[发明专利]太湖流域地方品种猪各个品种及生肉制品的SNP标记组合和鉴定方法

权利要求书

1.一种基于SNP标记组合的太湖流域地方品种猪各个品种及生肉制品鉴定方法，太湖流域地方品种猪各个品种及生肉制品的SNP标记组合包括：pig6-94543329、pig8-125260555、pig15-156200455、pig11-44211123、pigx-43758743、pig3-5640069、pig2-921624、pig16-43433565、pig7-78405284、pig1-32329164、pig16-6489738、pig8-42369911、pig2-60239356、pig8-5778954、pig7-37079960、pig13-16955200、pig13-111071937、pig7-91759815、pig15-112416414、pig17-8986714、pig6-17954424、pig17-12719441、pig1-156032177、pig14-83975934、pig10-62388272、pig7-91520426、pig1-95570577、pig12-55221026、pig11-25257600、pig5-83074075、pig12-6044104、pig16-72138396、pig4-119045753、pig13-32829013、pig15-55926968、pig11-7097640、pig15-53346339、pig1-8851878、pig5-2060225、pig6-8539623、pig11-85315121、pigx-29045924、pig16-84191766、pig9-143610357、pig13-23117378、pig17-64542536位点，所述pig6-94543329表示猪6号染色体第94543329位位点，pig8-125260555表示猪8号染色体第125260555位位点，pig15-156200455表示猪15号染色体第156200455位位点，pig11-44211123表示猪11号染色体第44211123位位点，pigx-43758743表示猪x号染色体第43758743位位点，pig3-5640069表示猪3号染色体第5640069位位点，pig2-921624表示猪2号染色体第921624位位点，pig16-43433565表示猪16号染色体第43433565位位点，pig7-78405284表示猪7号染色体第78405284位位点，pig1-32329164表示猪1号染色体第32329164位位点，pig16-6489738表示猪16号染色体第6489738位位点，pig8-42369911表示猪8号染色体第42369911位位点，pig2-60239356表示猪2号染色体第60239356位位点，pig8-5778954表示猪8号染色体第5778954位位点，pig7-37079960表示猪7号染色体第37079960位位点，pig13-16955200表示猪13号染色体第16955200位位点，pig13-111071937表示猪13号染色体第111071937位位点，pig7-91759815表示猪7号染色体第91759815位位点，pig15-112416414表示猪15号染色体第112416414位位点，pig17-8986714表示猪17号染色体第8986714位位点，pig6-17954424表示猪6号染色体第17954424位位点，pig17-12719441表示猪17号染色体第12719441位位点，pig1-156032177表示猪1号染色体第156032177位位点，pig14-83975934表示猪14号染色体第83975934位位点，pig10-62388272表示猪10号染色体第62388272位位点，pig7-91520426表示猪7号染色体第91520426位位点，pig1-95570577表示猪1号染色体第95570577位位点，pig12-55221026表示猪12号染色体第55221026位位点，pig11-25257600表示猪11号染色体第25257600位位点，pig5-83074075表示猪5号染色体第83074075位位点，pig12-6044104表示猪12号染色体第6044104位位点，pig16-72138396表示猪16号染色体第72138396位位点，pig4-119045753表示猪4号染色体第119045753位位点，pig13-32829013表示猪13号染色体第32829013位位点，pig15-55926968表示猪15号染色体第55926968位位点，pig11-7097640表示猪11号染色体第7097640位位点，pig15-53346339表示猪15号染色体第53346339位位点，pig1-8851878表示猪1号染色体第8851878位位点，pig5-2060225表示猪5号染色体第2060225位位点，pig6-8539623表示猪6号染色体第8539623位位点，pig11-85315121表示猪11号染色体第85315121位位点，pigx-29045924表示猪x号染色体第29045924位位点，pig16-84191766表示猪16号染色体第84191766位位点，pig9-143610357表示猪9号染色体第143610357位位点，pig13-23117378表示猪13号染色体第23117378位位点，pig17-64542536位点表示猪17号染色体第64542536位位点，其特征在于，首先提取待鉴定的生猪肉或肉制品的基因组DNA，然后经PCR扩增后进行琼脂糖凝胶电泳和SNaPshot测序，得到SNP标记组合各个检测位点的信息，当SNP标记组合任意三个位点处出现特异突变，即可鉴定为太湖流域地方品种猪各个品种及其肉制品；

所述的PCR扩增，pig6-94543329处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.1～2所示，pig8-125260555处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.3～4所示，pig15-156200455处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.5～6所示，pig11-44211123处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.7～8所示，pigx-43758743处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.9～10所示，pig3-5640069处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.11～12所示，pig2-921624处的上下游引物的序列如SEQID NO.13～14所示，pig16-43433565处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.15～16所示，pig7-78405284处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.17～18所示，pig1-32329164处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.19～20所示，pig16-6489738处的上下游引物的序列如SEQ IDNO.21～22所示，pig8-42369911处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.23～24所示，pig2-60239356处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.25～26所示，pig8-5778954处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.27～28所示，pig7-37079960处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.29～30所示，pig13-16955200处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.31～32所示，pig13-111071937处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.33～34所示，pig7-91759815处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.35～36所示，pig15-112416414处的上下游引物的序列如SEQ IDNO.37～38所示，pig17-8986714处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.39～40所示，pig6-17954424处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.41～42所示，pig17-12719441处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.43～44所示，pig1-156032177处的上下游引物的序列如SEQ IDNO.45～46所示，pig14-83975934处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.47～48所示，pig10-62388272处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.49～50所示，pig7-91520426处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.51～52所示，pig1-95570577处的上下游引物的序列如SEQ IDNO.53～54所示，pig12-55221026处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.55～56所示，pig11-25257600处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.57～58所示，pig5-83074075处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.59～60所示，pig12-6044104处的上下游引物的序列如SEQ IDNO.61～62所示，pig16-72138396处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.63～64所示，pig4-119045753处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.65～66所示，pig13-32829013处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.67～68所示，Pig15-55926968处的上下游引物的序列如SEQ IDNO.69～70所示，pig11-7097640处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.71～72所示，pig15-53346339处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.73～74所示，pig1-8851878处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.75～76所示，pig5-2060225处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.77～78所示，pig6-8539623处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.79～80所示，pig11-85315121处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.81～82所示，pigx-29045924处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.83～84所示，pig16-84191766处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.85～86所示，pig9-143610357处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.87～88所示，pig13-23117378处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.89～90所示，pig17-64542536处的上下游引物的序列如SEQ ID NO.91～92所示；

SNaPshot测序引物及测序产物的鉴定位点对比信息如下表所示：

表中UEP代表测序引物，REF为参考基因型，ALT为突变基因型。