[发明专利]甬优4949种子纯度检测的SSR引物及方法有效

专利信息
申请号: 201910491102.0 申请日: 2019-06-06
公开(公告)号: CN110093448B 公开(公告)日: 2022-11-04
发明(设计)人: 周元坤;李诗成;胡世平 申请(专利权)人: 武汉佳禾生物科技有限责任公司
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 武汉明正专利代理事务所(普通合伙) 42241 代理人: 江沣
地址: 430070 湖北省武汉市洪*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 甬优 4949 种子 纯度 检测 ssr 引物 方法
【权利要求书】:

1.甬优4949种子纯度检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

S1、提取待测甬优4949种子的DNA;

S2、以提取的DNA为模板,使用引物对RM72或引物对RM224进行PCR扩增,得

到扩增产物;

其中,引物对RM72包含:正向引物,其从5’端到3’为:CCGGCGATAAAACAATGAG,反向引物,其从5’端到3’为: GCATCGGTCCTAACTAAGGG ;

引物对RM224包含:正向引物,其从5’端到3’为:ATCGATCGATCTTCACGAGG,反向引物,其5’端到3’为:TGCTATAAAAGGCATTCGGG ;

S3、对S2中得到的扩增产物进行凝胶电泳检测;

S4、根据电泳分离出来的条带,只有同时具有亲本特异条带的单株才为真正的甬优

4949种子,其中,引物对RM72产生的母本特异性条带大小为180bp,产生的父本特异性条带大小为150bp,引物对RM224产生的母本特异性条带大小为120bp,产生的父本特异性条带大小为160bp。

2.如权利要求1所述的甬优4949种子纯度检测方法,其特征在于,S1中提取待测甬优4949种子的DNA具体包括:

A1、将待测种子置于离心管中,加入CTAB提取液,水浴;

A2、然后加入体积比为24:1的氯仿和异戊醇,混匀,离心,得到上清液,然后向上

清液中加入异丙醇,混匀,离心,得到沉淀,洗涤,干燥后使用含有RNA酶的双蒸水溶解,即得甬优4949种子的DNA。

3.如权利要求2所述的甬优4949种子纯度检测方法,其特征在于,水浴温度为56℃、时间为20~30 min;加入体积比为24:1的氯仿和异戊醇,混匀,于12000 rpm下离心10min;

向上清液中加入异丙醇,于-20℃下静置1 h,混匀,于4℃下以12000 rpm离心15 min,得到沉淀;使用体积分数为60~70%乙醇洗涤沉淀。

4.如权利要求1所述的甬优4949种子纯度检测方法,其特征在于,S2中PCR扩增反应体系,包括:1 µL的DNA、2 µL的Buffer缓冲液、1 µL的dNTP、1 µL的10 µM的SSR引物、0.4 Unit的Taq DNA聚合酶;

PCR扩增反应程序:95℃变性5 min;94℃变性30 s,56℃退火45 s,72℃延伸60 s,循环35次;72℃延伸5 min,4℃终止反应。

5.如权利要求2所述的甬优4949种子纯度检测方法,其特征在于,A1中CTAB提取液组成为:每1L提取液中含有15 g的CTAB、75 mL1M的 Tris-HCl、30 mLpH为 8.0的EDTA溶液、161.4 g 的NaCl;所述pH为 8.0的EDTA溶液的制备为:将EDTA溶于双蒸水中,并用NaOH调节pH至8.0。

6.如权利要求1所述的甬优4949种子纯度检测方法,其特征在于,S3中凝胶电泳检测具体为:将扩增产物6% 变性聚丙烯酰胺凝胶上于功率为140W下电泳1~1.5h,电泳结束后凝胶用蒸馏水冲洗,用0.2wt%的 AgNO3溶液染色15min,漂洗 10s,然后含有2wt%的NaOH、0.04wt%的Na2CO3、0.4wt% 的甲醛的水溶液,显影至带型清晰。

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