[发明专利]一种快速PCR扩增试剂盒及其应用方法在审
| 申请号: | 201910504468.7 | 申请日: | 2019-06-12 |
| 公开(公告)号: | CN110527711A | 公开(公告)日: | 2019-12-03 |
| 发明(设计)人: | 孙晓娇;张文平 | 申请(专利权)人: | 江苏莱尔生物医药科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686 |
| 代理公司: | 32270 南京科知维创知识产权代理有限责任公司 | 代理人: | 许益民<国际申请>=<国际公布>=<进入 |
| 地址: | 225700 江苏省泰州市泰州医*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 内参 试剂盒 内参基因引物 上游引物F 下游引物R 扩增 核苷酸序列 缓冲液体系 扩增试剂盒 一步法PCR 高级结构 快速PCR 微量DNA 长片段 错误率 热启动 增强剂 靶点 样本 应用 检测 资金 | ||
本发明提供一种快速PCR扩增试剂盒及其应用方法,所述试剂盒包括DNA聚合酶、dNTPs、内参基因引物群以及缓冲液体系;所述的内参基因引物群包括内参A片段和内参B片段,所述内参A片段包括上游引物F和下游引物R;所述内参B片段包括上游引物F和下游引物R。本发明的PCR扩增试剂盒及其应用方法,结合使用Phire热启动II DNA聚合酶,可实现更长片段靶点的扩增,且错误率较低;试剂盒中添加了PCR增强剂,能够打开核苷酸序列的高级结构;且试剂盒具有便捷、节省资金、提高效率的特点,一步法PCR检测,实现了微量DNA样本快速扩增。
技术领域
本发明涉及基因工程技术领域,尤其涉及一种快速PCR扩增试剂盒及其应用方法。
背景技术
PCR是聚合酶链式反应的简称,是一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术,其研究对生物学各个领域有着深刻的影响,与医、农业、生物工程等的关系十分密切,例如PCR技术涉及在农业上育种的新途径,涉及在医学上检测、治疗遗传疾病,涉及以基因工程为基础的新兴工业,涉及法医物证鉴定、亲子鉴定等。快速PCR包含核酸快速抽提和PCR扩增两部分,经典PCR扩增试剂盒包含PCR缓冲体系、dNTPs、DNA聚合酶等。现有的试剂盒为了配制PCR反应液,会将不同试剂进行反复冻融,每次称量琼脂糖配置凝胶,过程相对繁琐,同时浪费实验耗材。
当前,基因组DNA传统提取方法所提取出来的DNA常含有较多的蛋白残留、多糖的污染、酚类物质的污染(如DNA为褐色)是提取基因组DNA时常遇到的非常棘手的问题,而蛋白、多糖和酚类等杂质对后续的酶切、PCR反应等下游实验有较强的抑制作用。然而,对于极其微量DNA样本,由于PCR扩增反应敏感度低,很难捕捉到有效的DNA信息。对于微量的DNA样本,常规的PCR扩增方法的反应敏感度低是导致后续PCR扩增效果差的主要原因。例如,在法医侦检工作中,犯罪现场的法医学物证的鉴定和检出,对于及时有效地指证犯罪分子,打击犯罪起到至关重要的作用。犯罪现场中指纹、烟蒂、指甲等都含有微量的DNA信息,可为找出或指证犯罪嫌疑人提供科学依据。但由于犯罪现场的DNA残留甚微,采集到的痕迹法医物证DNA极其微量,常规PCR扩增方法的反应敏感度低,难以捕捉到有效DNA信息从而扩增效果较差,直接导致后续的DNA检出率低,STR分型失败,不能指认犯罪个体。
如何利用PCR技术手段,实现实时、便捷、快速监测微量样本基因变异,包括基因突变、缺失、融合等信息,用于临床辅助诊断、靶向用药方案的指导,具有显著的意义,特别是对于技术难点很高的如何实现超微量变异DNA的扩增上。
发明内容
本发明的目的是为了解决现有技术中存在的缺点,而提出的一种实现超微量变异DNA的扩增的快速PCR扩增试剂盒及其应用方法,可适用于基础科研、临床快速PCR扩增等用途。
为实现上述目的,本发明采用了如下技术方案:
一种快速PCR扩增试剂盒,其包括DNA聚合酶、dNTPs、内参基因引物群以及缓冲液体系;所述的内参基因引物群包括内参A片段和内参B片段,所述内参A片段包括上游引物F和下游引物R;所述内参B片段包括上游引物F和下游引物R;其中,所述内参A片段的所述上游引物F的核苷酸序列为SEQ ID NO:1,所述下游引物R的核苷酸序列为SEQ ID NO:2;所述内参B片段的所述上游引物F的核苷酸序列为SEQ ID NO:3,所述下游引物R的核苷酸序列为SEQ ID NO:4。
优选地,所述内参A片段大小为:200-300bp,所述内参B片段大小为:1000-1100bp。
再优选地,所述的快速PCR扩增试剂盒还包括PCR增强剂,所述的PCR增强剂包含DMSO、甘油、甲酰胺中的一种或两种。
再优选地,所述DMSO的工作浓度为1-10%(v/v),所述甘油的工作浓度为1-20%(v/v),所述甲酰胺的工作浓度为1-10%(v/v)。
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