳性细胞核分割方法,其特征在于,包括下述步骤:
S1:对免疫组化病理图像进行颜色反卷积,分离染色通道;
S2:将原始免疫组化病理图像从RGB颜色空间转换到Lab颜色空间,采用超像素分割成不规则像素块,所述不规则像素块进行kmeans聚类区分出图像背景,并将图像背景去除;
S3:基于形态学特征进行图像分割,得到初步分割好的细胞核第一区域图像L1以及待处理的第一图像C1;
S4:将待处理的第一图像C1进行局部阈值bernsen分割及形态学特征分割,得到分割好的细胞核第二区域图像L2和待处理的第二图像C2;
S5:将待处理的第二图像C2进行前景标记,并采用分水岭算法分割出细胞核第三区域图像L3;
S6:将细胞核第一区域图像L1、细胞核第二区域图像L2、细胞核第三区域图像L3与免疫组化病理图像原图进行掩膜处理,得到细胞核分割图像。
2.根据权利要求1所述的免疫组化病理图像CD3阳性细胞核分割方法,其特征在于,步骤S1中所述对免疫组化病理图像进行颜色反卷积,计算公式为:
C=M-1[y]
其中,C表示分离的H和DAB染色通道,M表示不同染色参数矩阵,参数矩阵的行分别表示H、曙红和DAB染色,参数矩阵的列表示RGB染色方案参数大小,y表示每一个像素的光密度。
3.根据权利要求1所述的免疫组化病理图像CD3阳性细胞核分割方法,其特征在于,步骤S2中所述不规则像素块进行kmeans聚类区分出图像背景,将不规则像素块的Lab颜色空间中L层作为kmeans聚类的对象,具体的计算公式如下所述:
其中,E表示最小平方误差,x表示每一个不规则像素块,u表示质心,g表示分类的簇,当E最小时则kmeans聚类完成。
4.根据权利要求1所述的免疫组化病理图像CD3阳性细胞核分割方法,其特征在于,步骤S3所述的基于形态学特征进行图像分割,具体步骤为:
S31:将去除背景后的图像与DAB染色通道进行掩膜处理,获得去除背景的DAB染色通道图像,并采用分水岭算法分割图像;
S32:提取经分水岭算法分割后的图像特征,去掉疑似灰尘的区域,保留细胞核第一区域图像L1和待处理的第一图像C1。
5.根据权利要求4所述的免疫组化病理图像CD3阳性细胞核分割方法,其特征在于,所述图像特征包括灰度均值,对比度,紧凑度和像素面积,所述疑似灰尘的区域设为对比度小于0.04或者灰度均值大于200的图像区域,所述细胞核第一区域图像L1设为40X放大倍数的像素面积小于2000且密度大于0.93的图像区域,所述待处理的第一图像C1设为40X放大倍数的像素面积大于2000的图像区域。
6.根据权利要求1所述的免疫组化病理图像CD3阳性细胞核分割方法,其特征在于,步骤S4所述将待处理的第一图像C1进行局部阈值bernsen分割及形态学特征分割,具体步骤为:
S41:局部阈值bernsen分割的活动窗口设为77*77像素大小,局部阈值bernsen分割后得到待处理第一图像C1的二值化图像,并与DAB染色通道进行掩膜,得到DAB染色通道的待处理第一图像C1细胞核区域图像,执行开运算后再进行分水岭分割;
S42:经过局部阈值和分水岭分割处理的图像,进行基于形态学特征的图像分割,提取图像特征,保留细胞核第二区域图像L2和待处理的第二图像C2。
7.根据权利要求6所述的免疫组化病理图像CD3阳性细胞核分割方法,其特征在于,所述细胞核第二区域图像L2设为40X放大倍数的像素面积小于2000且密度大于0.93的图像区域,所述待处理的第二图像C2设为40X放大倍数的像素面积大于2000的图像区域。
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